RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.71■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.7■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.7■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 TNRQ92752 1358 aa30.69■■■□□ 2.5
UBXN4-202ENST00000415164 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.68■■■□□ 2.5
UBXN4-202ENST00000415164 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.67■■■□□ 2.5
UBXN4-202ENST00000415164 ILDR2Q71H61 639 aa30.66■■■□□ 2.5
UBXN4-202ENST00000415164 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
UBXN4-202ENST00000415164 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.62■■■□□ 2.49
UBXN4-202ENST00000415164 PZPP20742 1482 aa30.62■■■□□ 2.49
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.62■■■□□ 2.49
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.61■■■□□ 2.49
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.59■■■□□ 2.49
UBXN4-202ENST00000415164 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.55■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.53■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 MIA2Q96PC5 1412 aa30.53■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
UBXN4-202ENST00000415164 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
UBXN4-202ENST00000415164 PIP4K2BP78356 416 aa30.49■■■□□ 2.47
UBXN4-202ENST00000415164 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.49■■■□□ 2.47
UBXN4-202ENST00000415164 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.49■■■□□ 2.47
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP1Q9C000 1473 aa30.48■■■□□ 2.47
UBXN4-202ENST00000415164 SOCS7O14512 581 aa30.46■■■□□ 2.47
UBXN4-202ENST00000415164 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.45■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.44■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.44■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC3O15438 1527 aa30.43■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 CPS1P31327 1500 aa30.42■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 TOM1O60784 492 aa30.4■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 APLP2Q06481 763 aa30.39■■■□□ 2.46
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K1Q13233 1512 aa30.37■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 ERVK-7P63135 1459 aa30.36■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 HSPA1LP34931 641 aa30.35■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.34■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.453e-7■■■□□ 15.7
UBXN4-202ENST00000415164 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.32■■■□□ 2.45
UBXN4-202ENST00000415164 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 KIF15Q9NS87 1388 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 CEP152O94986 1710 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.31■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 MED14O60244 1454 aa30.31■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 DEPDC5O75140 1603 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 IQGAP1P46940 1657 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC5O15440 1437 aa30.25■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.24■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.24■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 ERBINQ96RT1 1412 aa30.22■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.2■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.2■■■□□ 2.43
UBXN4-202ENST00000415164 DAPK1P53355 1430 aa30.2■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.2■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 KANK1Q14678 1352 aa30.19■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.19■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 LTKP29376 864 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 EID1Q9Y6B2 187 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.14■■■□□ 2.42
UBXN4-202ENST00000415164 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.13■■■□□ 2.41
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.13■■■□□ 2.41
UBXN4-202ENST00000415164 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
UBXN4-202ENST00000415164 SYNMO15061 1565 aa30.1■■■□□ 2.41
UBXN4-202ENST00000415164 ALKQ9UM73 1620 aa30.1■■■□□ 2.41
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.08■■■□□ 2.41
UBXN4-202ENST00000415164 SLIT1O75093 1534 aa30.07■■■□□ 2.4
UBXN4-202ENST00000415164 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
UBXN4-202ENST00000415164 PIK3C2BO00750 1634 aa30.07■■■□□ 2.4
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.03■■■□□ 2.4
UBXN4-202ENST00000415164 IDI1Q13907 227 aa30.02■■■□□ 2.4
UBXN4-202ENST00000415164 BCANQ96GW7 911 aa29.99■■■□□ 2.39
UBXN4-202ENST00000415164 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.99■■■□□ 2.39
UBXN4-202ENST00000415164 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.97■■■□□ 2.39
UBXN4-202ENST00000415164 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.96■■■□□ 2.39
UBXN4-202ENST00000415164 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM94Q12767 1356 aa29.9■■■□□ 2.38
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRL2O95490 1459 aa29.89■■■□□ 2.38
UBXN4-202ENST00000415164 NOS1P29475 1434 aa29.88■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRB3O60242 1522 aa29.88■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 KCNA6P17658 529 aa29.88■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.88■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.87■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
UBXN4-202ENST00000415164 TET3O43151 1660 aa29.79■■■□□ 2.36
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