RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.87□□□□□ -0.19
MSC-AS1-205ENST00000519068 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
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MSC-AS1-205ENST00000519068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.24□□□□□ -0.45
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
MSC-AS1-205ENST00000519068 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.19□□□□□ -0.62
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC24A1O60721 1099 aa10.53□□□□□ -0.72
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.53□□□□□ -0.72
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MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBTB22O15209 634 aa10.1□□□□□ -0.79
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-205ENST00000519068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa10□□□□□ -0.81
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MSC-AS1-205ENST00000519068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.68□□□□□ -0.86
MSC-AS1-205ENST00000519068 FKBP8Q14318 412 aa9.63□□□□□ -0.87
MSC-AS1-205ENST00000519068 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.59□□□□□ -0.87
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.46□□□□□ -0.9
MSC-AS1-205ENST00000519068 MSH5O43196 834 aa9.44□□□□□ -0.9
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SMARCA4P51532 1647 aa9.38□□□□□ -0.91
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PLCB2Q00722 1185 aa9.37□□□□□ -0.91
MSC-AS1-205ENST00000519068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.36□□□□□ -0.91
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MSC-AS1-205ENST00000519068 BCANQ96GW7 911 aa9.3□□□□□ -0.92
MSC-AS1-205ENST00000519068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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MSC-AS1-205ENST00000519068 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.2□□□□□ -0.94
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
MSC-AS1-205ENST00000519068 HMGXB3Q12766 1538 aa9.2□□□□□ -0.94
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
MSC-AS1-205ENST00000519068 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.15□□□□□ -0.94
MSC-AS1-205ENST00000519068 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.14□□□□□ -0.95
MSC-AS1-205ENST00000519068 FBXO3Q9UK99 471 aa9.14□□□□□ -0.95
MSC-AS1-205ENST00000519068 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.11□□□□□ -0.95
MSC-AS1-205ENST00000519068 NESP48681 1621 aa9.09□□□□□ -0.95
MSC-AS1-205ENST00000519068 CFTRP13569 1480 aa9.06□□□□□ -0.96
MSC-AS1-205ENST00000519068 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.02□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.02□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM41Q8WV44 630 aa9□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.98□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.97□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERCC6Q03468 1493 aa8.96□□□□□ -0.97
MSC-AS1-205ENST00000519068 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.9□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
MSC-AS1-205ENST00000519068 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.9□□□□□ -0.98
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PKD2Q13563 968 aa8.89□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCC8Q09428 1581 aa8.88□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 PROM2Q8N271 834 aa8.88□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOGA1O94964 1423 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-205ENST00000519068 POTEDQ86YR6 584 aa8.84□□□□□ -0.99
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