Protein–RNA interactions for Protein: Q03085

SRL4, Oxidoreductase-like protein SRL4, yeastyeast

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRL4Q03085 NSR1YGR159C 1245 nt18.25■□□□□ 0.51
SRL4Q03085 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.69■□□□□ 0.42
SRL4Q03085 MDJ1YFL016C 1536 nt16.95■□□□□ 0.3
SRL4Q03085 NOP1YDL014W 984 nt16.91■□□□□ 0.3
SRL4Q03085 YJL027CYJL027C 417 nt15.62■□□□□ 0.09
SRL4Q03085 YKL036CYKL036C 393 nt15.13■□□□□ 0.01
SRL4Q03085 SSA3YBL075C 1950 nt14.92□□□□□ -0.02
SRL4Q03085 SRX1YKL086W 384 nt14.71□□□□□ -0.05
SRL4Q03085 YBR190WYBR190W 312 nt14.68□□□□□ -0.06
SRL4Q03085 DBP2YNL112W 1641 nt14.59□□□□□ -0.07
SRL4Q03085 Q0297Q0297 156 nt14.46□□□□□ -0.09
SRL4Q03085 RTC3YHR087W 336 nt14.37□□□□□ -0.11
SRL4Q03085 YCR051WYCR051W 669 nt13.94□□□□□ -0.18
SRL4Q03085 PUT4YOR348C 1884 nt13.88□□□□□ -0.19
SRL4Q03085 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SRL4Q03085 RVS167YDR388W 1449 nt13.69□□□□□ -0.22
SRL4Q03085 CCC1YLR220W 969 nt13.66□□□□□ -0.22
SRL4Q03085 SCS3YGL126W 1143 nt13.58□□□□□ -0.24
SRL4Q03085 POA1YBR022W 534 nt13.44□□□□□ -0.26
SRL4Q03085 ARE1YCR048W 1833 nt13.38□□□□□ -0.27
SRL4Q03085 SCJ1YMR214W 1134 nt13.33□□□□□ -0.28
SRL4Q03085 BSC6YOL137W 1494 nt13.29□□□□□ -0.28
SRL4Q03085 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.28□□□□□ -0.28
SRL4Q03085 SAH1YER043C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
SRL4Q03085 SSA4YER103W 1929 nt13.16□□□□□ -0.3
SRL4Q03085 URN1YPR152C 1398 nt13.11□□□□□ -0.31
SRL4Q03085 SPT5YML010W 3192 nt13.1□□□□□ -0.31
SRL4Q03085 OPI9YLR338W 858 nt13.07□□□□□ -0.32
SRL4Q03085 YOL085CYOL085C 342 nt13.06□□□□□ -0.32
SRL4Q03085 RPP1BYDL130W 321 nt12.99□□□□□ -0.33
SRL4Q03085 SHR5YOL110W 714 nt12.97□□□□□ -0.33
SRL4Q03085 BUD23YCR047C 828 nt12.95□□□□□ -0.34
SRL4Q03085 DEP1YAL013W 1218 nt12.87□□□□□ -0.35
SRL4Q03085 RPN10YHR200W 807 nt12.79□□□□□ -0.36
SRL4Q03085 PKP1YIL042C 1185 nt12.78□□□□□ -0.36
SRL4Q03085 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.76□□□□□ -0.37
SRL4Q03085 PUN1YLR414C 792 nt12.72□□□□□ -0.37
SRL4Q03085 PTC2YER089C 1395 nt12.68□□□□□ -0.38
SRL4Q03085 BDF1YLR399C 2061 nt12.66□□□□□ -0.38
SRL4Q03085 NAB2YGL122C 1578 nt12.63□□□□□ -0.39
SRL4Q03085 YNL208WYNL208W 600 nt12.6□□□□□ -0.39
SRL4Q03085 MEP2YNL142W 1500 nt12.56□□□□□ -0.4
SRL4Q03085 TAT1YBR069C 1860 nt12.51□□□□□ -0.41
SRL4Q03085 PET122YER153C 765 nt12.49□□□□□ -0.41
SRL4Q03085 YJR018WYJR018W 363 nt12.46□□□□□ -0.41
SRL4Q03085 PAC11YDR488C 1602 nt12.45□□□□□ -0.42
SRL4Q03085 YDJ1YNL064C 1230 nt12.36□□□□□ -0.43
SRL4Q03085 FIS1YIL065C 468 nt12.32□□□□□ -0.44
SRL4Q03085 FPR4YLR449W 1179 nt12.32□□□□□ -0.44
SRL4Q03085 DAL1YIR027C 1383 nt12.3□□□□□ -0.44
SRL4Q03085 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
SRL4Q03085 SCR1SCR1 522 nt12.28□□□□□ -0.44
SRL4Q03085 GAR1YHR089C 618 nt12.23□□□□□ -0.45
SRL4Q03085 YMR090WYMR090W 684 nt12.23□□□□□ -0.45
SRL4Q03085 YPS1YLR120C 1710 nt12.2□□□□□ -0.46
SRL4Q03085 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.2□□□□□ -0.46
SRL4Q03085 PHO4YFR034C 939 nt12.19□□□□□ -0.46
SRL4Q03085 YBR220CYBR220C 1683 nt12.17□□□□□ -0.46
SRL4Q03085 EMI2YDR516C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
SRL4Q03085 INM2YDR287W 879 nt12.14□□□□□ -0.47
SRL4Q03085 ATS1YAL020C 1002 nt12.13□□□□□ -0.47
SRL4Q03085 RPP2BYDR382W 333 nt12.06□□□□□ -0.48
SRL4Q03085 RRN5YLR141W 1092 nt12.06□□□□□ -0.48
SRL4Q03085 YDR095CYDR095C 411 nt12.01□□□□□ -0.49
SRL4Q03085 YDL221WYDL221W 552 nt12□□□□□ -0.49
SRL4Q03085 YJR120WYJR120W 351 nt11.99□□□□□ -0.49
SRL4Q03085 SDH1YKL148C 1923 nt11.99□□□□□ -0.49
SRL4Q03085 NVJ2YPR091C 2313 nt11.99□□□□□ -0.49
SRL4Q03085 PCH2YBR186W 1695 nt11.95□□□□□ -0.5
SRL4Q03085 SEC11YIR022W 504 nt11.93□□□□□ -0.5
SRL4Q03085 YBL100CYBL100C 315 nt11.89□□□□□ -0.51
SRL4Q03085 GUT2YIL155C 1950 nt11.88□□□□□ -0.51
SRL4Q03085 TIR1YER011W 765 nt11.84□□□□□ -0.51
SRL4Q03085 CAC2YML102W 1407 nt11.84□□□□□ -0.51
SRL4Q03085 SSA1YAL005C 1929 nt11.82□□□□□ -0.52
SRL4Q03085 SCC4YER147C 1875 nt11.81□□□□□ -0.52
SRL4Q03085 RPP2AYOL039W 321 nt11.81□□□□□ -0.52
SRL4Q03085 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.8□□□□□ -0.52
SRL4Q03085 PTP1YDL230W 1008 nt11.77□□□□□ -0.53
SRL4Q03085 ALF1YNL148C 765 nt11.77□□□□□ -0.53
SRL4Q03085 FUN26YAL022C 1554 nt11.7□□□□□ -0.54
SRL4Q03085 FPS1YLL043W 2010 nt11.69□□□□□ -0.54
SRL4Q03085 RSB1YOR049C 1065 nt11.68□□□□□ -0.54
SRL4Q03085 IRC15YPL017C 1500 nt11.65□□□□□ -0.54
SRL4Q03085 YSC84YHR016C 1407 nt11.63□□□□□ -0.55
SRL4Q03085 GIS3YLR094C 1509 nt11.63□□□□□ -0.55
SRL4Q03085 BDH2YAL061W 1254 nt11.61□□□□□ -0.55
SRL4Q03085 RTF1YGL244W 1677 nt11.59□□□□□ -0.55
SRL4Q03085 PIB2YGL023C 1908 nt11.58□□□□□ -0.56
SRL4Q03085 TRM9YML014W 840 nt11.57□□□□□ -0.56
SRL4Q03085 SIS1YNL007C 1059 nt11.51□□□□□ -0.57
SRL4Q03085 BOP3YNL042W 1191 nt11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms