Protein–RNA interactions for Protein: P34232

MTR2, mRNA transport regulator MTR2, yeast

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR2	P34232	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		17.68	■□□□□ 0.42
MTR2	P34232	NOP1	YDL014W	984 nt		17.31	■□□□□ 0.36
MTR2	P34232	NSR1	YGR159C	1245 nt		17.3	■□□□□ 0.36
MTR2	P34232	YKL036C	YKL036C	393 nt		16.25	■□□□□ 0.19
MTR2	P34232	Q0297	Q0297	156 nt		15.25	■□□□□ 0.03
MTR2	P34232	YJL027C	YJL027C	417 nt		15.23	■□□□□ 0.03
MTR2	P34232	SRX1	YKL086W	384 nt		15.13	■□□□□ 0.01
MTR2	P34232	MDJ1	YFL016C	1536 nt		15.08	■□□□□ 0.01
MTR2	P34232	SCS3	YGL126W	1143 nt		14.95	□□□□□ -0.02
MTR2	P34232	YCR051W	YCR051W	669 nt		14.38	□□□□□ -0.11
MTR2	P34232	YOL085C	YOL085C	342 nt		14.06	□□□□□ -0.16
MTR2	P34232	PKP1	YIL042C	1185 nt		13.82	□□□□□ -0.2
MTR2	P34232	RPP1B	YDL130W	321 nt		13.69	□□□□□ -0.22
MTR2	P34232	SCJ1	YMR214W	1134 nt		13.63	□□□□□ -0.23
MTR2	P34232	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		13.5	□□□□□ -0.25
MTR2	P34232	DBP2	YNL112W	1641 nt		13.46	□□□□□ -0.26
MTR2	P34232	ATS1	YAL020C	1002 nt		13.45	□□□□□ -0.26
MTR2	P34232	CCC1	YLR220W	969 nt		13.36	□□□□□ -0.27
MTR2	P34232	PET122	YER153C	765 nt		13.04	□□□□□ -0.32
MTR2	P34232	SCR1	SCR1	522 nt		12.99	□□□□□ -0.33
MTR2	P34232	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		12.87	□□□□□ -0.35
MTR2	P34232	YBR190W	YBR190W	312 nt		12.78	□□□□□ -0.36
MTR2	P34232	RVS167	YDR388W	1449 nt		12.74	□□□□□ -0.37
MTR2	P34232	RRN5	YLR141W	1092 nt		12.69	□□□□□ -0.38
MTR2	P34232	SSA3	YBL075C	1950 nt		12.63	□□□□□ -0.39
MTR2	P34232	RSB1	YOR049C	1065 nt		12.53	□□□□□ -0.4
MTR2	P34232	RTC3	YHR087W	336 nt		12.52	□□□□□ -0.41
MTR2	P34232	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		12.45	□□□□□ -0.42
MTR2	P34232	YDJ1	YNL064C	1230 nt		12.45	□□□□□ -0.42
MTR2	P34232	PST2	YDR032C	597 nt		12.4	□□□□□ -0.42
MTR2	P34232	SHR5	YOL110W	714 nt		12.36	□□□□□ -0.43
MTR2	P34232	GAR1	YHR089C	618 nt		12.12	□□□□□ -0.47
MTR2	P34232	YKL097C	YKL097C	411 nt		12.08	□□□□□ -0.48
MTR2	P34232	DEP1	YAL013W	1218 nt		11.91	□□□□□ -0.5
MTR2	P34232	URN1	YPR152C	1398 nt		11.83	□□□□□ -0.52
MTR2	P34232	SHU1	YHL006C	453 nt		11.83	□□□□□ -0.52
MTR2	P34232	YNL208W	YNL208W	600 nt		11.76	□□□□□ -0.53
MTR2	P34232	RPN10	YHR200W	807 nt		11.73	□□□□□ -0.53
MTR2	P34232	TIR1	YER011W	765 nt		11.71	□□□□□ -0.53
MTR2	P34232	OPI9	YLR338W	858 nt		11.6	□□□□□ -0.55
MTR2	P34232	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		11.55	□□□□□ -0.56
MTR2	P34232	YOR139C	YOR139C	393 nt		11.54	□□□□□ -0.56
MTR2	P34232	SSA1	YAL005C	1929 nt		11.5	□□□□□ -0.57
MTR2	P34232	SAH1	YER043C	1350 nt		11.44	□□□□□ -0.58
MTR2	P34232	Q0182	Q0182	405 nt		11.41	□□□□□ -0.58
MTR2	P34232	NPL3	YDR432W	1245 nt		11.38	□□□□□ -0.59
MTR2	P34232	PUT4	YOR348C	1884 nt		11.36	□□□□□ -0.59
MTR2	P34232	SRB2	YHR041C	633 nt		11.36	□□□□□ -0.59
MTR2	P34232	YJR018W	YJR018W	363 nt		11.3	□□□□□ -0.6
MTR2	P34232	YGR021W	YGR021W	873 nt		11.27	□□□□□ -0.61
MTR2	P34232	PUN1	YLR414C	792 nt		11.26	□□□□□ -0.61
MTR2	P34232	ARE1	YCR048W	1833 nt		11.25	□□□□□ -0.61
MTR2	P34232	HOM6	YJR139C	1080 nt		11.25	□□□□□ -0.61
MTR2	P34232	WWM1	YFL010C	636 nt		11.24	□□□□□ -0.61
MTR2	P34232	MNP1	YGL068W	585 nt		11.24	□□□□□ -0.61
MTR2	P34232	YJR120W	YJR120W	351 nt		11.2	□□□□□ -0.62
MTR2	P34232	YOL037C	YOL037C	354 nt		11.18	□□□□□ -0.62
MTR2	P34232	RPP2B	YDR382W	333 nt		11.17	□□□□□ -0.62
MTR2	P34232	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		11.12	□□□□□ -0.63
MTR2	P34232	RKM5	YLR137W	1104 nt		11.09	□□□□□ -0.63
MTR2	P34232	PTC2	YER089C	1395 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		11.06	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	POA1	YBR022W	534 nt		11.04	□□□□□ -0.64
MTR2	P34232	BDH2	YAL061W	1254 nt		10.99	□□□□□ -0.65
MTR2	P34232	MOT3	YMR070W	1473 nt		10.98	□□□□□ -0.65
MTR2	P34232	SSA4	YER103W	1929 nt		10.97	□□□□□ -0.65
MTR2	P34232	LSM3	YLR438C-A	270 nt		10.91	□□□□□ -0.66
MTR2	P34232	SPT5	YML010W	3192 nt		10.89	□□□□□ -0.67
MTR2	P34232	BUD23	YCR047C	828 nt		10.89	□□□□□ -0.67
MTR2	P34232	YLR281C	YLR281C	468 nt		10.89	□□□□□ -0.67
MTR2	P34232	PUS2	YGL063W	1113 nt		10.88	□□□□□ -0.67
MTR2	P34232	NAB2	YGL122C	1578 nt		10.88	□□□□□ -0.67
MTR2	P34232	INM2	YDR287W	879 nt		10.86	□□□□□ -0.67
MTR2	P34232	YBL100C	YBL100C	315 nt		10.81	□□□□□ -0.68
MTR2	P34232	WHI5	YOR083W	888 nt		10.81	□□□□□ -0.68
MTR2	P34232	BSC6	YOL137W	1494 nt		10.81	□□□□□ -0.68
MTR2	P34232	DAL1	YIR027C	1383 nt		10.8	□□□□□ -0.68
MTR2	P34232	FPR4	YLR449W	1179 nt		10.79	□□□□□ -0.68
MTR2	P34232	FIS1	YIL065C	468 nt		10.77	□□□□□ -0.69
MTR2	P34232	TRM9	YML014W	840 nt		10.73	□□□□□ -0.69
MTR2	P34232	PHO4	YFR034C	939 nt		10.7	□□□□□ -0.7
MTR2	P34232	FUN26	YAL022C	1554 nt		10.69	□□□□□ -0.7
MTR2	P34232	BDF1	YLR399C	2061 nt		10.62	□□□□□ -0.71
MTR2	P34232	DSK2	YMR276W	1122 nt		10.62	□□□□□ -0.71
MTR2	P34232	FMP45	YDL222C	930 nt		10.61	□□□□□ -0.71
MTR2	P34232	CCT6	YDR188W	1641 nt		10.61	□□□□□ -0.71
MTR2	P34232	PAC11	YDR488C	1602 nt		10.61	□□□□□ -0.71

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