Protein–RNA interactions for Protein: P18900

COQ1, Hexaprenyl pyrophosphate synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COQ1P18900 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.02■■□□□ 1.44
COQ1P18900 NSR1YGR159C 1245 nt23.72■■□□□ 1.39
COQ1P18900 NOP1YDL014W 984 nt23.31■■□□□ 1.32
COQ1P18900 YKL036CYKL036C 393 nt21.67■■□□□ 1.06
COQ1P18900 MDJ1YFL016C 1536 nt21.04■□□□□ 0.96
COQ1P18900 Q0297Q0297 156 nt20.5■□□□□ 0.87
COQ1P18900 SRX1YKL086W 384 nt20.42■□□□□ 0.86
COQ1P18900 YJL027CYJL027C 417 nt20.27■□□□□ 0.84
COQ1P18900 SCS3YGL126W 1143 nt19.82■□□□□ 0.76
COQ1P18900 YCR051WYCR051W 669 nt19.41■□□□□ 0.7
COQ1P18900 YOL085CYOL085C 342 nt18.82■□□□□ 0.6
COQ1P18900 DBP2YNL112W 1641 nt18.67■□□□□ 0.58
COQ1P18900 PKP1YIL042C 1185 nt18.57■□□□□ 0.56
COQ1P18900 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.4■□□□□ 0.54
COQ1P18900 RPP1BYDL130W 321 nt18.39■□□□□ 0.53
COQ1P18900 CCC1YLR220W 969 nt18.28■□□□□ 0.52
COQ1P18900 YBR190WYBR190W 312 nt17.83■□□□□ 0.44
COQ1P18900 ATS1YAL020C 1002 nt17.76■□□□□ 0.43
COQ1P18900 PET122YER153C 765 nt17.61■□□□□ 0.41
COQ1P18900 SCJ1YMR214W 1134 nt17.61■□□□□ 0.41
COQ1P18900 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.47■□□□□ 0.39
COQ1P18900 RTC3YHR087W 336 nt17.47■□□□□ 0.39
COQ1P18900 RVS167YDR388W 1449 nt17.45■□□□□ 0.38
COQ1P18900 SCR1SCR1 522 nt17.36■□□□□ 0.37
COQ1P18900 RRN5YLR141W 1092 nt17.13■□□□□ 0.33
COQ1P18900 SHR5YOL110W 714 nt16.91■□□□□ 0.3
COQ1P18900 YDJ1YNL064C 1230 nt16.86■□□□□ 0.29
COQ1P18900 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.78■□□□□ 0.28
COQ1P18900 RSB1YOR049C 1065 nt16.77■□□□□ 0.28
COQ1P18900 GAR1YHR089C 618 nt16.52■□□□□ 0.24
COQ1P18900 DEP1YAL013W 1218 nt16.49■□□□□ 0.23
COQ1P18900 PST2YDR032C 597 nt16.45■□□□□ 0.22
COQ1P18900 URN1YPR152C 1398 nt16.4■□□□□ 0.22
COQ1P18900 YNL208WYNL208W 600 nt16.15■□□□□ 0.18
COQ1P18900 PUT4YOR348C 1884 nt16.14■□□□□ 0.17
COQ1P18900 OPI9YLR338W 858 nt16.12■□□□□ 0.17
COQ1P18900 RPN10YHR200W 807 nt16.09■□□□□ 0.17
COQ1P18900 SAH1YER043C 1350 nt16.04■□□□□ 0.16
COQ1P18900 TIR1YER011W 765 nt15.94■□□□□ 0.14
COQ1P18900 ARE1YCR048W 1833 nt15.91■□□□□ 0.14
COQ1P18900 YKL097CYKL097C 411 nt15.81■□□□□ 0.12
COQ1P18900 SSA1YAL005C 1929 nt15.77■□□□□ 0.12
COQ1P18900 SHU1YHL006C 453 nt15.77■□□□□ 0.12
COQ1P18900 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.68■□□□□ 0.1
COQ1P18900 POA1YBR022W 534 nt15.68■□□□□ 0.1
COQ1P18900 YJR018WYJR018W 363 nt15.65■□□□□ 0.1
COQ1P18900 SRB2YHR041C 633 nt15.62■□□□□ 0.09
COQ1P18900 PUN1YLR414C 792 nt15.62■□□□□ 0.09
COQ1P18900 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.55■□□□□ 0.08
COQ1P18900 YJR120WYJR120W 351 nt15.52■□□□□ 0.08
COQ1P18900 PTC2YER089C 1395 nt15.48■□□□□ 0.07
COQ1P18900 BUD23YCR047C 828 nt15.33■□□□□ 0.04
COQ1P18900 WWM1YFL010C 636 nt15.31■□□□□ 0.04
COQ1P18900 RPP2BYDR382W 333 nt15.3■□□□□ 0.04
COQ1P18900 BSC6YOL137W 1494 nt15.29■□□□□ 0.04
COQ1P18900 YOR139CYOR139C 393 nt15.24■□□□□ 0.03
COQ1P18900 NAB2YGL122C 1578 nt15.2■□□□□ 0.02
COQ1P18900 HOM6YJR139C 1080 nt15.17■□□□□ 0.02
COQ1P18900 MNP1YGL068W 585 nt15.16■□□□□ 0.02
COQ1P18900 YGR021WYGR021W 873 nt15.14■□□□□ 0.01
COQ1P18900 SSA3YBL075C 1950 nt15.11■□□□□ 0.01
COQ1P18900 BDH2YAL061W 1254 nt15.06■□□□□ 0
COQ1P18900 FIS1YIL065C 468 nt15.05■□□□□ -0
COQ1P18900 FPR4YLR449W 1179 nt15.05■□□□□ -0
COQ1P18900 DAL1YIR027C 1383 nt15.04■□□□□ -0
COQ1P18900 INM2YDR287W 879 nt15.04■□□□□ -0
COQ1P18900 NPL3YDR432W 1245 nt14.99□□□□□ -0.01
COQ1P18900 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.98□□□□□ -0.01
COQ1P18900 RKM5YLR137W 1104 nt14.94□□□□□ -0.02
COQ1P18900 YBL100CYBL100C 315 nt14.94□□□□□ -0.02
COQ1P18900 PHO4YFR034C 939 nt14.91□□□□□ -0.02
COQ1P18900 LSM3YLR438C-A 270 nt14.87□□□□□ -0.03
COQ1P18900 YOL037CYOL037C 354 nt14.83□□□□□ -0.04
COQ1P18900 FUN26YAL022C 1554 nt14.79□□□□□ -0.04
COQ1P18900 TRM9YML014W 840 nt14.76□□□□□ -0.05
COQ1P18900 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.63□□□□□ -0.07
COQ1P18900 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.63□□□□□ -0.07
COQ1P18900 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.63□□□□□ -0.07
COQ1P18900 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.63□□□□□ -0.07
COQ1P18900 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.63□□□□□ -0.07
COQ1P18900 CCT6YDR188W 1641 nt14.59□□□□□ -0.07
COQ1P18900 YPS1YLR120C 1710 nt14.58□□□□□ -0.08
COQ1P18900 YLR281CYLR281C 468 nt14.56□□□□□ -0.08
COQ1P18900 YDR095CYDR095C 411 nt14.5□□□□□ -0.09
COQ1P18900 ALF1YNL148C 765 nt14.5□□□□□ -0.09
COQ1P18900 WHI5YOR083W 888 nt14.5□□□□□ -0.09
COQ1P18900 SPT5YML010W 3192 nt14.48□□□□□ -0.09
COQ1P18900 PUS2YGL063W 1113 nt14.48□□□□□ -0.09
COQ1P18900 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.4□□□□□ -0.1
COQ1P18900 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.4□□□□□ -0.1
COQ1P18900 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.4□□□□□ -0.1
COQ1P18900 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms