Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.26■■■■■ 6.44
Slc5a4bQ91ZP4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
Slc5a4bQ91ZP4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.47■■■■■ 5.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
Slc5a4bQ91ZP4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
Slc5a4bQ91ZP4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Slc5a4bQ91ZP4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Slc5a4bQ91ZP4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Slc5a4bQ91ZP4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Slc5a4bQ91ZP4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
Slc5a4bQ91ZP4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Slc5a4bQ91ZP4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
Slc5a4bQ91ZP4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Slc5a4bQ91ZP4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Slc5a4bQ91ZP4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Slc5a4bQ91ZP4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Slc5a4bQ91ZP4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Slc5a4bQ91ZP4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Slc5a4bQ91ZP4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Slc5a4bQ91ZP4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Slc5a4bQ91ZP4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Slc5a4bQ91ZP4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Slc5a4bQ91ZP4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Slc5a4bQ91ZP4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Slc5a4bQ91ZP4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Slc5a4bQ91ZP4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Slc5a4bQ91ZP4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Slc5a4bQ91ZP4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Slc5a4bQ91ZP4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Slc5a4bQ91ZP4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Slc5a4bQ91ZP4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Slc5a4bQ91ZP4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Slc5a4bQ91ZP4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Slc5a4bQ91ZP4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Slc5a4bQ91ZP4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Slc5a4bQ91ZP4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Slc5a4bQ91ZP4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Slc5a4bQ91ZP4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Slc5a4bQ91ZP4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Slc5a4bQ91ZP4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Slc5a4bQ91ZP4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Slc5a4bQ91ZP4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Slc5a4bQ91ZP4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Slc5a4bQ91ZP4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Slc5a4bQ91ZP4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Slc5a4bQ91ZP4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Slc5a4bQ91ZP4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Slc5a4bQ91ZP4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Slc5a4bQ91ZP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Slc5a4bQ91ZP4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Slc5a4bQ91ZP4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Slc5a4bQ91ZP4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Slc5a4bQ91ZP4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Slc5a4bQ91ZP4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Slc5a4bQ91ZP4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Slc5a4bQ91ZP4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Slc5a4bQ91ZP4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms