RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-203ENST00000439720 HECW1Q76N89 1606 aa11.86□□□□□ -0.51
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RABGEF1-203ENST00000439720 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
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RABGEF1-203ENST00000439720 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.79□□□□□ -0.52
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RABGEF1-203ENST00000439720 PDE4CQ08493 712 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCH2O75038 1416 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-203ENST00000439720 CD109Q6YHK3 1445 aa11.52□□□□□ -0.57
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RABGEF1-203ENST00000439720 TSPOAP1O95153 1857 aa11.51□□□□□ -0.57
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RABGEF1-203ENST00000439720 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
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