Protein–RNA interactions for Protein: Q12511

PTC5, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTC5Q12511 YML009W-BYML009W-B 477 nt23■■□□□ 1.27
PTC5Q12511 NSR1YGR159C 1245 nt22.86■■□□□ 1.25
PTC5Q12511 NOP1YDL014W 984 nt22.21■■□□□ 1.15
PTC5Q12511 MDJ1YFL016C 1536 nt20.51■□□□□ 0.87
PTC5Q12511 YKL036CYKL036C 393 nt20.47■□□□□ 0.87
PTC5Q12511 Q0297Q0297 156 nt19.47■□□□□ 0.71
PTC5Q12511 SRX1YKL086W 384 nt19.47■□□□□ 0.71
PTC5Q12511 YJL027CYJL027C 417 nt19.12■□□□□ 0.65
PTC5Q12511 SCS3YGL126W 1143 nt18.65■□□□□ 0.58
PTC5Q12511 YCR051WYCR051W 669 nt18.5■□□□□ 0.55
PTC5Q12511 DBP2YNL112W 1641 nt18.12■□□□□ 0.49
PTC5Q12511 YOL085CYOL085C 342 nt17.79■□□□□ 0.44
PTC5Q12511 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.68■□□□□ 0.42
PTC5Q12511 PKP1YIL042C 1185 nt17.6■□□□□ 0.41
PTC5Q12511 CCC1YLR220W 969 nt17.55■□□□□ 0.4
PTC5Q12511 RPP1BYDL130W 321 nt17.48■□□□□ 0.39
PTC5Q12511 YBR190WYBR190W 312 nt17.4■□□□□ 0.38
PTC5Q12511 RTC3YHR087W 336 nt17.04■□□□□ 0.32
PTC5Q12511 SCJ1YMR214W 1134 nt16.92■□□□□ 0.3
PTC5Q12511 RVS167YDR388W 1449 nt16.86■□□□□ 0.29
PTC5Q12511 PET122YER153C 765 nt16.78■□□□□ 0.28
PTC5Q12511 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.71■□□□□ 0.27
PTC5Q12511 ATS1YAL020C 1002 nt16.64■□□□□ 0.25
PTC5Q12511 SCR1SCR1 522 nt16.45■□□□□ 0.22
PTC5Q12511 SHR5YOL110W 714 nt16.3■□□□□ 0.2
PTC5Q12511 RRN5YLR141W 1092 nt16.28■□□□□ 0.2
PTC5Q12511 YDJ1YNL064C 1230 nt16.1■□□□□ 0.17
PTC5Q12511 DEP1YAL013W 1218 nt15.98■□□□□ 0.15
PTC5Q12511 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.95■□□□□ 0.14
PTC5Q12511 URN1YPR152C 1398 nt15.95■□□□□ 0.14
PTC5Q12511 PUT4YOR348C 1884 nt15.94■□□□□ 0.14
PTC5Q12511 RSB1YOR049C 1065 nt15.89■□□□□ 0.13
PTC5Q12511 GAR1YHR089C 618 nt15.84■□□□□ 0.13
PTC5Q12511 OPI9YLR338W 858 nt15.7■□□□□ 0.1
PTC5Q12511 SAH1YER043C 1350 nt15.69■□□□□ 0.1
PTC5Q12511 ARE1YCR048W 1833 nt15.64■□□□□ 0.09
PTC5Q12511 YNL208WYNL208W 600 nt15.61■□□□□ 0.09
PTC5Q12511 RPN10YHR200W 807 nt15.57■□□□□ 0.08
PTC5Q12511 POA1YBR022W 534 nt15.46■□□□□ 0.07
PTC5Q12511 PST2YDR032C 597 nt15.43■□□□□ 0.06
PTC5Q12511 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.42■□□□□ 0.06
PTC5Q12511 TIR1YER011W 765 nt15.28■□□□□ 0.04
PTC5Q12511 YJR018WYJR018W 363 nt15.19■□□□□ 0.02
PTC5Q12511 PUN1YLR414C 792 nt15.19■□□□□ 0.02
PTC5Q12511 SSA1YAL005C 1929 nt15.18■□□□□ 0.02
PTC5Q12511 BSC6YOL137W 1494 nt15.12■□□□□ 0.01
