Protein–RNA interactions for Protein: Q12140

BSC1, Bypass of stop codon protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC1Q12140 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.07■□□□□ 0.64
BSC1Q12140 NSR1YGR159C 1245 nt18.99■□□□□ 0.63
BSC1Q12140 NOP1YDL014W 984 nt18.42■□□□□ 0.54
BSC1Q12140 MDJ1YFL016C 1536 nt17.06■□□□□ 0.32
BSC1Q12140 YKL036CYKL036C 393 nt16.92■□□□□ 0.3
BSC1Q12140 SRX1YKL086W 384 nt16.11■□□□□ 0.17
BSC1Q12140 Q0297Q0297 156 nt16.1■□□□□ 0.17
BSC1Q12140 YJL027CYJL027C 417 nt15.8■□□□□ 0.12
BSC1Q12140 SCS3YGL126W 1143 nt15.37■□□□□ 0.05
BSC1Q12140 YCR051WYCR051W 669 nt15.32■□□□□ 0.04
BSC1Q12140 DBP2YNL112W 1641 nt15.03■□□□□ -0
BSC1Q12140 YOL085CYOL085C 342 nt14.68□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
BSC1Q12140 CCC1YLR220W 969 nt14.56□□□□□ -0.08
BSC1Q12140 PKP1YIL042C 1185 nt14.52□□□□□ -0.09
BSC1Q12140 YBR190WYBR190W 312 nt14.5□□□□□ -0.09
BSC1Q12140 RPP1BYDL130W 321 nt14.46□□□□□ -0.09
BSC1Q12140 RTC3YHR087W 336 nt14.22□□□□□ -0.13
BSC1Q12140 RVS167YDR388W 1449 nt14.05□□□□□ -0.16
BSC1Q12140 SCJ1YMR214W 1134 nt14.03□□□□□ -0.16
BSC1Q12140 PET122YER153C 765 nt13.87□□□□□ -0.19
BSC1Q12140 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.83□□□□□ -0.2
BSC1Q12140 ATS1YAL020C 1002 nt13.7□□□□□ -0.22
BSC1Q12140 SCR1SCR1 522 nt13.64□□□□□ -0.23
BSC1Q12140 SHR5YOL110W 714 nt13.54□□□□□ -0.24
BSC1Q12140 RRN5YLR141W 1092 nt13.45□□□□□ -0.26
BSC1Q12140 YDJ1YNL064C 1230 nt13.34□□□□□ -0.27
BSC1Q12140 PUT4YOR348C 1884 nt13.33□□□□□ -0.28
BSC1Q12140 DEP1YAL013W 1218 nt13.28□□□□□ -0.28
BSC1Q12140 URN1YPR152C 1398 nt13.27□□□□□ -0.29
BSC1Q12140 SSA3YBL075C 1950 nt13.23□□□□□ -0.29
BSC1Q12140 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.19□□□□□ -0.3
BSC1Q12140 RSB1YOR049C 1065 nt13.14□□□□□ -0.31
BSC1Q12140 GAR1YHR089C 618 nt13.13□□□□□ -0.31
BSC1Q12140 OPI9YLR338W 858 nt13.07□□□□□ -0.32
BSC1Q12140 SAH1YER043C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
BSC1Q12140 ARE1YCR048W 1833 nt13.04□□□□□ -0.32
BSC1Q12140 RPN10YHR200W 807 nt12.99□□□□□ -0.33
BSC1Q12140 YNL208WYNL208W 600 nt12.98□□□□□ -0.33
BSC1Q12140 POA1YBR022W 534 nt12.92□□□□□ -0.34
BSC1Q12140 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.87□□□□□ -0.35
BSC1Q12140 PST2YDR032C 597 nt12.7□□□□□ -0.38
BSC1Q12140 BSC6YOL137W 1494 nt12.7□□□□□ -0.38
BSC1Q12140 PUN1YLR414C 792 nt12.68□□□□□ -0.38
BSC1Q12140 TIR1YER011W 765 nt12.67□□□□□ -0.38
BSC1Q12140 YJR018WYJR018W 363 nt12.64□□□□□ -0.39
BSC1Q12140 PTC2YER089C 1395 nt12.58□□□□□ -0.4
BSC1Q12140 BUD23YCR047C 828 nt12.58□□□□□ -0.4
BSC1Q12140 SSA1YAL005C 1929 nt12.57□□□□□ -0.4
BSC1Q12140 YJR120WYJR120W 351 nt12.46□□□□□ -0.41
BSC1Q12140 NAB2YGL122C 1578 nt12.4□□□□□ -0.42
BSC1Q12140 SRB2YHR041C 633 nt12.4□□□□□ -0.42
BSC1Q12140 RPP2BYDR382W 333 nt12.32□□□□□ -0.44
BSC1Q12140 SPT5YML010W 3192 nt12.3□□□□□ -0.44
BSC1Q12140 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
BSC1Q12140 SHU1YHL006C 453 nt12.25□□□□□ -0.45
BSC1Q12140 FPR4YLR449W 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
BSC1Q12140 DAL1YIR027C 1383 nt12.23□□□□□ -0.45
BSC1Q12140 INM2YDR287W 879 nt12.16□□□□□ -0.46
BSC1Q12140 PHO4YFR034C 939 nt12.14□□□□□ -0.47
BSC1Q12140 WWM1YFL010C 636 nt12.13□□□□□ -0.47
BSC1Q12140 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.13□□□□□ -0.47
BSC1Q12140 YKL097CYKL097C 411 nt12.13□□□□□ -0.47
BSC1Q12140 BDH2YAL061W 1254 nt12.07□□□□□ -0.48
BSC1Q12140 YBL100CYBL100C 315 nt12.07□□□□□ -0.48
BSC1Q12140 SSA4YER103W 1929 nt12.04□□□□□ -0.48
BSC1Q12140 YGR021WYGR021W 873 nt11.95□□□□□ -0.5
BSC1Q12140 HOM6YJR139C 1080 nt11.94□□□□□ -0.5
BSC1Q12140 FUN26YAL022C 1554 nt11.93□□□□□ -0.5
BSC1Q12140 YPS1YLR120C 1710 nt11.92□□□□□ -0.5
BSC1Q12140 MNP1YGL068W 585 nt11.92□□□□□ -0.5
BSC1Q12140 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
BSC1Q12140 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.88□□□□□ -0.51
BSC1Q12140 LSM3YLR438C-A 270 nt11.86□□□□□ -0.51
BSC1Q12140 TRM9YML014W 840 nt11.86□□□□□ -0.51
BSC1Q12140 YDR095CYDR095C 411 nt11.83□□□□□ -0.52
BSC1Q12140 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.81□□□□□ -0.52
BSC1Q12140 DCW1YKL046C 1350 nt11.8□□□□□ -0.52
BSC1Q12140 RKM5YLR137W 1104 nt11.77□□□□□ -0.53
BSC1Q12140 ALF1YNL148C 765 nt11.76□□□□□ -0.53
BSC1Q12140 CCT6YDR188W 1641 nt11.75□□□□□ -0.53
BSC1Q12140 YOR139CYOR139C 393 nt11.7□□□□□ -0.54
BSC1Q12140 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.63□□□□□ -0.55
BSC1Q12140 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.63□□□□□ -0.55
BSC1Q12140 PTP1YDL230W 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
BSC1Q12140 NPL3YDR432W 1245 nt11.6□□□□□ -0.55
BSC1Q12140 RPP2AYOL039W 321 nt11.6□□□□□ -0.55
BSC1Q12140 YOL037CYOL037C 354 nt11.59□□□□□ -0.55
BSC1Q12140 SIS1YNL007C 1059 nt11.58□□□□□ -0.56
BSC1Q12140 EMI2YDR516C 1503 nt11.58□□□□□ -0.56
BSC1Q12140 BDF1YLR399C 2061 nt11.58□□□□□ -0.56
BSC1Q12140 CAC2YML102W 1407 nt11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms