RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 ILDR2Q71H61 639 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-201ENST00000219302 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 TSPY4P0CV99 314 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 TSPY10P0CW01 314 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 TNRQ92752 1358 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 PZPP20742 1482 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-201ENST00000219302 MIA2Q96PC5 1412 aa25.07■■□□□ 1.6
NME3-201ENST00000219302 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NME3-201ENST00000219302 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NME3-201ENST00000219302 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.02■■□□□ 1.6
NME3-201ENST00000219302 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.01■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 SOCS7O14512 581 aa25■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 NLRP1Q9C000 1473 aa25■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 MAP3K1Q13233 1512 aa24.99■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.99■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.99■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.96■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NME3-201ENST00000219302 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.95■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.95■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 ABCC3O15438 1527 aa24.94■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 MED14O60244 1454 aa24.94■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 CPS1P31327 1500 aa24.93■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 TOM1O60784 492 aa24.9■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.89■■□□□ 1.58
NME3-201ENST00000219302 DEPDC5O75140 1603 aa24.89■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.89■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 ERVK-7P63135 1459 aa24.88■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 HSPA1LP34931 641 aa24.86■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 PIP4K2BP78356 416 aa24.85■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.85■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 ABCC5O15440 1437 aa24.83■■□□□ 1.57
NME3-201ENST00000219302 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.81■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 KIF15Q9NS87 1388 aa24.8■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 IQGAP1P46940 1657 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 CEP152O94986 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 ALKQ9UM73 1620 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 LTKP29376 864 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 ERBINQ96RT1 1412 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-201ENST00000219302 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 APLP2Q06481 763 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 DAPK1P53355 1430 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 SLIT1O75093 1534 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.7■■□□□ 1.55
NME3-201ENST00000219302 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.7■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.68■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 EID1Q9Y6B2 187 aa24.66■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 KANK1Q14678 1352 aa24.66■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.66■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 IDI1Q13907 227 aa24.65■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.65■■□□□ 1.54
NME3-201ENST00000219302 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.63■■□□□ 1.53
NME3-201ENST00000219302 SYNMO15061 1565 aa24.63■■□□□ 1.53
NME3-201ENST00000219302 PIK3C2BO00750 1634 aa24.61■■□□□ 1.53
NME3-201ENST00000219302 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.6■■□□□ 1.53
NME3-201ENST00000219302 NOS1P29475 1434 aa24.57■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 ADGRL2O95490 1459 aa24.55■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.55■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 KCNA6P17658 529 aa24.53■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.53■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 TET3O43151 1660 aa24.52■■□□□ 1.52
NME3-201ENST00000219302 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.51■■□□□ 1.51
NME3-201ENST00000219302 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NME3-201ENST00000219302 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
NME3-201ENST00000219302 TMEM94Q12767 1356 aa24.48■■□□□ 1.51
NME3-201ENST00000219302 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.48■■□□□ 1.51
NME3-201ENST00000219302 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.48■■□□□ 1.51
NME3-201ENST00000219302 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
NME3-201ENST00000219302 ADGRB3O60242 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
NME3-201ENST00000219302 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
NME3-201ENST00000219302 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NME3-201ENST00000219302 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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