RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	KXD1	P53158	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM20	YOL076W	DMA1	P38823	416 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM20	YOL076W	TBF1	Q02457	562 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM20	YOL076W	TEA1	P47988	759 aa		4.34	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	CDC4	P07834	779 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	RGR1	P19263	1082 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	IES2	P40154	320 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	SRC1	Q03707	834 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	KEX2	P13134	814 aa		4.32	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	RTF1	P53064	558 aa		4.32	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	ATF2	P53296	535 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	HED1	Q03937	162 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	YNL115C	P53925	644 aa		4.29	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	SRF1	Q12516	437 aa		4.29	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	LAM6	Q08001	693 aa		4.29	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	BDP1	P46678	594 aa		4.28	□□□□□ -1.72
MDM20	YOL076W	KIP2	P28743	706 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	CST6	P40535	587 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	DSF2	P38213	736 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	SLY41	P22215	453 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	SDH2	P21801	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	ALR1	Q08269	859 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	ASH1	P34233	588 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	UGA3	P26370	528 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	RGA1	P39083	1007 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	TUB4	P53378	473 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	SEC2	P17065	759 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	PUS6	P53294	404 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MDM20	YOL076W	AFT1	P22149	690 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	IXR1	P33417	597 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	RTT106	P40161	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	PUS5	Q06244	254 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	ERF2	Q06551	359 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	ENV9	Q08651	330 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	MMP1	Q12372	583 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	CLA4	P48562	842 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	HXT10	P43581	546 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	RPA14	P50106	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	SIT4	P20604	311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	MET22	P32179	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	FPK1	P53739	893 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	NIS1	P53939	407 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
MDM20	YOL076W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM20	YOL076W	DIT2	P21595	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	YJR115W	P47152	169 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	ARG82	P07250	355 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	TPD3	P31383	635 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	HST2	P53686	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	MET32	Q12041	191 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	ARG8	P18544	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	MOD5	P07884	428 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	LSC2	P53312	427 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	GLC3	P32775	704 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	SCW11	P53189	542 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	AGE1	Q04412	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	MIP1	P15801	1254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	NUP85	P46673	744 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MDM20	YOL076W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MDM20	YOL076W	ESS1	P22696	170 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MDM20	YOL076W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MDM20	YOL076W	YGR035C	P53222	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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