Protein–RNA interactions for Protein: Q08237

REX4, RNA exonuclease 4, yeastyeast

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REX4Q08237 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.5■□□□□ 0.71
REX4Q08237 NSR1YGR159C 1245 nt19.41■□□□□ 0.7
REX4Q08237 NOP1YDL014W 984 nt18.96■□□□□ 0.63
REX4Q08237 YKL036CYKL036C 393 nt17.46■□□□□ 0.39
REX4Q08237 MDJ1YFL016C 1536 nt17.24■□□□□ 0.35
REX4Q08237 Q0297Q0297 156 nt16.58■□□□□ 0.24
REX4Q08237 SRX1YKL086W 384 nt16.56■□□□□ 0.24
REX4Q08237 YJL027CYJL027C 417 nt16.29■□□□□ 0.2
REX4Q08237 SCS3YGL126W 1143 nt15.86■□□□□ 0.13
REX4Q08237 YCR051WYCR051W 669 nt15.71■□□□□ 0.11
REX4Q08237 DBP2YNL112W 1641 nt15.25■□□□□ 0.03
REX4Q08237 YOL085CYOL085C 342 nt15.12■□□□□ 0.01
REX4Q08237 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
REX4Q08237 PKP1YIL042C 1185 nt14.89□□□□□ -0.03
REX4Q08237 RPP1BYDL130W 321 nt14.88□□□□□ -0.03
REX4Q08237 CCC1YLR220W 969 nt14.83□□□□□ -0.04
REX4Q08237 YBR190WYBR190W 312 nt14.73□□□□□ -0.05
REX4Q08237 RTC3YHR087W 336 nt14.39□□□□□ -0.11
REX4Q08237 RVS167YDR388W 1449 nt14.35□□□□□ -0.11
REX4Q08237 SCJ1YMR214W 1134 nt14.24□□□□□ -0.13
REX4Q08237 PET122YER153C 765 nt14.21□□□□□ -0.13
REX4Q08237 ATS1YAL020C 1002 nt14.18□□□□□ -0.14
REX4Q08237 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.17□□□□□ -0.14
REX4Q08237 SCR1SCR1 522 nt14.07□□□□□ -0.16
REX4Q08237 SHR5YOL110W 714 nt13.84□□□□□ -0.19
REX4Q08237 RRN5YLR141W 1092 nt13.8□□□□□ -0.2
REX4Q08237 YDJ1YNL064C 1230 nt13.71□□□□□ -0.21
REX4Q08237 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.53□□□□□ -0.24
REX4Q08237 RSB1YOR049C 1065 nt13.51□□□□□ -0.25
REX4Q08237 URN1YPR152C 1398 nt13.46□□□□□ -0.25
REX4Q08237 DEP1YAL013W 1218 nt13.45□□□□□ -0.26
REX4Q08237 GAR1YHR089C 618 nt13.4□□□□□ -0.26
REX4Q08237 PUT4YOR348C 1884 nt13.38□□□□□ -0.27
REX4Q08237 RPN10YHR200W 807 nt13.27□□□□□ -0.29
REX4Q08237 OPI9YLR338W 858 nt13.27□□□□□ -0.29
REX4Q08237 YNL208WYNL208W 600 nt13.25□□□□□ -0.29
REX4Q08237 SAH1YER043C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
REX4Q08237 PST2YDR032C 597 nt13.14□□□□□ -0.31
REX4Q08237 ARE1YCR048W 1833 nt13.13□□□□□ -0.31
REX4Q08237 SSA3YBL075C 1950 nt13.09□□□□□ -0.31
REX4Q08237 TIR1YER011W 765 nt12.96□□□□□ -0.33
REX4Q08237 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.96□□□□□ -0.33
REX4Q08237 POA1YBR022W 534 nt12.96□□□□□ -0.33
REX4Q08237 PUN1YLR414C 792 nt12.89□□□□□ -0.35
REX4Q08237 YJR018WYJR018W 363 nt12.84□□□□□ -0.35
REX4Q08237 SSA1YAL005C 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
