RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	YKL100C	P34248	587 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SAD1	P43589	448 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	NUP100	Q02629	959 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	NGL3	Q03210	505 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	NMD4	Q12129	218 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SPE4	Q12455	300 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	IMG1	P25626	169 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	FET5	P43561	622 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RSM23	Q01163	450 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	TAH18	Q12181	623 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	HNM1	P19807	563 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	BOS1	P25385	244 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SYN8	P31377	255 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	IMP2'	P32351	346 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	NUP133	P36161	1157 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	ICS2	P38284	255 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	ERG7	P38604	731 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	BZZ1	P38822	633 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	LCL3	P53153	274 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YMR160W	Q03823	816 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RCN2	Q12044	265 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SNC1	P31109	117 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	PHD1	P36093	366 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	MIC60	P36112	540 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	ROT2	P38138	954 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SSK1	Q07084	712 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SGF29	P25554	259 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YBR144C	P34215	104 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	LAG1	P38703	411 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YND1	P40009	630 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	ATG27	P46989	271 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	VID30	P53076	958 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	DSD1	P53095	428 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SMA1	Q02651	245 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YEH1	Q07804	573 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	CTI6	Q08923	506 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	BSC1	Q12140	328 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RRI2	Q12348	645 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	CCT6	P39079	546 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YIR014W	P40570	242 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SCS3	P53012	380 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	ARP6	Q12509	438 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YPT6	Q99260	215 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	TRS65	P32893	560 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SWE1	P32944	819 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SGS1	P35187	1447 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	UBP11	P36026	717 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	CIN4	P39110	191 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	AZF1	P41696	914 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	MRX6	P48564	524 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	DUG3	P53871	357 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	CDC45	Q08032	650 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	GCN4	P03069	281 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	TYR1	P20049	452 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	PEP3	P27801	918 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SEF1	P34228	1148 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SPC34	P36131	295 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	REG2	P38232	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	ALG5	P40350	334 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YGR066C	P53242	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	MSS11	Q03825	758 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	SDH5	Q08230	162 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPC24	YMR117C	BAR1	P12630	587 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	CBS1	P14066	229 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
SPC24	YMR117C	YAT2	P40017	923 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	AXL1	P40851	1208 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	SNG1	P46950	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YGL082W	P53155	381 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	CUL3	P53202	744 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YGR126W	P53274	230 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	MSC1	Q03104	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6

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