PTC5Q12511 PTC2YER089C 1395 nt15.11■□□□□ 0.01
PTC5Q12511 BUD23YCR047C 828 nt15.06■□□□□ 0
PTC5Q12511 YJR120WYJR120W 351 nt15.04■□□□□ -0
PTC5Q12511 SSA3YBL075C 1950 nt15.03■□□□□ -0
PTC5Q12511 SRB2YHR041C 633 nt15.02■□□□□ -0
PTC5Q12511 NAB2YGL122C 1578 nt14.86□□□□□ -0.03
PTC5Q12511 SHU1YHL006C 453 nt14.86□□□□□ -0.03
PTC5Q12511 RPP2BYDR382W 333 nt14.78□□□□□ -0.04
PTC5Q12511 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.73□□□□□ -0.05
PTC5Q12511 YKL097CYKL097C 411 nt14.73□□□□□ -0.05
PTC5Q12511 FIS1YIL065C 468 nt14.71□□□□□ -0.05
PTC5Q12511 FPR4YLR449W 1179 nt14.68□□□□□ -0.06
PTC5Q12511 DAL1YIR027C 1383 nt14.66□□□□□ -0.06
PTC5Q12511 WWM1YFL010C 636 nt14.65□□□□□ -0.06
PTC5Q12511 INM2YDR287W 879 nt14.6□□□□□ -0.07
PTC5Q12511 PHO4YFR034C 939 nt14.56□□□□□ -0.08
PTC5Q12511 BDH2YAL061W 1254 nt14.52□□□□□ -0.09
PTC5Q12511 YBL100CYBL100C 315 nt14.5□□□□□ -0.09
PTC5Q12511 SPT5YML010W 3192 nt14.49□□□□□ -0.09
PTC5Q12511 HOM6YJR139C 1080 nt14.45□□□□□ -0.1
PTC5Q12511 MNP1YGL068W 585 nt14.43□□□□□ -0.1
PTC5Q12511 YGR021WYGR021W 873 nt14.41□□□□□ -0.1
PTC5Q12511 FUN26YAL022C 1554 nt14.34□□□□□ -0.11
PTC5Q12511 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.32□□□□□ -0.12
PTC5Q12511 YPS1YLR120C 1710 nt14.3□□□□□ -0.12
PTC5Q12511 LSM3YLR438C-A 270 nt14.28□□□□□ -0.12
PTC5Q12511 TRM9YML014W 840 nt14.25□□□□□ -0.13
PTC5Q12511 YOR139CYOR139C 393 nt14.25□□□□□ -0.13
PTC5Q12511 RKM5YLR137W 1104 nt14.22□□□□□ -0.13
PTC5Q12511 YDR095CYDR095C 411 nt14.19□□□□□ -0.14
PTC5Q12511 MEP2YNL142W 1500 nt14.17□□□□□ -0.14
PTC5Q12511 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.14□□□□□ -0.15
PTC5Q12511 CCT6YDR188W 1641 nt14.12□□□□□ -0.15
PTC5Q12511 ALF1YNL148C 765 nt14.09□□□□□ -0.15
PTC5Q12511 NPL3YDR432W 1245 nt14.06□□□□□ -0.16
PTC5Q12511 DCW1YKL046C 1350 nt14.04□□□□□ -0.16
PTC5Q12511 YOL037CYOL037C 354 nt14.01□□□□□ -0.17
PTC5Q12511 SSA4YER103W 1929 nt13.96□□□□□ -0.17
PTC5Q12511 PTP1YDL230W 1008 nt13.95□□□□□ -0.18
PTC5Q12511 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.93□□□□□ -0.18
PTC5Q12511 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.93□□□□□ -0.18
PTC5Q12511 SIS1YNL007C 1059 nt13.93□□□□□ -0.18
PTC5Q12511 RPP2AYOL039W 321 nt13.91□□□□□ -0.18
PTC5Q12511 CAC2YML102W 1407 nt13.88□□□□□ -0.19
PTC5Q12511 EMI2YDR516C 1503 nt13.8□□□□□ -0.2
PTC5Q12511 ART5YGR068C 1761 nt13.78□□□□□ -0.2
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