RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.95■■■■■ 4.31
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TNNT1-201ENST00000291901 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.65■■■■□ 3.62
TNNT1-201ENST00000291901 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.83■■■■□ 3.33
TNNT1-201ENST00000291901 NACADO15069 1562 aa35.55■■■■□ 3.28
TNNT1-201ENST00000291901 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.55■■■■□ 3.28
TNNT1-201ENST00000291901 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.34■■■■□ 3.25
TNNT1-201ENST00000291901 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.15■■■■□ 3.22
TNNT1-201ENST00000291901 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.12■■■■□ 3.21
TNNT1-201ENST00000291901 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.99■■■■□ 3.19
TNNT1-201ENST00000291901 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.81■■■■□ 3.16
TNNT1-201ENST00000291901 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
TNNT1-201ENST00000291901 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.58■■■■□ 3.13
TNNT1-201ENST00000291901 SCRIBQ14160 1630 aa34.4■■■■□ 3.1
TNNT1-201ENST00000291901 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.2■■■■□ 3.06
TNNT1-201ENST00000291901 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.04■■■■□ 3.04
TNNT1-201ENST00000291901 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
TNNT1-201ENST00000291901 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.91■■■■□ 3.02
TNNT1-201ENST00000291901 NCAPD3P42695 1498 aa32.8■■■□□ 2.84
TNNT1-201ENST00000291901 SMARCA4P51532 1647 aa32.76■■■□□ 2.83
TNNT1-201ENST00000291901 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.74■■■□□ 2.83
TNNT1-201ENST00000291901 SMARCA2P51531 1590 aa32.65■■■□□ 2.82
TNNT1-201ENST00000291901 HMGXB3Q12766 1538 aa32.57■■■□□ 2.8
TNNT1-201ENST00000291901 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
TNNT1-201ENST00000291901 ERCC6Q03468 1493 aa32.53■■■□□ 2.8
TNNT1-201ENST00000291901 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
TNNT1-201ENST00000291901 NESP48681 1621 aa32.4■■■□□ 2.78
TNNT1-201ENST00000291901 CUX2O14529 1486 aa32.38■■■□□ 2.77
TNNT1-201ENST00000291901 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.38■■■□□ 2.77
TNNT1-201ENST00000291901 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.37■■■□□ 2.77
TNNT1-201ENST00000291901 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.36■■■□□ 2.77
TNNT1-201ENST00000291901 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.1■■■□□ 2.73
TNNT1-201ENST00000291901 WIZO95785 1651 aa32.04■■■□□ 2.72
TNNT1-201ENST00000291901 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
TNNT1-201ENST00000291901 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.02■■■□□ 2.72
TNNT1-201ENST00000291901 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.89■■■□□ 2.7
TNNT1-201ENST00000291901 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.82■■■□□ 2.69
TNNT1-201ENST00000291901 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
TNNT1-201ENST00000291901 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.65■■■□□ 2.66
TNNT1-201ENST00000291901 WDR62O43379 1518 aa31.56■■■□□ 2.64
TNNT1-201ENST00000291901 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
TNNT1-201ENST00000291901 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.53■■■□□ 2.64
TNNT1-201ENST00000291901 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.51■■■□□ 2.63
TNNT1-201ENST00000291901 CFTRP13569 1480 aa31.46■■■□□ 2.63
TNNT1-201ENST00000291901 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
TNNT1-201ENST00000291901 PRDM2Q13029 1718 aa31.26■■■□□ 2.59
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.21■■■□□ 2.59
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM41Q8WV44 630 aa31.08■■■□□ 2.57
TNNT1-201ENST00000291901 OSCARQ8IYS5 282 aa30.96■■■□□ 2.55
TNNT1-201ENST00000291901 TOPBP1Q92547 1522 aa30.92■■■□□ 2.54
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
TNNT1-201ENST00000291901 IFT140Q96RY7 1462 aa30.88■■■□□ 2.53
TNNT1-201ENST00000291901 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.8■■■□□ 2.52
TNNT1-201ENST00000291901 ABCC8Q09428 1581 aa30.79■■■□□ 2.52
TNNT1-201ENST00000291901 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TNNT1-201ENST00000291901 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
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TNNT1-201ENST00000291901 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.61■■■□□ 2.49
TNNT1-201ENST00000291901 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.61■■■□□ 2.49
TNNT1-201ENST00000291901 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
TNNT1-201ENST00000291901 CHD1O14646 1710 aa30.56■■■□□ 2.48
TNNT1-201ENST00000291901 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.53■■■□□ 2.48
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGEF11O15085 1522 aa30.47■■■□□ 2.47
TNNT1-201ENST00000291901 SOGA1O94964 1423 aa30.47■■■□□ 2.47
TNNT1-201ENST00000291901 FBLN2P98095 1184 aa30.46■■■□□ 2.47
TNNT1-201ENST00000291901 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TNNT1-201ENST00000291901 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.43■■■□□ 2.46
TNNT1-201ENST00000291901 CUX1P39880 1505 aa30.41■■■□□ 2.46
TNNT1-201ENST00000291901 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
TNNT1-201ENST00000291901 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.29■■■□□ 2.44
TNNT1-201ENST00000291901 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.29■■■□□ 2.44
TNNT1-201ENST00000291901 WDR97A6NE52 1622 aa30.25■■■□□ 2.43
TNNT1-201ENST00000291901 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TNNT1-201ENST00000291901 GRIN2BQ13224 1484 aa30.17■■■□□ 2.42
TNNT1-201ENST00000291901 ARAP1Q96P48 1450 aa30.17■■■□□ 2.42
TNNT1-201ENST00000291901 PBRM1Q86U86 1689 aa30.15■■■□□ 2.42
TNNT1-201ENST00000291901 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TNNT1-201ENST00000291901 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.1■■■□□ 2.41
TNNT1-201ENST00000291901 SYNJ1O43426 1573 aa30.1■■■□□ 2.41
TNNT1-201ENST00000291901 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.09■■■□□ 2.41
TNNT1-201ENST00000291901 SYNJ2O15056 1496 aa30.07■■■□□ 2.4
TNNT1-201ENST00000291901 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.03■■■□□ 2.4
TNNT1-201ENST00000291901 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.03■■■□□ 2.4
TNNT1-201ENST00000291901 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
TNNT1-201ENST00000291901 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.93■■■□□ 2.38
TNNT1-201ENST00000291901 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
TNNT1-201ENST00000291901 TOP2BQ02880 1626 aa29.91■■■□□ 2.38
TNNT1-201ENST00000291901 ADAMTS12P58397 1594 aa29.8■■■□□ 2.36
TNNT1-201ENST00000291901 GRIN2AQ12879 1464 aa29.8■■■□□ 2.36
TNNT1-201ENST00000291901 CEP170Q5SW79 1584 aa29.73■■■□□ 2.35
TNNT1-201ENST00000291901 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.71■■■□□ 2.35
TNNT1-201ENST00000291901 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.68■■■□□ 2.34
TNNT1-201ENST00000291901 NUP160Q12769 1436 aa29.66■■■□□ 2.34
TNNT1-201ENST00000291901 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.66■■■□□ 2.34
TNNT1-201ENST00000291901 SHROOM2Q13796 1616 aa29.57■■■□□ 2.32
TNNT1-201ENST00000291901 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TNNT1-201ENST00000291901 JPH4Q96JJ6 628 aa29.4■■■□□ 2.3
TNNT1-201ENST00000291901 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.39■■■□□ 2.3
TNNT1-201ENST00000291901 KIF27Q86VH2 1401 aa29.3■■■□□ 2.28
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