Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 NSR1YGR159C 1245 nt20.33■□□□□ 0.85
SPE4Q12455 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.16■□□□□ 0.82
SPE4Q12455 NOP1YDL014W 984 nt19.43■□□□□ 0.7
SPE4Q12455 MDJ1YFL016C 1536 nt18.44■□□□□ 0.54
SPE4Q12455 YKL036CYKL036C 393 nt17.58■□□□□ 0.4
SPE4Q12455 YJL027CYJL027C 417 nt16.97■□□□□ 0.31
SPE4Q12455 SRX1YKL086W 384 nt16.97■□□□□ 0.31
SPE4Q12455 Q0297Q0297 156 nt16.87■□□□□ 0.29
SPE4Q12455 DBP2YNL112W 1641 nt16.15■□□□□ 0.18
SPE4Q12455 YCR051WYCR051W 669 nt16.09■□□□□ 0.17
SPE4Q12455 SCS3YGL126W 1143 nt15.8■□□□□ 0.12
SPE4Q12455 YBR190WYBR190W 312 nt15.8■□□□□ 0.12
SPE4Q12455 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE4Q12455 RTC3YHR087W 336 nt15.45■□□□□ 0.06
SPE4Q12455 CCC1YLR220W 969 nt15.43■□□□□ 0.06
SPE4Q12455 YOL085CYOL085C 342 nt15.23■□□□□ 0.03
SPE4Q12455 RPP1BYDL130W 321 nt15.15■□□□□ 0.02
SPE4Q12455 RVS167YDR388W 1449 nt15.11■□□□□ 0.01
SPE4Q12455 PKP1YIL042C 1185 nt15.06■□□□□ 0
SPE4Q12455 SCJ1YMR214W 1134 nt14.96□□□□□ -0.01
SPE4Q12455 PUT4YOR348C 1884 nt14.64□□□□□ -0.07
SPE4Q12455 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
SPE4Q12455 SSA3YBL075C 1950 nt14.56□□□□□ -0.08
SPE4Q12455 PET122YER153C 765 nt14.53□□□□□ -0.08
SPE4Q12455 SHR5YOL110W 714 nt14.49□□□□□ -0.09
SPE4Q12455 URN1YPR152C 1398 nt14.33□□□□□ -0.12
SPE4Q12455 SCR1SCR1 522 nt14.27□□□□□ -0.13
SPE4Q12455 ARE1YCR048W 1833 nt14.27□□□□□ -0.13
SPE4Q12455 DEP1YAL013W 1218 nt14.22□□□□□ -0.13
SPE4Q12455 SAH1YER043C 1350 nt14.2□□□□□ -0.14
SPE4Q12455 OPI9YLR338W 858 nt14.18□□□□□ -0.14
SPE4Q12455 POA1YBR022W 534 nt14.16□□□□□ -0.14
SPE4Q12455 YDJ1YNL064C 1230 nt14.12□□□□□ -0.15
SPE4Q12455 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.1□□□□□ -0.15
SPE4Q12455 RRN5YLR141W 1092 nt14.06□□□□□ -0.16
SPE4Q12455 RPN10YHR200W 807 nt14.03□□□□□ -0.16
SPE4Q12455 ATS1YAL020C 1002 nt14.02□□□□□ -0.17
SPE4Q12455 YNL208WYNL208W 600 nt13.94□□□□□ -0.18
SPE4Q12455 BSC6YOL137W 1494 nt13.93□□□□□ -0.18
SPE4Q12455 GAR1YHR089C 618 nt13.89□□□□□ -0.19
SPE4Q12455 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.78□□□□□ -0.2
SPE4Q12455 PUN1YLR414C 792 nt13.77□□□□□ -0.21
SPE4Q12455 BUD23YCR047C 828 nt13.75□□□□□ -0.21
SPE4Q12455 RSB1YOR049C 1065 nt13.68□□□□□ -0.22
SPE4Q12455 PTC2YER089C 1395 nt13.67□□□□□ -0.22
SPE4Q12455 YJR018WYJR018W 363 nt13.63□□□□□ -0.23
SPE4Q12455 NAB2YGL122C 1578 nt13.54□□□□□ -0.24
SPE4Q12455 SPT5YML010W 3192 nt13.52□□□□□ -0.25
SPE4Q12455 TIR1YER011W 765 nt13.44□□□□□ -0.26
SPE4Q12455 SSA1YAL005C 1929 nt13.35□□□□□ -0.27
SPE4Q12455 YJR120WYJR120W 351 nt13.34□□□□□ -0.27
SPE4Q12455 FIS1YIL065C 468 nt13.32□□□□□ -0.28
SPE4Q12455 DAL1YIR027C 1383 nt13.29□□□□□ -0.28
SPE4Q12455 FPR4YLR449W 1179 nt13.28□□□□□ -0.28
SPE4Q12455 RPP2BYDR382W 333 nt13.26□□□□□ -0.29
SPE4Q12455 SSA4YER103W 1929 nt13.23□□□□□ -0.29
SPE4Q12455 INM2YDR287W 879 nt13.18□□□□□ -0.3
SPE4Q12455 PHO4YFR034C 939 nt13.18□□□□□ -0.3
SPE4Q12455 MEP2YNL142W 1500 nt13.11□□□□□ -0.31
SPE4Q12455 SRB2YHR041C 633 nt13.06□□□□□ -0.32
SPE4Q12455 PST2YDR032C 597 nt13.04□□□□□ -0.32
SPE4Q12455 YPS1YLR120C 1710 nt13.04□□□□□ -0.32
SPE4Q12455 YBL100CYBL100C 315 nt13.02□□□□□ -0.33
SPE4Q12455 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.94□□□□□ -0.34
SPE4Q12455 BDH2YAL061W 1254 nt12.93□□□□□ -0.34
SPE4Q12455 YDR095CYDR095C 411 nt12.9□□□□□ -0.34
SPE4Q12455 DCW1YKL046C 1350 nt12.9□□□□□ -0.34
SPE4Q12455 FUN26YAL022C 1554 nt12.85□□□□□ -0.35
SPE4Q12455 WWM1YFL010C 636 nt12.78□□□□□ -0.36
SPE4Q12455 TRM9YML014W 840 nt12.75□□□□□ -0.37
SPE4Q12455 ALF1YNL148C 765 nt12.75□□□□□ -0.37
SPE4Q12455 BDF1YLR399C 2061 nt12.74□□□□□ -0.37
SPE4Q12455 EMI2YDR516C 1503 nt12.72□□□□□ -0.37
SPE4Q12455 LSM3YLR438C-A 270 nt12.67□□□□□ -0.38
SPE4Q12455 YMR090WYMR090W 684 nt12.67□□□□□ -0.38
SPE4Q12455 RPP2AYOL039W 321 nt12.66□□□□□ -0.38
SPE4Q12455 CCT6YDR188W 1641 nt12.64□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 PTP1YDL230W 1008 nt12.64□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 CAC2YML102W 1407 nt12.62□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 SHU1YHL006C 453 nt12.61□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 YDL221WYDL221W 552 nt12.6□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 YBR220CYBR220C 1683 nt12.6□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 YGR021WYGR021W 873 nt12.59□□□□□ -0.39
SPE4Q12455 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.58□□□□□ -0.4
SPE4Q12455 TAT1YBR069C 1860 nt12.57□□□□□ -0.4
SPE4Q12455 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE4Q12455 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE4Q12455 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.55□□□□□ -0.4
SPE4Q12455 SIS1YNL007C 1059 nt12.54□□□□□ -0.4
SPE4Q12455 HOM6YJR139C 1080 nt12.52□□□□□ -0.41
SPE4Q12455 SDH1YKL148C 1923 nt12.51□□□□□ -0.41
SPE4Q12455 MNP1YGL068W 585 nt12.43□□□□□ -0.42
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