Protein–RNA interactions for Protein: P36131

SPC34, DASH complex subunit SPC34, yeastyeast

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC34P36131 NSR1YGR159C 1245 nt19.13■□□□□ 0.65
SPC34P36131 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.82■□□□□ 0.6
SPC34P36131 NOP1YDL014W 984 nt18.14■□□□□ 0.49
SPC34P36131 MDJ1YFL016C 1536 nt17.37■□□□□ 0.37
SPC34P36131 YKL036CYKL036C 393 nt16.31■□□□□ 0.2
SPC34P36131 YJL027CYJL027C 417 nt16.01■□□□□ 0.15
SPC34P36131 SRX1YKL086W 384 nt15.85■□□□□ 0.13
SPC34P36131 Q0297Q0297 156 nt15.74■□□□□ 0.11
SPC34P36131 DBP2YNL112W 1641 nt15.21■□□□□ 0.02
SPC34P36131 YCR051WYCR051W 669 nt14.97□□□□□ -0.01
SPC34P36131 YBR190WYBR190W 312 nt14.97□□□□□ -0.01
SPC34P36131 SCS3YGL126W 1143 nt14.61□□□□□ -0.07
SPC34P36131 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.6□□□□□ -0.07
SPC34P36131 RTC3YHR087W 336 nt14.57□□□□□ -0.08
SPC34P36131 CCC1YLR220W 969 nt14.4□□□□□ -0.1
SPC34P36131 RVS167YDR388W 1449 nt14.21□□□□□ -0.13
SPC34P36131 YOL085CYOL085C 342 nt14.13□□□□□ -0.15
SPC34P36131 RPP1BYDL130W 321 nt14.11□□□□□ -0.15
SPC34P36131 SSA3YBL075C 1950 nt14.1□□□□□ -0.15
SPC34P36131 SCJ1YMR214W 1134 nt14.03□□□□□ -0.16
SPC34P36131 PKP1YIL042C 1185 nt13.94□□□□□ -0.18
SPC34P36131 PUT4YOR348C 1884 nt13.93□□□□□ -0.18
SPC34P36131 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.64□□□□□ -0.23
SPC34P36131 SHR5YOL110W 714 nt13.61□□□□□ -0.23
SPC34P36131 ARE1YCR048W 1833 nt13.54□□□□□ -0.24
SPC34P36131 PET122YER153C 765 nt13.52□□□□□ -0.25
SPC34P36131 URN1YPR152C 1398 nt13.49□□□□□ -0.25
SPC34P36131 POA1YBR022W 534 nt13.43□□□□□ -0.26
SPC34P36131 OPI9YLR338W 858 nt13.41□□□□□ -0.26
SPC34P36131 SAH1YER043C 1350 nt13.41□□□□□ -0.26
SPC34P36131 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.36□□□□□ -0.27
SPC34P36131 DEP1YAL013W 1218 nt13.32□□□□□ -0.28
SPC34P36131 SCR1SCR1 522 nt13.27□□□□□ -0.29
SPC34P36131 BSC6YOL137W 1494 nt13.24□□□□□ -0.29
SPC34P36131 YDJ1YNL064C 1230 nt13.23□□□□□ -0.29
SPC34P36131 RPN10YHR200W 807 nt13.22□□□□□ -0.29
SPC34P36131 YNL208WYNL208W 600 nt13.11□□□□□ -0.31
SPC34P36131 RRN5YLR141W 1092 nt13.07□□□□□ -0.32
SPC34P36131 PUN1YLR414C 792 nt13.02□□□□□ -0.33
SPC34P36131 SPT5YML010W 3192 nt13□□□□□ -0.33
SPC34P36131 BUD23YCR047C 828 nt12.99□□□□□ -0.33
SPC34P36131 GAR1YHR089C 618 nt12.96□□□□□ -0.33
SPC34P36131 ATS1YAL020C 1002 nt12.93□□□□□ -0.34
SPC34P36131 PTC2YER089C 1395 nt12.91□□□□□ -0.34
SPC34P36131 YJR018WYJR018W 363 nt12.84□□□□□ -0.35
SPC34P36131 NAB2YGL122C 1578 nt12.82□□□□□ -0.36
SPC34P36131 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.82□□□□□ -0.36
SPC34P36131 SSA4YER103W 1929 nt12.72□□□□□ -0.37
SPC34P36131 RSB1YOR049C 1065 nt12.67□□□□□ -0.38
SPC34P36131 FIS1YIL065C 468 nt12.61□□□□□ -0.39
SPC34P36131 DAL1YIR027C 1383 nt12.57□□□□□ -0.4
SPC34P36131 TIR1YER011W 765 nt12.57□□□□□ -0.4
SPC34P36131 YJR120WYJR120W 351 nt12.56□□□□□ -0.4
SPC34P36131 SSA1YAL005C 1929 nt12.5□□□□□ -0.41
SPC34P36131 MEP2YNL142W 1500 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC34P36131 FPR4YLR449W 1179 nt12.48□□□□□ -0.41
SPC34P36131 RPP2BYDR382W 333 nt12.47□□□□□ -0.41
SPC34P36131 INM2YDR287W 879 nt12.46□□□□□ -0.41
SPC34P36131 PHO4YFR034C 939 nt12.45□□□□□ -0.42
SPC34P36131 YPS1YLR120C 1710 nt12.38□□□□□ -0.43
SPC34P36131 BDF1YLR399C 2061 nt12.3□□□□□ -0.44
SPC34P36131 YBL100CYBL100C 315 nt12.26□□□□□ -0.45
SPC34P36131 DCW1YKL046C 1350 nt12.26□□□□□ -0.45
SPC34P36131 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.24□□□□□ -0.45
SPC34P36131 YDR095CYDR095C 411 nt12.23□□□□□ -0.45
SPC34P36131 SRB2YHR041C 633 nt12.19□□□□□ -0.46
SPC34P36131 BDH2YAL061W 1254 nt12.16□□□□□ -0.46
SPC34P36131 TAT1YBR069C 1860 nt12.13□□□□□ -0.47
SPC34P36131 EMI2YDR516C 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
SPC34P36131 FUN26YAL022C 1554 nt12.09□□□□□ -0.47
SPC34P36131 YMR090WYMR090W 684 nt12.07□□□□□ -0.48
SPC34P36131 PST2YDR032C 597 nt12.06□□□□□ -0.48
SPC34P36131 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
SPC34P36131 ALF1YNL148C 765 nt12.01□□□□□ -0.49
SPC34P36131 RPP2AYOL039W 321 nt12□□□□□ -0.49
SPC34P36131 YDL221WYDL221W 552 nt11.99□□□□□ -0.49
SPC34P36131 PTP1YDL230W 1008 nt11.99□□□□□ -0.49
SPC34P36131 TRM9YML014W 840 nt11.99□□□□□ -0.49
SPC34P36131 CAC2YML102W 1407 nt11.95□□□□□ -0.5
SPC34P36131 WWM1YFL010C 636 nt11.93□□□□□ -0.5
SPC34P36131 SDH1YKL148C 1923 nt11.93□□□□□ -0.5
SPC34P36131 LSM3YLR438C-A 270 nt11.92□□□□□ -0.5
SPC34P36131 CCT6YDR188W 1641 nt11.91□□□□□ -0.5
SPC34P36131 SIS1YNL007C 1059 nt11.86□□□□□ -0.51
SPC34P36131 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SPC34P36131 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.85□□□□□ -0.51
SPC34P36131 IRC15YPL017C 1500 nt11.79□□□□□ -0.52
SPC34P36131 SCC4YER147C 1875 nt11.78□□□□□ -0.52
SPC34P36131 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.78□□□□□ -0.52
SPC34P36131 YGR021WYGR021W 873 nt11.76□□□□□ -0.53
SPC34P36131 GIS3YLR094C 1509 nt11.7□□□□□ -0.54
SPC34P36131 GFD2YCL036W 1701 nt11.69□□□□□ -0.54
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