Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.45■■□□□ 1.66
CTI6Q08923 NOP1YDL014W 984 nt24.97■■□□□ 1.59
CTI6Q08923 NSR1YGR159C 1245 nt24.87■■□□□ 1.57
CTI6Q08923 YKL036CYKL036C 393 nt23.61■■□□□ 1.37
CTI6Q08923 Q0297Q0297 156 nt22.13■■□□□ 1.13
CTI6Q08923 YJL027CYJL027C 417 nt22.12■■□□□ 1.13
CTI6Q08923 SRX1YKL086W 384 nt21.89■■□□□ 1.09
CTI6Q08923 SCS3YGL126W 1143 nt21.8■■□□□ 1.08
CTI6Q08923 MDJ1YFL016C 1536 nt21.53■■□□□ 1.04
CTI6Q08923 YCR051WYCR051W 669 nt20.75■□□□□ 0.91
CTI6Q08923 YOL085CYOL085C 342 nt20.48■□□□□ 0.87
CTI6Q08923 PKP1YIL042C 1185 nt20.07■□□□□ 0.8
CTI6Q08923 SCJ1YMR214W 1134 nt20.04■□□□□ 0.8
CTI6Q08923 RPP1BYDL130W 321 nt19.84■□□□□ 0.77
CTI6Q08923 ATS1YAL020C 1002 nt19.69■□□□□ 0.74
CTI6Q08923 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.45■□□□□ 0.7
CTI6Q08923 DBP2YNL112W 1641 nt19.37■□□□□ 0.69
CTI6Q08923 CCC1YLR220W 969 nt19.22■□□□□ 0.67
CTI6Q08923 PET122YER153C 765 nt18.89■□□□□ 0.61
CTI6Q08923 SCR1SCR1 522 nt18.77■□□□□ 0.6
CTI6Q08923 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.6■□□□□ 0.57
CTI6Q08923 RRN5YLR141W 1092 nt18.42■□□□□ 0.54
CTI6Q08923 YBR190WYBR190W 312 nt18.21■□□□□ 0.51
CTI6Q08923 RTC3YHR087W 336 nt18.19■□□□□ 0.5
CTI6Q08923 RVS167YDR388W 1449 nt18.18■□□□□ 0.5
CTI6Q08923 PST2YDR032C 597 nt18.17■□□□□ 0.5
CTI6Q08923 RSB1YOR049C 1065 nt18.14■□□□□ 0.49
CTI6Q08923 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.08■□□□□ 0.48
CTI6Q08923 YDJ1YNL064C 1230 nt17.99■□□□□ 0.47
CTI6Q08923 SHR5YOL110W 714 nt17.74■□□□□ 0.43
CTI6Q08923 YKL097CYKL097C 411 nt17.66■□□□□ 0.42
CTI6Q08923 GAR1YHR089C 618 nt17.46■□□□□ 0.39
CTI6Q08923 SHU1YHL006C 453 nt17.28■□□□□ 0.36
CTI6Q08923 DEP1YAL013W 1218 nt17.05■□□□□ 0.32
CTI6Q08923 YOR139CYOR139C 393 nt16.95■□□□□ 0.3
CTI6Q08923 URN1YPR152C 1398 nt16.89■□□□□ 0.3
CTI6Q08923 TIR1YER011W 765 nt16.87■□□□□ 0.29
CTI6Q08923 YNL208WYNL208W 600 nt16.84■□□□□ 0.29
CTI6Q08923 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.83■□□□□ 0.28
CTI6Q08923 RPN10YHR200W 807 nt16.7■□□□□ 0.26
CTI6Q08923 SSA1YAL005C 1929 nt16.59■□□□□ 0.25
CTI6Q08923 OPI9YLR338W 858 nt16.56■□□□□ 0.24
CTI6Q08923 NPL3YDR432W 1245 nt16.55■□□□□ 0.24
CTI6Q08923 SRB2YHR041C 633 nt16.49■□□□□ 0.23
CTI6Q08923 HOM6YJR139C 1080 nt16.31■□□□□ 0.2
CTI6Q08923 SAH1YER043C 1350 nt16.3■□□□□ 0.2
CTI6Q08923 MNP1YGL068W 585 nt16.28■□□□□ 0.2
CTI6Q08923 YGR021WYGR021W 873 nt16.26■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 WWM1YFL010C 636 nt16.25■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.25■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.25■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.25■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.25■□□□□ 0.19
CTI6Q08923 YOL037CYOL037C 354 nt16.2■□□□□ 0.18
CTI6Q08923 YJR018WYJR018W 363 nt16.16■□□□□ 0.18
CTI6Q08923 PUT4YOR348C 1884 nt16.14■□□□□ 0.17
CTI6Q08923 YJR120WYJR120W 351 nt16.13■□□□□ 0.17
CTI6Q08923 SSA3YBL075C 1950 nt16.07■□□□□ 0.16
CTI6Q08923 RKM5YLR137W 1104 nt16.04■□□□□ 0.16
CTI6Q08923 PUN1YLR414C 792 nt16.04■□□□□ 0.16
CTI6Q08923 ARE1YCR048W 1833 nt16.03■□□□□ 0.16
CTI6Q08923 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.94■□□□□ 0.14
CTI6Q08923 RPP2BYDR382W 333 nt15.92■□□□□ 0.14
CTI6Q08923 YLR281CYLR281C 468 nt15.87■□□□□ 0.13
CTI6Q08923 PUS2YGL063W 1113 nt15.86■□□□□ 0.13
CTI6Q08923 MOT3YMR070W 1473 nt15.8■□□□□ 0.12
CTI6Q08923 BDH2YAL061W 1254 nt15.77■□□□□ 0.12
CTI6Q08923 PTC2YER089C 1395 nt15.76■□□□□ 0.11
CTI6Q08923 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.74■□□□□ 0.11
CTI6Q08923 WHI5YOR083W 888 nt15.7■□□□□ 0.1
CTI6Q08923 LSM3YLR438C-A 270 nt15.69■□□□□ 0.1
CTI6Q08923 POA1YBR022W 534 nt15.66■□□□□ 0.1
CTI6Q08923 YPR011CYPR011C 981 nt15.55■□□□□ 0.08
CTI6Q08923 INM2YDR287W 879 nt15.51■□□□□ 0.07
CTI6Q08923 BSC6YOL137W 1494 nt15.51■□□□□ 0.07
CTI6Q08923 NAB2YGL122C 1578 nt15.48■□□□□ 0.07
CTI6Q08923 FMP45YDL222C 930 nt15.43■□□□□ 0.06
CTI6Q08923 YBL100CYBL100C 315 nt15.43■□□□□ 0.06
CTI6Q08923 BUD23YCR047C 828 nt15.4■□□□□ 0.06
CTI6Q08923 DSK2YMR276W 1122 nt15.4■□□□□ 0.06
CTI6Q08923 MRPL8YJL063C 717 nt15.39■□□□□ 0.05
CTI6Q08923 YLR236CYLR236C 324 nt15.39■□□□□ 0.05
CTI6Q08923 DAL1YIR027C 1383 nt15.38■□□□□ 0.05
CTI6Q08923 TRM9YML014W 840 nt15.35■□□□□ 0.05
CTI6Q08923 YCH1YGR203W 447 nt15.34■□□□□ 0.05
CTI6Q08923 FIS1YIL065C 468 nt15.34■□□□□ 0.05
CTI6Q08923 IMP2'YIL154C 1041 nt15.31■□□□□ 0.04
CTI6Q08923 FPR4YLR449W 1179 nt15.31■□□□□ 0.04
CTI6Q08923 FUN26YAL022C 1554 nt15.3■□□□□ 0.04
CTI6Q08923 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.27■□□□□ 0.04
CTI6Q08923 PHO4YFR034C 939 nt15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms