RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.79■■■■□ 3.32
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CLTB-202ENST00000345807 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.76■■■■□ 3.31
CLTB-202ENST00000345807 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.76■■■■□ 3.31
CLTB-202ENST00000345807 PLA2R1Q13018 1463 aa35.75■■■■□ 3.31
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CLTB-202ENST00000345807 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.72■■■■□ 3.31
CLTB-202ENST00000345807 PZPP20742 1482 aa35.72■■■■□ 3.31
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CLTB-202ENST00000345807 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
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CLTB-202ENST00000345807 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
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CLTB-202ENST00000345807 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.54■■■■□ 3.28
CLTB-202ENST00000345807 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.53■■■■□ 3.28
CLTB-202ENST00000345807 NLRP1Q9C000 1473 aa35.53■■■■□ 3.28
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CLTB-202ENST00000345807 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
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CLTB-202ENST00000345807 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.47■■■■□ 3.27
CLTB-202ENST00000345807 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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CLTB-202ENST00000345807 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
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CLTB-202ENST00000345807 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.72■■■■□ 3.15
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