RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.71■■■□□ 2.19
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.195e-6■■□□□ 13.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.7■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FKBP8Q14318 412 aa28.68■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.68■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP10AO60312 1499 aa28.68■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.67■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.66■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.65■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.65■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 A2MP01023 1474 aa28.65■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 E9PCH4 1651 aa28.64■■■□□ 2.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.64■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.63■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.62■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 LAMC1P11047 1609 aa28.62■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 MRS2Q9HD23 443 aa28.6■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.6■■■□□ 2.17
KCNQ1-202ENST00000335475 DEPDC5O75140 1603 aa28.57■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 NEFLP07196 543 aa28.57■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.57■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 BCANQ96GW7 911 aa28.56■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.55■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.5■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.5■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 FANCAO15360 1455 aa28.49■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP7AQ04656 1500 aa28.49■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.48■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 RGL3Q3MIN7 710 aa28.47■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPM2O94759 1503 aa28.47■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.46■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 AFAP1Q8N556 730 aa28.45■■■□□ 2.15
KCNQ1-202ENST00000335475 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.45■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 TET3O43151 1660 aa28.45■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP152O94986 1710 aa28.45■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 MYT1Q01538 1121 aa28.43■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.43■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.43■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 ASXL2Q76L83 1435 aa28.41■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 MADDQ8WXG6 1647 aa28.41■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRTO14522 1441 aa28.4■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 CLTCL1P53675 1640 aa28.39■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRL1O94910 1474 aa28.39■■■□□ 2.14
KCNQ1-202ENST00000335475 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.38■■■□□ 2.13
KCNQ1-202ENST00000335475 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
KCNQ1-202ENST00000335475 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.34■■■□□ 2.13
KCNQ1-202ENST00000335475 IQGAP1P46940 1657 aa28.33■■■□□ 2.13
KCNQ1-202ENST00000335475 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.32■■■□□ 2.12
KCNQ1-202ENST00000335475 TESK2Q96S53 571 aa28.32■■■□□ 2.12
KCNQ1-202ENST00000335475 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.3■■■□□ 2.12
KCNQ1-202ENST00000335475 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
KCNQ1-202ENST00000335475 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.29■■■□□ 2.12
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KCNQ1-202ENST00000335475 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1-202ENST00000335475 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1-202ENST00000335475 RALBP1Q15311 655 aa28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.25■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 KANK1Q14678 1352 aa28.24■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.22■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.2■■■□□ 2.11
KCNQ1-202ENST00000335475 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 TMC1Q8TDI8 760 aa28.19■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF3BO15066 747 aa28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 STAC3Q96MF2 364 aa28.16■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 IFT172Q9UG01 1749 aa28.16■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.15■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 OSCARQ8IYS5 282 aa28.15■■■□□ 2.1
KCNQ1-202ENST00000335475 TMF1P82094 1093 aa28.14■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF1BO60333 1816 aa28.14■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.13■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.13■■■□□ 2.09
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KCNQ1-202ENST00000335475 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.12■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.12■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 MYOM2P54296 1465 aa28.12■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP13Q86W25 1043 aa28.11■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 NUDCQ9Y266 331 aa28.11■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCA6Q8N139 1617 aa28.1■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.09■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 CD109Q6YHK3 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.08■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.08■■■□□ 2.09
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNMO15061 1565 aa28.07■■■□□ 2.08
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