RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
YNL057W	YNL057W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
YNL057W	YNL057W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YNL057W	YNL057W	TFC8	Q12308	588 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	HO	P09932	586 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	GCN2	P15442	1659 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	DCD1	P06773	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	CAB1	Q04430	367 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	LEU3	P08638	886 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	UBP1	P25037	809 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	YRF1-2	P40105	1681 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	YBL086C	P38177	466 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YNL057W	YNL057W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	RAD9	P14737	1309 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	NUP192	P47054	1683 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	TAF5	P38129	798 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	UGA2	P38067	497 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YNL057W	YNL057W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	DOT5	P40553	215 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	RIM101	P33400	625 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	GTT3	P39996	337 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	SCY1	P53009	804 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	RAV1	P47104	1357 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	NPR2	P39923	615 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	YJL181W	P46987	611 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	ALD2	P47771	506 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	SSM4	P40318	1319 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	PAF1	P38351	445 aa		6.47	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	IES2	P40154	320 aa		6.47	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	PSK1	P31374	1356 aa		6.46	□□□□□ -1.37
YNL057W	YNL057W	CPS1	P27614	576 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	RCM1	P53972	490 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	TY4B-J	P47024	1803 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	CTH1	P47976	325 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	EDE1	P34216	1381 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	RTC1	Q08281	1341 aa		6.42	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	BCH2	P36122	765 aa		6.41	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	LAM6	Q08001	693 aa		6.41	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	FKS3	Q04952	1785 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	PPH3	P32345	308 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	TGL3	P40308	642 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	TAF8	Q03750	510 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	TCB1	Q12466	1186 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YNL057W	YNL057W	COB	P00163	385 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	RSF2	P46974	1380 aa		6.37	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	YKL133C	P36066	463 aa		6.36	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	YKR075C	P36155	307 aa		6.35	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	SLM3	Q12093	417 aa		6.34	□□□□□ -1.39
YNL057W	YNL057W	YRF1-4	O13559	1382 aa		6.33	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		6.33	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		6.33	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	YRF1-6	P53819	1859 aa		6.33	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	XKS1	P42826	600 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	EAF6	P47128	113 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	ALD3	P54114	506 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	CSE4	P36012	229 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	ESL2	P36168	1195 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	BDF1	P35817	686 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	SPT7	P35177	1332 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	UBP9	P39967	754 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YNL057W	YNL057W	OXP1	P28273	1286 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	SNF2	P22082	1703 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	SAP155	P43612	1002 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	EPS1	P40557	701 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	MSB4	Q12317	492 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	APC1	P53886	1748 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	MSN5	P52918	1224 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	YIL177C	P40434	1758 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	YJL225C	P40889	1758 aa		6.22	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.2 ms