RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.66■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 MBD5Q9P267 1494 aa29.65■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa29.65■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 TSPOAP1O95153 1857 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 GLI2P10070 1586 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 PZPP20742 1482 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHG5O94827 1062 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 ABCC1P33527 1531 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX1-201ENST00000265340 TSPY4P0CV99 314 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 TSPY10P0CW01 314 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 ADGRL1O94910 1474 aa29.56■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 AFAP1Q8N556 730 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX1-201ENST00000265340 KIF15Q9NS87 1388 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 NEFMP07197 916 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.46■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 ZMYND15Q9H091 742 aa29.46■■■□□ 2.31
PITX1-201ENST00000265340 RAPGEF3O95398 923 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 PKD2Q13563 968 aa29.43■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 NEO1Q92859 1461 aa29.43■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 NUP155O75694 1391 aa29.42■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PITX1-201ENST00000265340 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.35■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.35■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.34■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 GSE1Q14687 1217 aa29.33■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.33■■■□□ 2.29
PITX1-201ENST00000265340 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.32■■■□□ 2.28
PITX1-201ENST00000265340 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.29■■■□□ 2.28
PITX1-201ENST00000265340 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PITX1-201ENST00000265340 ATP7AQ04656 1500 aa29.27■■■□□ 2.28
PITX1-201ENST00000265340 PLXNC1O60486 1568 aa29.26■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 RICTORQ6R327 1708 aa29.24■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 KDM5CP41229 1560 aa29.23■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.23■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.22■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.22■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.22■■■□□ 2.27
PITX1-201ENST00000265340 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 UNC13BO14795 1591 aa29.19■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.18■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.16■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.16■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.15■■■□□ 2.26
PITX1-201ENST00000265340 ABCA6Q8N139 1617 aa29.1■■■□□ 2.25
PITX1-201ENST00000265340 ERBINQ96RT1 1412 aa29.1■■■□□ 2.25
PITX1-201ENST00000265340 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PITX1-201ENST00000265340 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.08■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 KIF3BO15066 747 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 PLA2R1Q13018 1463 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 A2MP01023 1474 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-201ENST00000265340 RRP9O43818 475 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.97■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 CCDC7Q96M83 1385 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.95■■■□□ 2.23
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 NFKBIBQ15653 356 aa28.95■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 GGT6Q6P531 493 aa28.95■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms