RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 IQGAP2Q13576 1575 aa8.35□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 DISP1Q96F81 1524 aa8.35□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.34□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.34□□□□□ -1.07
MSC-AS1-205ENST00000519068 MIER1Q8N108 512 aa8.33□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARAP1Q96P48 1450 aa8.32□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.32□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.29□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCNH8Q96L42 1107 aa8.29□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 FMN1Q68DA7 1419 aa8.29□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.28□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGEF11O15085 1522 aa8.28□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 UACAQ9BZF9 1416 aa8.28□□□□□ -1.08
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.27□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKHG5O94827 1062 aa8.27□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 SHROOM2Q13796 1616 aa8.27□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.26□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.26□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIAA0556O60303 1618 aa8.25□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.25□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 SAMD9Q5K651 1589 aa8.25□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATP10BO94823 1461 aa8.23□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.22□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.22□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.22□□□□□ -1.09
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 GSE1Q14687 1217 aa8.2□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.2□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.19□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.19□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPDYE6P0CI01 402 aa8.19□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.19□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.19□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCA8O94911 1581 aa8.18□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.18□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCC2Q92887 1545 aa8.18□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 CAPN15O75808 1086 aa8.17□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.17□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.16□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.16□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.16□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.15□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASXL2Q76L83 1435 aa8.15□□□□□ -1.1
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.13□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 STK25O00506 426 aa8.13□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.13□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.13□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.12□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF39Q9H2S5 420 aa8.12□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.11□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 HECW1Q76N89 1606 aa8.11□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP3K1Q13233 1512 aa8.11□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 ITGAEP38570 1179 aa8.1□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.1□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.09□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.09□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 TIAM1Q13009 1591 aa8.09□□□□□ -1.11
MSC-AS1-205ENST00000519068 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.08□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 CD109Q6YHK3 1445 aa8.08□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 NCOA2Q15596 1464 aa8.07□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEUROD2Q15784 382 aa8.07□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.07□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR70Q9NW82 654 aa8.07□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCB7O75027 752 aa8.06□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.06□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.06□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.06□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLCH2O75038 1416 aa8.05□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 AFAP1Q8N556 730 aa8.05□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.05□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAPGEF3O95398 923 aa8.04□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSPY4P0CV99 314 aa8.04□□□□□ -1.12
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSPY10P0CW01 314 aa8.04□□□□□ -1.12
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