RNA–Protein interactions for RNA: YKR033C

YKR033C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR033C, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR033CYKR033C TY1A-JR2P47099 440 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C PEX21P50091 288 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C TY1A-DR1Q03856 440 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C TY1A-BRQ12217 440 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C TY1A-NL2Q12470 440 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C TY1A-GR2Q12485 440 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C ERF2Q06551 359 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YKR033CYKR033C DNA2P38859 1522 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C RAS1P01119 309 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C PRT1P06103 763 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C KEX2P13134 814 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C SIT4P20604 311 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C GYP1Q08484 637 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C GCD11P32481 527 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C NIS1P53939 407 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C SAS4Q04003 481 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YKR033CYKR033C DPS1P04802 557 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C GLC3P32775 704 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C TEA1P47988 759 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C CLB5P30283 435 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C AGE1Q04412 482 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C NPL4P33755 580 aa4.69□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C FPK1P53739 893 aa4.69□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C SRC1Q03707 834 aa4.69□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C LEU3P08638 886 aa4.67□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C AMS1P22855 1083 aa4.67□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C SCJ1P25303 377 aa4.67□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C PAC1P39946 494 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C CST6P40535 587 aa4.66□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C YNL115CP53925 644 aa4.66□□□□□ -1.66
YKR033CYKR033C KTR1P27810 393 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C RRN7P40992 514 aa4.65□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C RTF1P53064 558 aa4.65□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C ATF2P53296 535 aa4.65□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C TUB4P53378 473 aa4.65□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C AIM7Q12156 149 aa4.64□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C TY1B-DR4Q07793 1604 aa4.64□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C MOD5P07884 428 aa4.63□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C CLA4P48562 842 aa4.63□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C HST2P53686 357 aa4.63□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C SSN2P38931 1420 aa4.63□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C LAM6Q08001 693 aa4.62□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C SLY41P22215 453 aa4.61□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C ESS1P22696 170 aa4.6□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C BDP1P46678 594 aa4.6□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C YEL077CQ3E7X8 1277 aa4.6□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C ERG12P07277 443 aa4.59□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C KIN1P13185 1064 aa4.59□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C YJU3P28321 313 aa4.59□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C RSC30P38781 883 aa4.59□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C MMP1Q12372 583 aa4.59□□□□□ -1.67
YKR033CYKR033C AIR1P40507 360 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C YMR196WQ04336 1088 aa4.58□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C KOG1P38873 1557 aa4.57□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C PDC1P06169 563 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C GLN1P32288 370 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C RPN1P38764 993 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C TRM1P15565 570 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C PAT1P25644 796 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C CSN12P47130 423 aa4.56□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C PUS6P53294 404 aa4.56□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C TPD3P31383 635 aa4.55□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C PUS5Q06244 254 aa4.55□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C HSL1P34244 1518 aa4.55□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C GUA1P38625 525 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data4.54□□□□□ -1.68not detected
YKR033CYKR033C HXT10P43581 546 aa4.54□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C SWR1Q05471 1514 aa4.54□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C RPA14P50106 137 aa4.53□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C YPR097WQ06839 1073 aa4.53□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C YDL206WQ12424 762 aa4.53□□□□□ -1.68
YKR033CYKR033C RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C KXD1P53158 218 aa4.52□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C HED1Q03937 162 aa4.52□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C TRK1P12685 1235 aa4.51□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C MET32Q12041 191 aa4.51□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C RAD59Q12223 238 aa4.5□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C CDC4P07834 779 aa4.49□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C TBF1Q02457 562 aa4.48□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C ALR1Q08269 859 aa4.48□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C ARG8P18544 423 aa4.47□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C ITT1Q04638 464 aa4.47□□□□□ -1.69
YKR033CYKR033C HIR3P47171 1648 aa4.46□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C VAC17P25591 423 aa4.45□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C PKC1P24583 1151 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C ASH1P34233 588 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C FIG4P42837 879 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C HPC2Q01448 625 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C YPR084WQ06821 456 aa4.44□□□□□ -1.7
YKR033CYKR033C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 79.1 ms