RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POGKQ9P215 609 aa21.64■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOPBP1Q92547 1522 aa21.63■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 35.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCER2I3L3R5 266 aa21.62■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.61■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BECN1Q14457 450 aa21.61■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.61■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMF1P82094 1093 aa21.61■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.6■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDCQ9Y266 331 aa21.55■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.55■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.55■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIN2BQ13224 1484 aa21.55■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GGT6Q6P531 493 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARAP1Q96P48 1450 aa21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLECQ14165 292 aa21.52■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX12O15370 315 aa21.52■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.51■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRGP23470 1445 aa21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP155O75694 1391 aa21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK26Q9P289 416 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KANK1Q14678 1352 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MORC1Q86VD1 984 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT140Q96RY7 1462 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 24.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.39■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.39■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.39■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.39■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.34■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.33■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF3BO15066 747 aa21.31■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.3■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCOA2Q15596 1464 aa21.29■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASC1Q6TDU7 716 aa21.29■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.27■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.27■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APBB1O00213 710 aa21.26■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RALBP1Q15311 655 aa21.26■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDM2Q13029 1718 aa21.26■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MS4A1P11836 297 aa21.25■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.25■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.25■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSCARQ8IYS5 282 aa21.24■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.22■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP13Q86W25 1043 aa21.21■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIAM1Q13009 1591 aa21.2■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLCB2Q00722 1185 aa21.19■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CUL7Q14999 1698 aa21.19■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UACAQ9BZF9 1416 aa21.15■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.14■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNJ4P48050 445 aa21.14■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.14■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA2Q08379 1002 aa21.14■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.14■□□□□ 0.97
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