Protein–RNA interactions for Protein: Q03973

HMO1, High mobility group protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMO1Q03973 NSR1YGR159C 1245 nt19.39■□□□□ 0.69
HMO1Q03973 YML009W-BYML009W-B 477 nt19■□□□□ 0.63
HMO1Q03973 NOP1YDL014W 984 nt18.2■□□□□ 0.5
HMO1Q03973 MDJ1YFL016C 1536 nt17.85■□□□□ 0.45
HMO1Q03973 YJL027CYJL027C 417 nt16.43■□□□□ 0.22
HMO1Q03973 YKL036CYKL036C 393 nt16.24■□□□□ 0.19
HMO1Q03973 SRX1YKL086W 384 nt15.86■□□□□ 0.13
HMO1Q03973 Q0297Q0297 156 nt15.67■□□□□ 0.1
HMO1Q03973 DBP2YNL112W 1641 nt15.47■□□□□ 0.07
HMO1Q03973 YBR190WYBR190W 312 nt15.37■□□□□ 0.05
HMO1Q03973 YCR051WYCR051W 669 nt15.06■□□□□ 0
HMO1Q03973 RTC3YHR087W 336 nt15.06■□□□□ 0
HMO1Q03973 SSA3YBL075C 1950 nt15.03■□□□□ -0
HMO1Q03973 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.71□□□□□ -0.05
HMO1Q03973 SCS3YGL126W 1143 nt14.64□□□□□ -0.07
HMO1Q03973 CCC1YLR220W 969 nt14.64□□□□□ -0.07
HMO1Q03973 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
HMO1Q03973 PUT4YOR348C 1884 nt14.42□□□□□ -0.1
HMO1Q03973 SCJ1YMR214W 1134 nt14.22□□□□□ -0.13
HMO1Q03973 RPP1BYDL130W 321 nt14.08□□□□□ -0.16
HMO1Q03973 YOL085CYOL085C 342 nt14.06□□□□□ -0.16
HMO1Q03973 ARE1YCR048W 1833 nt13.97□□□□□ -0.17
HMO1Q03973 POA1YBR022W 534 nt13.96□□□□□ -0.17
HMO1Q03973 PKP1YIL042C 1185 nt13.92□□□□□ -0.18
HMO1Q03973 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.83□□□□□ -0.2
HMO1Q03973 SAH1YER043C 1350 nt13.83□□□□□ -0.2
HMO1Q03973 URN1YPR152C 1398 nt13.82□□□□□ -0.2
HMO1Q03973 SHR5YOL110W 714 nt13.79□□□□□ -0.2
HMO1Q03973 BSC6YOL137W 1494 nt13.78□□□□□ -0.2
HMO1Q03973 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.72□□□□□ -0.21
HMO1Q03973 OPI9YLR338W 858 nt13.72□□□□□ -0.21
HMO1Q03973 DEP1YAL013W 1218 nt13.66□□□□□ -0.22
HMO1Q03973 PET122YER153C 765 nt13.54□□□□□ -0.24
HMO1Q03973 SPT5YML010W 3192 nt13.5□□□□□ -0.25
HMO1Q03973 BUD23YCR047C 828 nt13.5□□□□□ -0.25
HMO1Q03973 RPN10YHR200W 807 nt13.49□□□□□ -0.25
HMO1Q03973 SSA4YER103W 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
HMO1Q03973 YNL208WYNL208W 600 nt13.35□□□□□ -0.27
HMO1Q03973 PUN1YLR414C 792 nt13.34□□□□□ -0.27
HMO1Q03973 PTC2YER089C 1395 nt13.31□□□□□ -0.28
HMO1Q03973 YDJ1YNL064C 1230 nt13.26□□□□□ -0.29
HMO1Q03973 SCR1SCR1 522 nt13.25□□□□□ -0.29
HMO1Q03973 NAB2YGL122C 1578 nt13.2□□□□□ -0.3
HMO1Q03973 YJR018WYJR018W 363 nt13.14□□□□□ -0.31
HMO1Q03973 GAR1YHR089C 618 nt13.13□□□□□ -0.31
HMO1Q03973 RRN5YLR141W 1092 nt13.09□□□□□ -0.31
HMO1Q03973 ATS1YAL020C 1002 nt13.02□□□□□ -0.33
HMO1Q03973 MEP2YNL142W 1500 nt12.98□□□□□ -0.33
HMO1Q03973 FPR4YLR449W 1179 nt12.93□□□□□ -0.34
HMO1Q03973 BDF1YLR399C 2061 nt12.92□□□□□ -0.34
HMO1Q03973 FIS1YIL065C 468 nt12.92□□□□□ -0.34
HMO1Q03973 DAL1YIR027C 1383 nt12.91□□□□□ -0.34
HMO1Q03973 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.81□□□□□ -0.36
HMO1Q03973 PHO4YFR034C 939 nt12.79□□□□□ -0.36
HMO1Q03973 DCW1YKL046C 1350 nt12.77□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 INM2YDR287W 879 nt12.75□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 YPS1YLR120C 1710 nt12.74□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 RPP2BYDR382W 333 nt12.74□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 TAT1YBR069C 1860 nt12.74□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 YJR120WYJR120W 351 nt12.73□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.71□□□□□ -0.37
HMO1Q03973 TIR1YER011W 765 nt12.69□□□□□ -0.38
HMO1Q03973 RSB1YOR049C 1065 nt12.66□□□□□ -0.38
HMO1Q03973 SSA1YAL005C 1929 nt12.65□□□□□ -0.38
HMO1Q03973 YMR090WYMR090W 684 nt12.6□□□□□ -0.39
HMO1Q03973 EMI2YDR516C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
HMO1Q03973 YDR095CYDR095C 411 nt12.55□□□□□ -0.4
HMO1Q03973 YBL100CYBL100C 315 nt12.54□□□□□ -0.4
HMO1Q03973 YBR220CYBR220C 1683 nt12.54□□□□□ -0.4
HMO1Q03973 YDL221WYDL221W 552 nt12.43□□□□□ -0.42
HMO1Q03973 PAC11YDR488C 1602 nt12.43□□□□□ -0.42
HMO1Q03973 SDH1YKL148C 1923 nt12.39□□□□□ -0.43
HMO1Q03973 FUN26YAL022C 1554 nt12.36□□□□□ -0.43
HMO1Q03973 ALF1YNL148C 765 nt12.36□□□□□ -0.43
HMO1Q03973 CAC2YML102W 1407 nt12.36□□□□□ -0.43
HMO1Q03973 Q0182Q0182 405 nt12.35□□□□□ -0.43
HMO1Q03973 RPP2AYOL039W 321 nt12.34□□□□□ -0.43
HMO1Q03973 BDH2YAL061W 1254 nt12.32□□□□□ -0.44
HMO1Q03973 PTP1YDL230W 1008 nt12.31□□□□□ -0.44
HMO1Q03973 SRB2YHR041C 633 nt12.29□□□□□ -0.44
HMO1Q03973 SCC4YER147C 1875 nt12.25□□□□□ -0.45
HMO1Q03973 TRM9YML014W 840 nt12.24□□□□□ -0.45
HMO1Q03973 PCH2YBR186W 1695 nt12.23□□□□□ -0.45
HMO1Q03973 SEC11YIR022W 504 nt12.2□□□□□ -0.46
HMO1Q03973 GUT2YIL155C 1950 nt12.18□□□□□ -0.46
HMO1Q03973 IRC15YPL017C 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
HMO1Q03973 GIS3YLR094C 1509 nt12.12□□□□□ -0.47
HMO1Q03973 SIS1YNL007C 1059 nt12.11□□□□□ -0.47
HMO1Q03973 CCT6YDR188W 1641 nt12.11□□□□□ -0.47
HMO1Q03973 PST2YDR032C 597 nt12.09□□□□□ -0.47
HMO1Q03973 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.09□□□□□ -0.47
HMO1Q03973 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.8 ms