RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fam135aQ6NS59 1506 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trim26Q99PN3 545 aa15.83■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rad54l2Q99NG0 1466 aa15.81■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Irx6Q9ER75 438 aa15.81■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm38655A0A286YDK6 273 aa15.8■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sox12Q04890 314 aa15.8■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Egfem1Q8C088 590 aa15.8■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Calr4Q3TQS0 420 aa15.78■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fyco1Q8VDC1 1437 aa15.77■□□□□ 0.12
Ctif-201ENSMUST00000165559 Map4P27546 1125 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ciz1Q8VEH2 845 aa15.76■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa15.76■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa15.76■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ap3b2Q9JME5 1082 aa15.76■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Stk26Q99JT2 416 aa15.73■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Card11Q8CIS0 1159 aa15.71■□□□□ 0.11
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sirt1Q923E4 737 aa15.69■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa15.68■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa15.67■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Evi5lH3BKQ3 813 aa15.67■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 CntlnA2AM05 1397 aa15.66■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Anks4bQ8K3X6 423 aa15.66■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa15.65■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Ctif-201ENSMUST00000165559 Afap1Q80YS6 731 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Adgrl3Q80TS3 1537 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tom1O88746 492 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Neo1P97798 1493 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pak3Q61036 559 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lamc3Q9R0B6 1581 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kcnn1Q9EQR3 537 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sugp2Q8CH09 1067 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Chrna2Q91X60 512 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Arhgap5P97393 1501 aa15.59■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mia2Q91ZV0 1396 aa15.58■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ofd1Q80Z25 1017 aa15.57■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cep162Q6ZQ06 1403 aa15.57■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa15.57■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Plekhh2Q8C115 1491 aa15.57■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gimap5Q8BWF2 308 aa15.55■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Neurod2Q62414 383 aa15.55■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Grin2bQ01097 1482 aa15.55■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cnga1P29974 684 aa15.54■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Iqcf3Q9D498 203 aa15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Vsig10D3YX43 558 aa15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fyb1O35601 819 aa15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Apbb1Q9QXJ1 710 aa15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf326O88291 580 aa15.53■□□□□ 0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Prdm16A2A935 1275 aa15.5■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Shq1Q7TMX5 569 aa15.5■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trim30dE9PWL0 497 aa15.49■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cabp1Q9JLK7 227 aa15.49■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm6268A2A3U9 297 aa15.49■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf316Q6PGE4 1016 aa15.49■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tdrd9Q14BI7 1383 aa15.49■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 A2mQ6GQT1 1474 aa15.48■□□□□ 0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 NrkQ9R0G8 1455 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Grin2aP35436 1464 aa15.44■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 OvosQ3UU35 1456 aa15.43■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Emilin2Q8K482 1074 aa15.42■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Camsap1A2AHC3 1581 aa15.42■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 NudcO35685 332 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 CatipB9EKE5 520 aa15.41■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 ZgpatQ8VDM1 511 aa15.41■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trak1Q6PD31 939 aa15.4■□□□□ 0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Abcc1O35379 1528 aa15.39■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kif21aQ9QXL2 1672 aa15.39■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 CanxP35564 591 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa15.38■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pkd2O35245 966 aa15.38■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fhad1A6PWD2 1420 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms