Protein–RNA interactions for Protein: P27614

CPS1, Carboxypeptidase S, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPS1P27614 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.86■■■□□ 2.05
CPS1P27614 NOP1YDL014W 984 nt27.18■■□□□ 1.94
CPS1P27614 NSR1YGR159C 1245 nt27.12■■□□□ 1.93
CPS1P27614 YKL036CYKL036C 393 nt25.59■■□□□ 1.69
CPS1P27614 YJL027CYJL027C 417 nt24.03■■□□□ 1.44
CPS1P27614 Q0297Q0297 156 nt23.96■■□□□ 1.43
CPS1P27614 SRX1YKL086W 384 nt23.77■■□□□ 1.4
CPS1P27614 MDJ1YFL016C 1536 nt23.75■■□□□ 1.39
CPS1P27614 SCS3YGL126W 1143 nt23.6■■□□□ 1.37
CPS1P27614 YCR051WYCR051W 669 nt22.68■■□□□ 1.22
CPS1P27614 YOL085CYOL085C 342 nt22.17■■□□□ 1.14
CPS1P27614 PKP1YIL042C 1185 nt21.88■■□□□ 1.09
CPS1P27614 RPP1BYDL130W 321 nt21.53■■□□□ 1.04
CPS1P27614 SCJ1YMR214W 1134 nt21.4■■□□□ 1.02
CPS1P27614 ATS1YAL020C 1002 nt21.22■□□□□ 0.99
CPS1P27614 TRN1tP(UGG)A 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 SUF9tP(UGG)F 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 SUF8tP(UGG)H 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 SUF7tP(UGG)M 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 SUF11tP(UGG)O2 72 nt21.21■□□□□ 0.99
CPS1P27614 DBP2YNL112W 1641 nt21.18■□□□□ 0.98
CPS1P27614 CCC1YLR220W 969 nt21.12■□□□□ 0.97
CPS1P27614 PET122YER153C 765 nt20.57■□□□□ 0.88
CPS1P27614 SCR1SCR1 522 nt20.43■□□□□ 0.86
CPS1P27614 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.26■□□□□ 0.83
CPS1P27614 RRN5YLR141W 1092 nt20.02■□□□□ 0.8
CPS1P27614 YBR190WYBR190W 312 nt20■□□□□ 0.79
CPS1P27614 RVS167YDR388W 1449 nt19.97■□□□□ 0.79
CPS1P27614 RSB1YOR049C 1065 nt19.77■□□□□ 0.76
CPS1P27614 RTC3YHR087W 336 nt19.69■□□□□ 0.74
CPS1P27614 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.62■□□□□ 0.73
CPS1P27614 PST2YDR032C 597 nt19.56■□□□□ 0.72
CPS1P27614 YDJ1YNL064C 1230 nt19.52■□□□□ 0.72
CPS1P27614 SHR5YOL110W 714 nt19.4■□□□□ 0.7
CPS1P27614 GAR1YHR089C 618 nt19.12■□□□□ 0.65
CPS1P27614 YKL097CYKL097C 411 nt19.07■□□□□ 0.64
CPS1P27614 DEP1YAL013W 1218 nt18.81■□□□□ 0.6
CPS1P27614 SHU1YHL006C 453 nt18.7■□□□□ 0.58
CPS1P27614 URN1YPR152C 1398 nt18.6■□□□□ 0.57
CPS1P27614 YNL208WYNL208W 600 nt18.45■□□□□ 0.54
CPS1P27614 TIR1YER011W 765 nt18.42■□□□□ 0.54
CPS1P27614 RPN10YHR200W 807 nt18.35■□□□□ 0.53
CPS1P27614 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.33■□□□□ 0.52
CPS1P27614 YOR139CYOR139C 393 nt18.24■□□□□ 0.51
CPS1P27614 OPI9YLR338W 858 nt18.16■□□□□ 0.5
CPS1P27614 SSA1YAL005C 1929 nt18.13■□□□□ 0.49
CPS1P27614 SAH1YER043C 1350 nt18■□□□□ 0.47
CPS1P27614 SRB2YHR041C 633 nt17.98■□□□□ 0.47