REX4Q08237 PTC2YER089C 1395 nt12.73□□□□□ -0.37
REX4Q08237 BSC6YOL137W 1494 nt12.68□□□□□ -0.38
REX4Q08237 BUD23YCR047C 828 nt12.66□□□□□ -0.38
REX4Q08237 YJR120WYJR120W 351 nt12.62□□□□□ -0.39
REX4Q08237 SHU1YHL006C 453 nt12.61□□□□□ -0.39
REX4Q08237 YKL097CYKL097C 411 nt12.61□□□□□ -0.39
REX4Q08237 RPP2BYDR382W 333 nt12.59□□□□□ -0.39
REX4Q08237 NAB2YGL122C 1578 nt12.58□□□□□ -0.4
REX4Q08237 SRB2YHR041C 633 nt12.56□□□□□ -0.4
REX4Q08237 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.42□□□□□ -0.42
REX4Q08237 DAL1YIR027C 1383 nt12.41□□□□□ -0.42
REX4Q08237 INM2YDR287W 879 nt12.4□□□□□ -0.42
REX4Q08237 WWM1YFL010C 636 nt12.38□□□□□ -0.43
REX4Q08237 FIS1YIL065C 468 nt12.38□□□□□ -0.43
REX4Q08237 FPR4YLR449W 1179 nt12.38□□□□□ -0.43
REX4Q08237 BDH2YAL061W 1254 nt12.33□□□□□ -0.44
REX4Q08237 YGR021WYGR021W 873 nt12.32□□□□□ -0.44
REX4Q08237 PHO4YFR034C 939 nt12.28□□□□□ -0.44
REX4Q08237 YBL100CYBL100C 315 nt12.27□□□□□ -0.45
REX4Q08237 HOM6YJR139C 1080 nt12.26□□□□□ -0.45
REX4Q08237 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.19□□□□□ -0.46
REX4Q08237 MNP1YGL068W 585 nt12.19□□□□□ -0.46
REX4Q08237 LSM3YLR438C-A 270 nt12.16□□□□□ -0.46
REX4Q08237 FUN26YAL022C 1554 nt12.13□□□□□ -0.47
REX4Q08237 TRM9YML014W 840 nt12.11□□□□□ -0.47
REX4Q08237 SPT5YML010W 3192 nt12.09□□□□□ -0.47
REX4Q08237 YOR139CYOR139C 393 nt12.09□□□□□ -0.47
REX4Q08237 RKM5YLR137W 1104 nt12.08□□□□□ -0.48
REX4Q08237 YPS1YLR120C 1710 nt12.06□□□□□ -0.48
REX4Q08237 NPL3YDR432W 1245 nt12.02□□□□□ -0.49
REX4Q08237 YOL037CYOL037C 354 nt11.99□□□□□ -0.49
REX4Q08237 CCT6YDR188W 1641 nt11.98□□□□□ -0.49
REX4Q08237 YDR095CYDR095C 411 nt11.98□□□□□ -0.49
REX4Q08237 ALF1YNL148C 765 nt11.96□□□□□ -0.49
REX4Q08237 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.92□□□□□ -0.5
REX4Q08237 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
REX4Q08237 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.89□□□□□ -0.51
REX4Q08237 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.89□□□□□ -0.51
REX4Q08237 SIS1YNL007C 1059 nt11.78□□□□□ -0.52
REX4Q08237 RPP2AYOL039W 321 nt11.76□□□□□ -0.53
REX4Q08237 DCW1YKL046C 1350 nt11.71□□□□□ -0.53
REX4Q08237 PTP1YDL230W 1008 nt11.7□□□□□ -0.54
REX4Q08237 YLR281CYLR281C 468 nt11.7□□□□□ -0.54
REX4Q08237 WHI5YOR083W 888 nt11.68□□□□□ -0.54
REX4Q08237 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.67□□□□□ -0.54
REX4Q08237 SSA4YER103W 1929 nt11.65□□□□□ -0.54
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