RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
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TNFRSF25-201ENST00000348333 NCOA1Q15788 1441 aa35.62■■■■□ 3.29
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.62■■■■□ 3.29
TNFRSF25-201ENST00000348333 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.61■■■■□ 3.29
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.57■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 PZPP20742 1482 aa35.56■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP152O94986 1710 aa35.56■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 DAPK1P53355 1430 aa35.56■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.55■■■■□ 3.28
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TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.54■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABCC3O15438 1527 aa35.53■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPRTO14522 1441 aa35.53■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.51■■■■□ 3.28
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIF15Q9NS87 1388 aa35.49■■■■□ 3.27
TNFRSF25-201ENST00000348333 CERKQ8TCT0 537 aa35.48■■■■□ 3.27
TNFRSF25-201ENST00000348333 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.48■■■■□ 3.27
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNRQ92752 1358 aa35.47■■■■□ 3.27
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.46■■■■□ 3.27
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PLA2R1Q13018 1463 aa35.44■■■■□ 3.26
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ERBINQ96RT1 1412 aa35.4■■■■□ 3.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.39■■■■□ 3.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.39■■■■□ 3.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.37■■■■□ 3.25
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERVK-7P63135 1459 aa35.33■■■■□ 3.25
TNFRSF25-201ENST00000348333 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.32■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLRP1Q9C000 1473 aa35.3■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.3■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADGRL2O95490 1459 aa35.29■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 PKD2Q13563 968 aa35.28■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.28■■■■□ 3.24
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.22■■■■□ 3.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.2■■■■□ 3.23
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.17■■■■□ 3.22
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.14■■■■□ 3.22
TNFRSF25-201ENST00000348333 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.09■■■■□ 3.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.09■■■■□ 3.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.09■■■■□ 3.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 IQGAP1P46940 1657 aa35.08■■■■□ 3.21
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TNFRSF25-201ENST00000348333 MED14O60244 1454 aa35.05■■■■□ 3.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNC13BO14795 1591 aa35.03■■■■□ 3.2
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.97■■■■□ 3.19
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TNFRSF25-201ENST00000348333 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.96■■■■□ 3.19
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGAEP38570 1179 aa34.96■■■■□ 3.19
TNFRSF25-201ENST00000348333 ROCK1Q13464 1354 aa34.95■■■■□ 3.19
TNFRSF25-201ENST00000348333 NOS1P29475 1434 aa34.95■■■■□ 3.19
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TNFRSF25-201ENST00000348333 E9PCH4 1651 aa34.89■■■■□ 3.18
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.7■■■■□ 3.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUP155O75694 1391 aa34.7■■■■□ 3.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFYVE9O95405 1425 aa34.64■■■■□ 3.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.62■■■■□ 3.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 NAIPQ13075 1403 aa34.61■■■■□ 3.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIP4K2BP78356 416 aa34.6■■■■□ 3.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
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