RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YCL002C	P25565	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PIH1	P38768	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NDT80	P38830	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ELO3	P40319	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	FKH2	P41813	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	DAM1	P53267	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MUK1	Q02866	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TMN2	Q04562	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ERV41	Q04651	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ECM7	Q06200	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ACF2	Q12168	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YEL043W	P32618	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SHP1	P34223	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PXL1	P36166	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PSY4	P38193	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SPT8	P38915	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PZF1	P39933	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	VFA1	P40080	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TOS3	P43637	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SGM1	P47166	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RTA1	P53047	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	DIP5	P53388	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ESBP6	P53918	673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	COQ9	Q05779	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	VPS38	Q05919	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PSO2	P30620	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YET1	P35723	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SAK1	P38990	1142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	EAF5	P39995	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	FTR1	P40088	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SSY5	P47002	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MUP1	P50276	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RTT102	P53330	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TOF1	P53840	1238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TIM44	Q01852	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	FMP30	Q02883	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	IES4	Q08561	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TMA16	Q08687	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	CAN1	P04817	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PET111	P08468	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	KIN82	P25341	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YUR1	P26725	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NGG1	P32494	702 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SRB4	P32569	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MMS4	P38257	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	CAJ1	P39101	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PSF2	P40359	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
CPR4	YCR069W	CUL3	P53202	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TIM8	P57744	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SSL2	Q00578	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	VTC3	Q02725	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RSC3	Q06639	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SDH5	Q08230	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	DAS2	Q12084	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RTP1	Q12751	981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	WHI2	P12611	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CPR4	YCR069W	MSS51	P32335	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	KDX1	P36005	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MRX3	P38172	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	PFA3	P42836	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YFL040W	P43562	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	VPS60	Q03390	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	REH1	Q06709	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	THI21	Q08975	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ATG9	Q12142	997 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	GIS3	Q12418	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	GAL11	P19659	1081 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	CKI1	P20485	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SEC65	P29478	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	HXT1	P32465	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TMT1	P32643	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NIP100	P33420	868 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SPC72	P39723	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	BUD16	P39988	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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