CPS1P27614 NPL3YDR432W 1245 nt17.95■□□□□ 0.46
CPS1P27614 PUT4YOR348C 1884 nt17.82■□□□□ 0.44
CPS1P27614 MNP1YGL068W 585 nt17.78■□□□□ 0.44
CPS1P27614 YJR018WYJR018W 363 nt17.75■□□□□ 0.43
CPS1P27614 WWM1YFL010C 636 nt17.74■□□□□ 0.43
CPS1P27614 HOM6YJR139C 1080 nt17.7■□□□□ 0.42
CPS1P27614 YGR021WYGR021W 873 nt17.68■□□□□ 0.42
CPS1P27614 ARE1YCR048W 1833 nt17.68■□□□□ 0.42
CPS1P27614 YJR120WYJR120W 351 nt17.62■□□□□ 0.41
CPS1P27614 PUN1YLR414C 792 nt17.62■□□□□ 0.41
CPS1P27614 YOL037CYOL037C 354 nt17.55■□□□□ 0.4
CPS1P27614 RPP2BYDR382W 333 nt17.5■□□□□ 0.39
CPS1P27614 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.48■□□□□ 0.39
CPS1P27614 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.48■□□□□ 0.39
CPS1P27614 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.48■□□□□ 0.39
CPS1P27614 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.48■□□□□ 0.39
CPS1P27614 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.48■□□□□ 0.39
CPS1P27614 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.46■□□□□ 0.39
CPS1P27614 RKM5YLR137W 1104 nt17.44■□□□□ 0.38
CPS1P27614 PTC2YER089C 1395 nt17.4■□□□□ 0.38
CPS1P27614 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.35■□□□□ 0.37
CPS1P27614 POA1YBR022W 534 nt17.35■□□□□ 0.37
CPS1P27614 SSA3YBL075C 1950 nt17.28■□□□□ 0.36
CPS1P27614 BDH2YAL061W 1254 nt17.24■□□□□ 0.35
CPS1P27614 PUS2YGL063W 1113 nt17.2■□□□□ 0.34
CPS1P27614 BUD23YCR047C 828 nt17.14■□□□□ 0.33
CPS1P27614 YLR281CYLR281C 468 nt17.14■□□□□ 0.33
CPS1P27614 LSM3YLR438C-A 270 nt17.06■□□□□ 0.32
CPS1P27614 NAB2YGL122C 1578 nt17.05■□□□□ 0.32
CPS1P27614 WHI5YOR083W 888 nt17.04■□□□□ 0.32
CPS1P27614 FPR4YLR449W 1179 nt17.01■□□□□ 0.31
CPS1P27614 INM2YDR287W 879 nt17■□□□□ 0.31
CPS1P27614 MOT3YMR070W 1473 nt16.99■□□□□ 0.31
CPS1P27614 YBL100CYBL100C 315 nt16.98■□□□□ 0.31
CPS1P27614 DAL1YIR027C 1383 nt16.93■□□□□ 0.3
CPS1P27614 FIS1YIL065C 468 nt16.89■□□□□ 0.29
CPS1P27614 BSC6YOL137W 1494 nt16.85■□□□□ 0.29
CPS1P27614 TRM9YML014W 840 nt16.84■□□□□ 0.29
CPS1P27614 FUN26YAL022C 1554 nt16.8■□□□□ 0.28
CPS1P27614 PHO4YFR034C 939 nt16.79■□□□□ 0.28
CPS1P27614 YPR011CYPR011C 981 nt16.79■□□□□ 0.28
CPS1P27614 FMP45YDL222C 930 nt16.78■□□□□ 0.28
CPS1P27614 YLR236CYLR236C 324 nt16.72■□□□□ 0.27
CPS1P27614 DSK2YMR276W 1122 nt16.72■□□□□ 0.27
CPS1P27614 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.66■□□□□ 0.26
CPS1P27614 CCT6YDR188W 1641 nt16.63■□□□□ 0.25
CPS1P27614 YCH1YGR203W 447 nt16.58■□□□□ 0.24
CPS1P27614 Q0182Q0182 405 nt16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms