RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
YPT53YNL093W FAP1P53971 965 aa11.69□□□□□ -0.54
YPT53YNL093W PRY3P47033 881 aa11.03□□□□□ -0.64
YPT53YNL093W DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YPT53YNL093W PRI1P10363 409 aa10.7□□□□□ -0.7
YPT53YNL093W AAD16Q02895 342 aa10.68□□□□□ -0.7
YPT53YNL093W YCK3P39962 524 aa10.51□□□□□ -0.73
YPT53YNL093W ISW2Q08773 1120 aa10.28□□□□□ -0.76
YPT53YNL093W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
YPT53YNL093W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
YPT53YNL093W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YPT53YNL093W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
YPT53YNL093W MRPL32P25348 183 aa9.66□□□□□ -0.86
YPT53YNL093W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
YPT53YNL093W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
YPT53YNL093W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
YPT53YNL093W YGL015CP33199 130 aa9.39□□□□□ -0.91
YPT53YNL093W REB1P21538 810 aa9.36□□□□□ -0.91
YPT53YNL093W AVT3P36062 692 aa9.36□□□□□ -0.91
YPT53YNL093W CDC27P38042 758 aa9.18□□□□□ -0.94
YPT53YNL093W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
YPT53YNL093W SPT21P35209 758 aa8.97□□□□□ -0.97
YPT53YNL093W MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
YPT53YNL093W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YPT53YNL093W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
YPT53YNL093W DCD1P06773 312 aa8.85□□□□□ -0.99
YPT53YNL093W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
YPT53YNL093W HOP09932 586 aa8.84□□□□□ -0.99
YPT53YNL093W TFC8Q12308 588 aa8.79□□□□□ -1
YPT53YNL093W SCY1P53009 804 aa8.64□□□□□ -1.03
YPT53YNL093W RIM101P33400 625 aa8.53□□□□□ -1.04
YPT53YNL093W SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YPT53YNL093W BCH2P36122 765 aa8.51□□□□□ -1.05
YPT53YNL093W TGL3P40308 642 aa8.48□□□□□ -1.05
YPT53YNL093W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YPT53YNL093W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YPT53YNL093W UBP9P39967 754 aa8.33□□□□□ -1.08
YPT53YNL093W OXP1P28273 1286 aa8.28□□□□□ -1.08
YPT53YNL093W EPS1P40557 701 aa8.24□□□□□ -1.09
YPT53YNL093W BDF1P35817 686 aa8.23□□□□□ -1.09
YPT53YNL093W MST1P07236 462 aa8.08□□□□□ -1.12
YPT53YNL093W PTP3P40048 928 aa8.08□□□□□ -1.12
YPT53YNL093W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.07□□□□□ -1.12
YPT53YNL093W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YPT53YNL093W YOR238WQ08634 303 aa8.02□□□□□ -1.13
YPT53YNL093W RSM7P47150 247 aa7.98□□□□□ -1.13
YPT53YNL093W AI2P03876 854 aa7.95□□□□□ -1.14
YPT53YNL093W VNX1P42839 908 aa7.95□□□□□ -1.14
YPT53YNL093W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
YPT53YNL093W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.92□□□□□ -1.14not detected
YPT53YNL093W BBC1P47068 1157 aa7.92□□□□□ -1.14
YPT53YNL093W YAP5P40574 245 aa7.88□□□□□ -1.15
YPT53YNL093W WSC3Q12215 556 aa7.88□□□□□ -1.15
YPT53YNL093W SPP1Q03012 353 aa7.85□□□□□ -1.15
YPT53YNL093W YLR271WQ06152 274 aa7.79□□□□□ -1.16
YPT53YNL093W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YPT53YNL093W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YPT53YNL093W PIB1Q06651 286 aa7.74□□□□□ -1.17
YPT53YNL093W FKH1P40466 484 aa7.71□□□□□ -1.18
YPT53YNL093W GTT3P39996 337 aa7.7□□□□□ -1.18
YPT53YNL093W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YPT53YNL093W MRM1P25270 412 aa7.65□□□□□ -1.18
YPT53YNL093W IOC2Q12072 812 aa7.65□□□□□ -1.18
YPT53YNL093W LDB19Q12502 818 aa7.64□□□□□ -1.19
YPT53YNL093W ULI1P43604 169 aa7.63□□□□□ -1.19
YPT53YNL093W YJL171CP46992 396 aa7.63□□□□□ -1.19
YPT53YNL093W TFA1P36100 482 aa7.51□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W VPS29P38759 282 aa7.51□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W SET4P42948 560 aa7.51□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W CST9Q06032 482 aa7.51□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W BMT6Q12291 365 aa7.51□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W SSP1P38871 571 aa7.5□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W YOL036WQ08206 761 aa7.5□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W YFR006WP43590 535 aa7.49□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W MSB4Q12317 492 aa7.48□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
YPT53YNL093W RTG1P32607 177 aa7.46□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.46□□□□□ -1.22not detected
YPT53YNL093W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W STS1P38637 319 aa7.44□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.43□□□□□ -1.22not detected
YPT53YNL093W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W NCR1Q12200 1170 aa7.41□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W RTG3P38165 486 aa7.4□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W RCR1P38212 213 aa7.4□□□□□ -1.22
YPT53YNL093W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YPT53YNL093W MGA2P40578 1113 aa7.36□□□□□ -1.23
YPT53YNL093W SAM3Q08986 587 aa7.36□□□□□ -1.23
YPT53YNL093W SEC61P32915 480 aa7.32□□□□□ -1.24
YPT53YNL093W DAN4P47179 1161 aa7.29□□□□□ -1.24
YPT53YNL093W SAP30P38429 201 aa7.25□□□□□ -1.25
YPT53YNL093W GYP5Q12344 894 aa7.24□□□□□ -1.25
YPT53YNL093W DCW1P36091 449 aa7.23□□□□□ -1.25
YPT53YNL093W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W JIP4Q03361 876 aa7.2□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W YDL129WQ07555 291 aa7.18□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W HTA2P04912 132 aa7.17□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W YEL023CP39992 682 aa7.16□□□□□ -1.26
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