RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rhox8Q6VSS7 320 aa21.47■■□□□ 1.03
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.2■□□□□ 0.66
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa19.12■□□□□ 0.65
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc24a1Q91WD8 1130 aa17.5■□□□□ 0.39
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Kdm5dQ62240 1548 aa17.48■□□□□ 0.39
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa17.47■□□□□ 0.39
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm13695A2AK44 830 aa17.44■□□□□ 0.38
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kif15Q6P9L6 1387 aa17.44■□□□□ 0.38
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Os9Q8K2C7 672 aa17.4■□□□□ 0.38
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc18Q640L5 1455 aa17.29■□□□□ 0.36
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Sycp2Q9CUU3 1500 aa17.24■□□□□ 0.35
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa17.24■□□□□ 0.35
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Atp1b4Q99ME6 356 aa17.2■□□□□ 0.34
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Ctif-201ENSMUST00000165559 CenpbP27790 599 aa17.16■□□□□ 0.34
Ctif-201ENSMUST00000165559 Baz1aO88379 1555 aa17.13■□□□□ 0.33
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Ctif-201ENSMUST00000165559 NrdcQ8BHG1 1161 aa17.11■□□□□ 0.33
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.03■□□□□ 0.32
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Ctif-201ENSMUST00000165559 AknaQ80VW7 1404 aa17■□□□□ 0.31
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Ctif-201ENSMUST00000165559 TonslQ6NZL6 1363 aa16.91■□□□□ 0.3
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cux2P70298 1426 aa16.9■□□□□ 0.3
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa16.9■□□□□ 0.3
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Ctif-201ENSMUST00000165559 ScribQ80U72 1612 aa16.8■□□□□ 0.28
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Cyb5rlB1AS42 316 aa16.72■□□□□ 0.27
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcgf6Q99NA9 353 aa16.68■□□□□ 0.26
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Ctif-201ENSMUST00000165559 Clstn2Q9ER65 966 aa16.66■□□□□ 0.26
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zbtb4Q5F293 982 aa16.65■□□□□ 0.26
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mrc2Q64449 1479 aa16.65■□□□□ 0.26
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa16.61■□□□□ 0.25
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa16.6■□□□□ 0.25
Ctif-201ENSMUST00000165559 4933416C03RikQ3V063 378 aa16.59■□□□□ 0.25
Ctif-201ENSMUST00000165559 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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