RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
GIPC1-201ENST00000345425 MIA2Q96PC5 1412 aa42.7■■■■■ 4.43
GIPC1-201ENST00000345425 TSPOAP1O95153 1857 aa42.7■■■■■ 4.43
GIPC1-201ENST00000345425 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.67■■■■■ 4.42
GIPC1-201ENST00000345425 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.66■■■■■ 4.42
GIPC1-201ENST00000345425 FANCAO15360 1455 aa42.66■■■■■ 4.42
GIPC1-201ENST00000345425 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.66■■■■■ 4.42
GIPC1-201ENST00000345425 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.65■■■■■ 4.42
GIPC1-201ENST00000345425 NEO1Q92859 1461 aa42.58■■■■■ 4.41
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.56■■■■■ 4.4
GIPC1-201ENST00000345425 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.53■■■■■ 4.4
GIPC1-201ENST00000345425 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.51■■■■■ 4.4
GIPC1-201ENST00000345425 AKNAQ7Z591 1439 aa42.51■■■■■ 4.4
GIPC1-201ENST00000345425 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.5■■■■■ 4.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
GIPC1-201ENST00000345425 ADGRL1O94910 1474 aa42.45■■■■■ 4.39
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC1P33527 1531 aa42.45■■■■■ 4.39
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.43■■■■■ 4.38
GIPC1-201ENST00000345425 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
GIPC1-201ENST00000345425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
GIPC1-201ENST00000345425 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.39■■■■■ 4.38
GIPC1-201ENST00000345425 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.37■■■■■ 4.37
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.33■■■■■ 4.37
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.36
GIPC1-201ENST00000345425 MBD5Q9P267 1494 aa42.31■■■■■ 4.36
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.3■■■■■ 4.36
GIPC1-201ENST00000345425 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.29■■■■■ 4.36
GIPC1-201ENST00000345425 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
GIPC1-201ENST00000345425 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.25■■■■■ 4.35
GIPC1-201ENST00000345425 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.24■■■■■ 4.35
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.23■■■■■ 4.35
GIPC1-201ENST00000345425 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.23■■■■■ 4.35
GIPC1-201ENST00000345425 DAPK1P53355 1430 aa42.21■■■■■ 4.35
GIPC1-201ENST00000345425 RICTORQ6R327 1708 aa42.18■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC5O15440 1437 aa42.17■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 KDM6BO15054 1643 aa42.16■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 AFAP1Q8N556 730 aa42.16■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.15■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 RAPGEF3O95398 923 aa42.15■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 TSPY4P0CV99 314 aa42.14■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 TSPY10P0CW01 314 aa42.14■■■■■ 4.34
GIPC1-201ENST00000345425 KDM5CP41229 1560 aa42.13■■■■■ 4.33
GIPC1-201ENST00000345425 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.12■■■■■ 4.33
GIPC1-201ENST00000345425 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.12■■■■■ 4.33
GIPC1-201ENST00000345425 ITGAEP38570 1179 aa42.11■■■■■ 4.33
GIPC1-201ENST00000345425 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.05■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.05■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.04■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRKQ15262 1439 aa42.02■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.02■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.01■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.01■■■■■ 4.32
GIPC1-201ENST00000345425 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 ATP7AQ04656 1500 aa41.98■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.98■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.98■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.97■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.97■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.96■■■■■ 4.31
GIPC1-201ENST00000345425 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.94■■■■■ 4.3
GIPC1-201ENST00000345425 ADGRL2O95490 1459 aa41.94■■■■■ 4.3
GIPC1-201ENST00000345425 ROCK1Q13464 1354 aa41.92■■■■■ 4.3
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.92■■■■■ 4.3
GIPC1-201ENST00000345425 PLXNC1O60486 1568 aa41.9■■■■■ 4.3
GIPC1-201ENST00000345425 NCOA1Q15788 1441 aa41.87■■■■■ 4.29
GIPC1-201ENST00000345425 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.81■■■■■ 4.28
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA6Q8N139 1617 aa41.81■■■■■ 4.28
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.8■■■■■ 4.28
GIPC1-201ENST00000345425 KIF15Q9NS87 1388 aa41.8■■■■■ 4.28
GIPC1-201ENST00000345425 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.79■■■■■ 4.28
GIPC1-201ENST00000345425 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.78■■■■■ 4.28
GIPC1-201ENST00000345425 HFM1A2PYH4 1435 aa41.74■■■■■ 4.27
GIPC1-201ENST00000345425 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.73■■■■■ 4.27
GIPC1-201ENST00000345425 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.73■■■■■ 4.27
GIPC1-201ENST00000345425 ATP10AO60312 1499 aa41.72■■■■■ 4.27
GIPC1-201ENST00000345425 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.7■■■■■ 4.27
GIPC1-201ENST00000345425 A2MP01023 1474 aa41.69■■■■■ 4.26
GIPC1-201ENST00000345425 NAIPQ13075 1403 aa41.69■■■■■ 4.26
GIPC1-201ENST00000345425 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
GIPC1-201ENST00000345425 REREQ9P2R6 1566 aa41.65■■■■■ 4.26
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.63■■■■■ 4.26
GIPC1-201ENST00000345425 ERBINQ96RT1 1412 aa41.63■■■■■ 4.25
GIPC1-201ENST00000345425 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.6■■■■■ 4.25
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
GIPC1-201ENST00000345425 AGLP35573 1532 aa41.5■■■■■ 4.23
GIPC1-201ENST00000345425 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.48■■■■■ 4.23
GIPC1-201ENST00000345425 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.46■■■■■ 4.23
GIPC1-201ENST00000345425 KIF3BO15066 747 aa41.45■■■■■ 4.23
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.44■■■■■ 4.22
GIPC1-201ENST00000345425 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
GIPC1-201ENST00000345425 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
GIPC1-201ENST00000345425 HRCP23327 699 aa41.39■■■■■ 4.22
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