RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.04■□□□□ 0.16
SZRD1-201ENST00000401088 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.04■□□□□ 0.16
SZRD1-201ENST00000401088 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.03■□□□□ 0.16
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.02■□□□□ 0.16
SZRD1-201ENST00000401088 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 BECN1Q14457 450 aa16.01■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 PRXQ9BXM0 1461 aa16.01■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 HMGXB3Q12766 1538 aa16■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 UACAQ9BZF9 1416 aa16■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 CRBNQ96SW2 442 aa16■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 POGKQ9P215 609 aa15.99■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 FAM161AQ3B820 660 aa15.99■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.98■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.97■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 RRP9O43818 475 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.97■□□□□ 0.15
SZRD1-201ENST00000401088 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 FMN1Q68DA7 1419 aa15.95■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.94■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.92■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 TIAM1Q13009 1591 aa15.92■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 PLEKHG5O94827 1062 aa15.92■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.91■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SZRD1-201ENST00000401088 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.89■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 PDE3BQ13370 1112 aa15.89■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 NCOA1Q15788 1441 aa15.89■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.87■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 ARID3CA6NKF2 412 aa15.86■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.85■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 NCOA2Q15596 1464 aa15.85■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.85■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.83■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 HFM1A2PYH4 1435 aa15.83■□□□□ 0.13
SZRD1-201ENST00000401088 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.83■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 ARID3AQ99856 593 aa15.82■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.82■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 RALBP1Q15311 655 aa15.82■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 CLCN1P35523 988 aa15.8■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 MAP3K1Q13233 1512 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 NLRP13Q86W25 1043 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 PANK2Q9BZ23 570 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 NAIPQ13075 1403 aa15.79■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 KIF15Q9NS87 1388 aa15.78■□□□□ 0.12
SZRD1-201ENST00000401088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.126e-7■■■□□ 18.8
SZRD1-201ENST00000401088 USP47Q96K76 1375 aa15.77■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 TOP2BQ02880 1626 aa15.76■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 C8orf34Q49A92 452 aa15.76■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 ESPNB1AK53 854 aa15.76■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 MRE11P49959 708 aa15.74■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 PTPRKQ15262 1439 aa15.73■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 IGF1RP08069 1367 aa15.72■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.72■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 NESP48681 1621 aa15.71■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 TPM2P07951 284 aa15.71■□□□□ 0.11
SZRD1-201ENST00000401088 TRAK2O60296 914 aa15.7■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.7■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.7■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 CFTRP13569 1480 aa15.69■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 MCM4P33991 863 aa15.68■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.68■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.67■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.66■□□□□ 0.1
SZRD1-201ENST00000401088 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.64■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA2Q08379 1002 aa15.64■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.63■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.63■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 PRDM2Q13029 1718 aa15.63■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 HSCBQ8IWL3 235 aa15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.62■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.61■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.61■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 SEC24BO95487 1268 aa15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 PKD2Q13563 968 aa15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms