Protein–RNA interactions for Protein: P03069

GCN4, General control protein GCN4, yeastyeast

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4P03069 NSR1YGR159C 1245 nt17.94■□□□□ 0.46
GCN4P03069 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.63■□□□□ 0.41
GCN4P03069 NOP1YDL014W 984 nt17.01■□□□□ 0.31
GCN4P03069 MDJ1YFL016C 1536 nt16.27■□□□□ 0.2
GCN4P03069 YKL036CYKL036C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
GCN4P03069 YJL027CYJL027C 417 nt15□□□□□ -0.01
GCN4P03069 SRX1YKL086W 384 nt14.85□□□□□ -0.03
GCN4P03069 Q0297Q0297 156 nt14.75□□□□□ -0.05
GCN4P03069 DBP2YNL112W 1641 nt14.25□□□□□ -0.13
GCN4P03069 YCR051WYCR051W 669 nt14.03□□□□□ -0.16
GCN4P03069 YBR190WYBR190W 312 nt14.03□□□□□ -0.16
GCN4P03069 SSA3YBL075C 1950 nt13.91□□□□□ -0.18
GCN4P03069 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 RTC3YHR087W 336 nt13.67□□□□□ -0.22
GCN4P03069 SCS3YGL126W 1143 nt13.66□□□□□ -0.22
GCN4P03069 CCC1YLR220W 969 nt13.5□□□□□ -0.25
GCN4P03069 RVS167YDR388W 1449 nt13.31□□□□□ -0.28
GCN4P03069 YOL085CYOL085C 342 nt13.25□□□□□ -0.29
GCN4P03069 RPP1BYDL130W 321 nt13.22□□□□□ -0.29
GCN4P03069 SCJ1YMR214W 1134 nt13.11□□□□□ -0.31
GCN4P03069 PKP1YIL042C 1185 nt13.07□□□□□ -0.32
GCN4P03069 PUT4YOR348C 1884 nt13.05□□□□□ -0.32
GCN4P03069 Q0182Q0182 405 nt12.96□□□□□ -0.33
GCN4P03069 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.79□□□□□ -0.36
GCN4P03069 SHR5YOL110W 714 nt12.75□□□□□ -0.37
GCN4P03069 ARE1YCR048W 1833 nt12.68□□□□□ -0.38
GCN4P03069 PET122YER153C 765 nt12.67□□□□□ -0.38
GCN4P03069 URN1YPR152C 1398 nt12.64□□□□□ -0.39
GCN4P03069 POA1YBR022W 534 nt12.6□□□□□ -0.39
GCN4P03069 SAH1YER043C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
GCN4P03069 OPI9YLR338W 858 nt12.56□□□□□ -0.4
GCN4P03069 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.5□□□□□ -0.41
GCN4P03069 DEP1YAL013W 1218 nt12.49□□□□□ -0.41
GCN4P03069 SCR1SCR1 522 nt12.44□□□□□ -0.42
GCN4P03069 YDJ1YNL064C 1230 nt12.41□□□□□ -0.42
GCN4P03069 BSC6YOL137W 1494 nt12.4□□□□□ -0.42
GCN4P03069 RPN10YHR200W 807 nt12.38□□□□□ -0.43
GCN4P03069 YNL208WYNL208W 600 nt12.29□□□□□ -0.44
GCN4P03069 RRN5YLR141W 1092 nt12.27□□□□□ -0.45
GCN4P03069 SPT5YML010W 3192 nt12.26□□□□□ -0.45
GCN4P03069 MOT3YMR070W 1473 nt12.25□□□□□ -0.45
GCN4P03069 SSA4YER103W 1929 nt12.24□□□□□ -0.45
GCN4P03069 PUN1YLR414C 792 nt12.2□□□□□ -0.46
GCN4P03069 BUD23YCR047C 828 nt12.17□□□□□ -0.46
GCN4P03069 GAR1YHR089C 618 nt12.15□□□□□ -0.46
GCN4P03069 ATS1YAL020C 1002 nt12.12□□□□□ -0.47
GCN4P03069 PTC2YER089C 1395 nt12.11□□□□□ -0.47
GCN4P03069 YJR018WYJR018W 363 nt12.04□□□□□ -0.48
GCN4P03069 NAB2YGL122C 1578 nt12.02□□□□□ -0.49
GCN4P03069 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.02□□□□□ -0.49
GCN4P03069 RSB1YOR049C 1065 nt11.87□□□□□ -0.51
GCN4P03069 BDF1YLR399C 2061 nt11.83□□□□□ -0.51
GCN4P03069 TIR1YER011W 765 nt11.78□□□□□ -0.52
GCN4P03069 FIS1YIL065C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
GCN4P03069 DAL1YIR027C 1383 nt11.78□□□□□ -0.52
GCN4P03069 YJR120WYJR120W 351 nt11.75□□□□□ -0.53
GCN4P03069 SSA1YAL005C 1929 nt11.72□□□□□ -0.53
GCN4P03069 FPR4YLR449W 1179 nt11.71□□□□□ -0.53
GCN4P03069 MEP2YNL142W 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
GCN4P03069 RPP2BYDR382W 333 nt11.7□□□□□ -0.54
GCN4P03069 INM2YDR287W 879 nt11.69□□□□□ -0.54
GCN4P03069 TAT1YBR069C 1860 nt11.66□□□□□ -0.54
GCN4P03069 PHO4YFR034C 939 nt11.65□□□□□ -0.54
GCN4P03069 PAC11YDR488C 1602 nt11.61□□□□□ -0.55
GCN4P03069 YPS1YLR120C 1710 nt11.59□□□□□ -0.55
GCN4P03069 NVJ2YPR091C 2313 nt11.49□□□□□ -0.57
GCN4P03069 YBL100CYBL100C 315 nt11.48□□□□□ -0.57
GCN4P03069 DCW1YKL046C 1350 nt11.48□□□□□ -0.57
GCN4P03069 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.47□□□□□ -0.57
GCN4P03069 YDR095CYDR095C 411 nt11.45□□□□□ -0.58
GCN4P03069 SRB2YHR041C 633 nt11.41□□□□□ -0.58
GCN4P03069 BDH2YAL061W 1254 nt11.39□□□□□ -0.59
GCN4P03069 FPS1YLL043W 2010 nt11.38□□□□□ -0.59
GCN4P03069 YMR090WYMR090W 684 nt11.35□□□□□ -0.59
GCN4P03069 EMI2YDR516C 1503 nt11.35□□□□□ -0.59
GCN4P03069 FUN26YAL022C 1554 nt11.33□□□□□ -0.6
GCN4P03069 YBR220CYBR220C 1683 nt11.31□□□□□ -0.6
GCN4P03069 PST2YDR032C 597 nt11.3□□□□□ -0.6
GCN4P03069 ALF1YNL148C 765 nt11.26□□□□□ -0.61
GCN4P03069 TRM9YML014W 840 nt11.25□□□□□ -0.61
GCN4P03069 RPP2AYOL039W 321 nt11.24□□□□□ -0.61
GCN4P03069 YDL221WYDL221W 552 nt11.23□□□□□ -0.61
GCN4P03069 PTP1YDL230W 1008 nt11.23□□□□□ -0.61
GCN4P03069 CAC2YML102W 1407 nt11.2□□□□□ -0.62
GCN4P03069 WWM1YFL010C 636 nt11.18□□□□□ -0.62
GCN4P03069 LSM3YLR438C-A 270 nt11.18□□□□□ -0.62
GCN4P03069 SDH1YKL148C 1923 nt11.17□□□□□ -0.62
GCN4P03069 CCT6YDR188W 1641 nt11.16□□□□□ -0.62
GCN4P03069 SIS1YNL007C 1059 nt11.12□□□□□ -0.63
GCN4P03069 PCH2YBR186W 1695 nt11.11□□□□□ -0.63
GCN4P03069 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.1□□□□□ -0.63
GCN4P03069 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.1□□□□□ -0.63
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