Protein–RNA interactions for Protein: Q02651

SMA1, Spore membrane assembly protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMA1Q02651 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.48■□□□□ 0.87
SMA1Q02651 NOP1YDL014W 984 nt20.12■□□□□ 0.81
SMA1Q02651 NSR1YGR159C 1245 nt20.11■□□□□ 0.81
SMA1Q02651 YKL036CYKL036C 393 nt18.92■□□□□ 0.62
SMA1Q02651 Q0297Q0297 156 nt17.78■□□□□ 0.44
SMA1Q02651 YJL027CYJL027C 417 nt17.7■□□□□ 0.42
SMA1Q02651 SRX1YKL086W 384 nt17.6■□□□□ 0.41
SMA1Q02651 MDJ1YFL016C 1536 nt17.41■□□□□ 0.38
SMA1Q02651 SCS3YGL126W 1143 nt17.39■□□□□ 0.37
SMA1Q02651 YCR051WYCR051W 669 nt16.66■□□□□ 0.26
SMA1Q02651 YOL085CYOL085C 342 nt16.38■□□□□ 0.21
SMA1Q02651 PKP1YIL042C 1185 nt16.02■□□□□ 0.16
SMA1Q02651 SCJ1YMR214W 1134 nt15.97■□□□□ 0.15
SMA1Q02651 RPP1BYDL130W 321 nt15.93■□□□□ 0.14
SMA1Q02651 ATS1YAL020C 1002 nt15.69■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.67■□□□□ 0.1
SMA1Q02651 DBP2YNL112W 1641 nt15.62■□□□□ 0.09
SMA1Q02651 CCC1YLR220W 969 nt15.46■□□□□ 0.07
SMA1Q02651 PET122YER153C 765 nt15.14■□□□□ 0.01
SMA1Q02651 SCR1SCR1 522 nt15.09■□□□□ 0.01
SMA1Q02651 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.95□□□□□ -0.02
SMA1Q02651 YBR190WYBR190W 312 nt14.81□□□□□ -0.04
SMA1Q02651 RRN5YLR141W 1092 nt14.75□□□□□ -0.05
SMA1Q02651 RVS167YDR388W 1449 nt14.75□□□□□ -0.05
SMA1Q02651 RSB1YOR049C 1065 nt14.53□□□□□ -0.08
SMA1Q02651 PST2YDR032C 597 nt14.49□□□□□ -0.09
SMA1Q02651 YDJ1YNL064C 1230 nt14.49□□□□□ -0.09
SMA1Q02651 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.48□□□□□ -0.09
SMA1Q02651 RTC3YHR087W 336 nt14.44□□□□□ -0.1
SMA1Q02651 SHR5YOL110W 714 nt14.34□□□□□ -0.11
SMA1Q02651 YKL097CYKL097C 411 nt14.07□□□□□ -0.16
SMA1Q02651 GAR1YHR089C 618 nt14.03□□□□□ -0.16
SMA1Q02651 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
SMA1Q02651 SHU1YHL006C 453 nt13.77□□□□□ -0.21
SMA1Q02651 DEP1YAL013W 1218 nt13.74□□□□□ -0.21
SMA1Q02651 URN1YPR152C 1398 nt13.68□□□□□ -0.22
SMA1Q02651 YNL208WYNL208W 600 nt13.63□□□□□ -0.23
SMA1Q02651 PUT4YOR348C 1884 nt13.59□□□□□ -0.23
SMA1Q02651 TIR1YER011W 765 nt13.58□□□□□ -0.24
SMA1Q02651 RPN10YHR200W 807 nt13.57□□□□□ -0.24
SMA1Q02651 YOR139CYOR139C 393 nt13.46□□□□□ -0.25
SMA1Q02651 OPI9YLR338W 858 nt13.43□□□□□ -0.26
SMA1Q02651 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.41□□□□□ -0.26
SMA1Q02651 SSA1YAL005C 1929 nt13.34□□□□□ -0.27
SMA1Q02651 NPL3YDR432W 1245 nt13.23□□□□□ -0.29
SMA1Q02651 SAH1YER043C 1350 nt13.21□□□□□ -0.29
SMA1Q02651 ARE1YCR048W 1833 nt13.18□□□□□ -0.3
SMA1Q02651 SRB2YHR041C 633 nt13.17□□□□□ -0.3
SMA1Q02651 POA1YBR022W 534 nt13.14□□□□□ -0.31
SMA1Q02651 YGR021WYGR021W 873 nt13.11□□□□□ -0.31
SMA1Q02651 YJR018WYJR018W 363 nt13.09□□□□□ -0.31
SMA1Q02651 HOM6YJR139C 1080 nt13.08□□□□□ -0.32
SMA1Q02651 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.05□□□□□ -0.32
SMA1Q02651 WWM1YFL010C 636 nt13.04□□□□□ -0.32
SMA1Q02651 PUN1YLR414C 792 nt13.04□□□□□ -0.32
SMA1Q02651 MNP1YGL068W 585 nt13.02□□□□□ -0.33
SMA1Q02651 YOL037CYOL037C 354 nt13□□□□□ -0.33
SMA1Q02651 YJR120WYJR120W 351 nt12.98□□□□□ -0.33
SMA1Q02651 BSC6YOL137W 1494 nt12.96□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 RPP2BYDR382W 333 nt12.92□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.92□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.92□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.92□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.92□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.92□□□□□ -0.34
SMA1Q02651 RKM5YLR137W 1104 nt12.87□□□□□ -0.35
SMA1Q02651 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.85□□□□□ -0.35
SMA1Q02651 PTC2YER089C 1395 nt12.79□□□□□ -0.36
SMA1Q02651 BDH2YAL061W 1254 nt12.75□□□□□ -0.37
SMA1Q02651 BUD23YCR047C 828 nt12.72□□□□□ -0.37
SMA1Q02651 YLR281CYLR281C 468 nt12.7□□□□□ -0.38
SMA1Q02651 LSM3YLR438C-A 270 nt12.69□□□□□ -0.38
SMA1Q02651 SPT5YML010W 3192 nt12.69□□□□□ -0.38
SMA1Q02651 PUS2YGL063W 1113 nt12.66□□□□□ -0.38
SMA1Q02651 INM2YDR287W 879 nt12.6□□□□□ -0.39
SMA1Q02651 NAB2YGL122C 1578 nt12.6□□□□□ -0.39
SMA1Q02651 WHI5YOR083W 888 nt12.57□□□□□ -0.4
SMA1Q02651 MOT3YMR070W 1473 nt12.55□□□□□ -0.4
SMA1Q02651 SSA4YER103W 1929 nt12.54□□□□□ -0.4
SMA1Q02651 YBL100CYBL100C 315 nt12.51□□□□□ -0.41
SMA1Q02651 DAL1YIR027C 1383 nt12.5□□□□□ -0.41
SMA1Q02651 FIS1YIL065C 468 nt12.44□□□□□ -0.42
SMA1Q02651 TRM9YML014W 840 nt12.44□□□□□ -0.42
SMA1Q02651 FPR4YLR449W 1179 nt12.41□□□□□ -0.42
SMA1Q02651 FUN26YAL022C 1554 nt12.38□□□□□ -0.43
SMA1Q02651 PHO4YFR034C 939 nt12.37□□□□□ -0.43
SMA1Q02651 DSK2YMR276W 1122 nt12.35□□□□□ -0.43
SMA1Q02651 YPR011CYPR011C 981 nt12.35□□□□□ -0.43
SMA1Q02651 IMP2'YIL154C 1041 nt12.34□□□□□ -0.43
SMA1Q02651 CCT6YDR188W 1641 nt12.31□□□□□ -0.44
SMA1Q02651 FMP45YDL222C 930 nt12.31□□□□□ -0.44
SMA1Q02651 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms