RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W TUB2P02557 457 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W DED1P06634 604 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CHS1P08004 1131 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ADH4P10127 382 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ATP12P22135 325 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PTP1P25044 335 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CDC10P25342 322 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ATP7P30902 174 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ZIP1P31111 875 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W VMA6P32366 345 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W OAF3P36023 863 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YKL071WP36086 256 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W HXT13P39924 564 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W EAF5P39995 279 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RFC4P40339 323 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W FMC1P40491 155 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W UTP25P40498 721 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W LSG1P53145 640 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YGR126WP53274 230 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RRN9P53437 365 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W HXT17P53631 564 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W GOR1P53839 350 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RHO5P53879 331 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YNL143CP53908 130 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W DIA1P54005 336 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W HXT15P54854 567 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YDR132CQ03900 495 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W DYN3Q04949 312 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W DCS1Q06151 350 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W GPN3Q06543 272 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ESA1Q08649 445 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PSF3Q12146 194 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PTC5Q12511 572 aa4□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YLR278CQ05854 1341 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YLR302CO13544 120 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PCK1P10963 549 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SIR1P21691 654 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YCK1P23291 538 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W IMG1P25626 169 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W NAM9P27929 486 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SEC65P29478 273 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CTF13P35203 478 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W GEX2P36173 615 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CDS1P38221 457 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W REG2P38232 338 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RTT107P38850 1070 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RPN10P38886 268 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YER184CP39961 794 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W EDC3P39998 551 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W JLP2P40206 208 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PCI8P40512 444 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W GAB1P41733 394 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SIP4P46954 829 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YJL045WP47052 634 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PET130P47065 347 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W GTO1P48239 356 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YGR042WP53227 271 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PEX13P80667 386 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SRL4Q03085 281 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YML108WQ03759 105 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PEX12Q04370 399 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PIG1Q06216 648 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CDD1Q06549 142 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W REX4Q08237 289 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YPL216WQ08964 1102 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W NMD4Q12129 218 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.99□□□□□ -1.77not detected
YPT53YNL093W SET6Q12529 373 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W APM4Q99186 491 aa3.99□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W MATALPHA2P0CY08 210 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W HMLALPHA2P0CY09 210 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ALG1P16661 449 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W UGA1P17649 471 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W COQ1P18900 473 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W PER1P25625 357 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W AFG1P32317 509 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SIP1P32578 815 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W FAT1P38225 669 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W YAP3P38749 330 aa3.98□□□□□ -1.77
YPT53YNL093W ECM1P39715 212 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.6 ms