RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301272.6

TMIGD2-201, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIGD2, Length 1,262 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2-201ENST00000301272 KIF15Q9NS87 1388 aa29.48■■■□□ 2.31
TMIGD2-201ENST00000301272 KIF3BO15066 747 aa29.47■■■□□ 2.31
TMIGD2-201ENST00000301272 ZMYM3Q14202 1370 aa29.47■■■□□ 2.31
TMIGD2-201ENST00000301272 NCOA1Q15788 1441 aa29.46■■■□□ 2.31
TMIGD2-201ENST00000301272 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.45■■■□□ 2.31
TMIGD2-201ENST00000301272 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.45■■■□□ 2.31
TMIGD2-201ENST00000301272 DEPDC5O75140 1603 aa29.44■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 ERBINQ96RT1 1412 aa29.43■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 NPATQ14207 1427 aa29.41■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 ABCC3O15438 1527 aa29.4■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TMIGD2-201ENST00000301272 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.38■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.38■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 CEP152O94986 1710 aa29.37■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.37■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.34■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 HSPA2P54652 639 aa29.34■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 PZPP20742 1482 aa29.34■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.33■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.33■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
TMIGD2-201ENST00000301272 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.31■■■□□ 2.28
TMIGD2-201ENST00000301272 STRCQ7RTU9 1775 aa29.29■■■□□ 2.28
TMIGD2-201ENST00000301272 ROCK1Q13464 1354 aa29.27■■■□□ 2.28
TMIGD2-201ENST00000301272 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.26■■■□□ 2.27
TMIGD2-201ENST00000301272 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.23■■■□□ 2.27
TMIGD2-201ENST00000301272 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TMIGD2-201ENST00000301272 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.23■■■□□ 2.27
TMIGD2-201ENST00000301272 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TMIGD2-201ENST00000301272 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.23■■■□□ 2.27
TMIGD2-201ENST00000301272 UNC13BO14795 1591 aa29.2■■■□□ 2.26
TMIGD2-201ENST00000301272 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.19■■■□□ 2.26
TMIGD2-201ENST00000301272 ERVK-7P63135 1459 aa29.17■■■□□ 2.26
TMIGD2-201ENST00000301272 TNRQ92752 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
TMIGD2-201ENST00000301272 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
TMIGD2-201ENST00000301272 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.15■■■□□ 2.26
TMIGD2-201ENST00000301272 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.13■■■□□ 2.25
TMIGD2-201ENST00000301272 ITGAEP38570 1179 aa29.1■■■□□ 2.25
TMIGD2-201ENST00000301272 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.09■■■□□ 2.25
TMIGD2-201ENST00000301272 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
TMIGD2-201ENST00000301272 TET3O43151 1660 aa29.07■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 PLA2R1Q13018 1463 aa29.07■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 NLRP1Q9C000 1473 aa29.07■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.06■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 NAIPQ13075 1403 aa29.05■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 SYNMO15061 1565 aa29.05■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 KANK1Q14678 1352 aa29.04■■■□□ 2.24
TMIGD2-201ENST00000301272 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.01■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 NOS1P29475 1434 aa29.01■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 FBXO41Q8TF61 875 aa29■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 E9PCH4 1651 aa28.99■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 PTPRTO14522 1441 aa28.99■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.99■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.99■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 HFM1A2PYH4 1435 aa28.97■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 PIK3C2BO00750 1634 aa28.96■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TMIGD2-201ENST00000301272 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.92■■■□□ 2.22
TMIGD2-201ENST00000301272 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TMIGD2-201ENST00000301272 NUP155O75694 1391 aa28.88■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.87■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 SLIT1O75093 1534 aa28.85■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.85■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 PKD2Q13563 968 aa28.85■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.84■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 MED14O60244 1454 aa28.84■■■□□ 2.21
TMIGD2-201ENST00000301272 IDI1Q13907 227 aa28.82■■■□□ 2.2
TMIGD2-201ENST00000301272 ADGRB3O60242 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
TMIGD2-201ENST00000301272 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.81■■■□□ 2.2
TMIGD2-201ENST00000301272 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
TMIGD2-201ENST00000301272 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.77■■■□□ 2.2
TMIGD2-201ENST00000301272 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.77■■■□□ 2.2
TMIGD2-201ENST00000301272 IQGAP1P46940 1657 aa28.76■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.72■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.72■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 LTKP29376 864 aa28.71■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.71■■■□□ 2.19
TMIGD2-201ENST00000301272 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TMIGD2-201ENST00000301272 ZFYVE9O95405 1425 aa28.68■■■□□ 2.18
TMIGD2-201ENST00000301272 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.67■■■□□ 2.18
TMIGD2-201ENST00000301272 TRPM2O94759 1503 aa28.66■■■□□ 2.18
TMIGD2-201ENST00000301272 CLTCL1P53675 1640 aa28.65■■■□□ 2.18
TMIGD2-201ENST00000301272 CERKQ8TCT0 537 aa28.65■■■□□ 2.18
TMIGD2-201ENST00000301272 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.61■■■□□ 2.17
TMIGD2-201ENST00000301272 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.58■■■□□ 2.17
TMIGD2-201ENST00000301272 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.56■■■□□ 2.16
TMIGD2-201ENST00000301272 TRIM52Q96A61 297 aa28.55■■■□□ 2.16
TMIGD2-201ENST00000301272 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.54■■■□□ 2.16
TMIGD2-201ENST00000301272 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.54■■■□□ 2.16
TMIGD2-201ENST00000301272 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.54■■■□□ 2.16
TMIGD2-201ENST00000301272 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
TMIGD2-201ENST00000301272 CPS1P31327 1500 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms