RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 PLA2R1Q13018 1463 aa26.53■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.53■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.52■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.51■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 PKD2Q13563 968 aa26.5■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 TNRQ92752 1358 aa26.48■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 MAP3K1Q13233 1512 aa26.47■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 PZPP20742 1482 aa26.47■■□□□ 1.83
TNNT1-201ENST00000291901 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.45■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.45■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.44■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 MIA2Q96PC5 1412 aa26.4■■□□□ 1.82
TNNT1-201ENST00000291901 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.37■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 CEP152O94986 1710 aa26.36■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.811e-10■■■■□ 24.7
TNNT1-201ENST00000291901 ABCC3O15438 1527 aa26.36■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.35■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 APLP2Q06481 763 aa26.35■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.34■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.34■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.33■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 NLRP1Q9C000 1473 aa26.33■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.33■■□□□ 1.81
TNNT1-201ENST00000291901 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.32■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.31■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.31■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.28■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.28■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 ABCC5O15440 1437 aa26.27■■□□□ 1.8
TNNT1-201ENST00000291901 ERVK-7P63135 1459 aa26.26■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 KIF15Q9NS87 1388 aa26.26■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.24■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 ILDR2Q71H61 639 aa26.24■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 DEPDC5O75140 1603 aa26.23■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 IQGAP1P46940 1657 aa26.22■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.792e-8■■□□□ 13.8
TNNT1-201ENST00000291901 DAPK1P53355 1430 aa26.22■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.21■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.21■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 CPS1P31327 1500 aa26.2■■□□□ 1.79
TNNT1-201ENST00000291901 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.2■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.19■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 MED14O60244 1454 aa26.19■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 ERBINQ96RT1 1412 aa26.18■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 PIP4K2BP78356 416 aa26.17■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.15■■□□□ 1.78
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.1■■□□□ 1.77
TNNT1-201ENST00000291901 TOM1O60784 492 aa26.1■■□□□ 1.77
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.1■■□□□ 1.77
TNNT1-201ENST00000291901 KANK1Q14678 1352 aa26.09■■□□□ 1.77
TNNT1-201ENST00000291901 PIK3C2BO00750 1634 aa26.09■■□□□ 1.77
TNNT1-201ENST00000291901 HSPA1LP34931 641 aa26.07■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 LTKP29376 864 aa26.06■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.05■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 SLIT1O75093 1534 aa26.03■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.02■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.02■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.02■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 ALKQ9UM73 1620 aa26.02■■□□□ 1.76
TNNT1-201ENST00000291901 SOCS7O14512 581 aa26.01■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 SYNMO15061 1565 aa25.99■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.99■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 EID1Q9Y6B2 187 aa25.99■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 ADGRL2O95490 1459 aa25.98■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 IDI1Q13907 227 aa25.97■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.96■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.95■■□□□ 1.75
TNNT1-201ENST00000291901 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TNNT1-201ENST00000291901 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.92■■□□□ 1.74
TNNT1-201ENST00000291901 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TNNT1-201ENST00000291901 NOS1P29475 1434 aa25.89■■□□□ 1.74
TNNT1-201ENST00000291901 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.88■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 ADGRB3O60242 1522 aa25.87■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.86■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 TET3O43151 1660 aa25.85■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 BCANQ96GW7 911 aa25.83■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.83■■□□□ 1.73
TNNT1-201ENST00000291901 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.82■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 UNC13BO14795 1591 aa25.8■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 ITGAEP38570 1179 aa25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms