Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 NSR1YGR159C 1245 nt20.85■□□□□ 0.93
RTA1P53047 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.81■□□□□ 0.92
RTA1P53047 NOP1YDL014W 984 nt20.18■□□□□ 0.82
RTA1P53047 MDJ1YFL016C 1536 nt18.69■□□□□ 0.58
RTA1P53047 YKL036CYKL036C 393 nt18.39■□□□□ 0.53
RTA1P53047 SRX1YKL086W 384 nt17.59■□□□□ 0.41
RTA1P53047 Q0297Q0297 156 nt17.54■□□□□ 0.4
RTA1P53047 YJL027CYJL027C 417 nt17.28■□□□□ 0.36
RTA1P53047 YCR051WYCR051W 669 nt16.69■□□□□ 0.26
RTA1P53047 SCS3YGL126W 1143 nt16.59■□□□□ 0.25
RTA1P53047 DBP2YNL112W 1641 nt16.41■□□□□ 0.22
RTA1P53047 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 YBR190WYBR190W 312 nt16.01■□□□□ 0.15
RTA1P53047 YOL085CYOL085C 342 nt15.91■□□□□ 0.14
RTA1P53047 CCC1YLR220W 969 nt15.87■□□□□ 0.13
RTA1P53047 RPP1BYDL130W 321 nt15.75■□□□□ 0.11
RTA1P53047 PKP1YIL042C 1185 nt15.69■□□□□ 0.1
RTA1P53047 RTC3YHR087W 336 nt15.68■□□□□ 0.1
RTA1P53047 RVS167YDR388W 1449 nt15.49■□□□□ 0.07
RTA1P53047 SCJ1YMR214W 1134 nt15.27■□□□□ 0.04
RTA1P53047 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.09■□□□□ 0.01
RTA1P53047 PET122YER153C 765 nt15.05■□□□□ -0
RTA1P53047 SCR1SCR1 522 nt14.9□□□□□ -0.02
RTA1P53047 SHR5YOL110W 714 nt14.86□□□□□ -0.03
RTA1P53047 ATS1YAL020C 1002 nt14.79□□□□□ -0.04
RTA1P53047 PUT4YOR348C 1884 nt14.65□□□□□ -0.06
RTA1P53047 RRN5YLR141W 1092 nt14.61□□□□□ -0.07
RTA1P53047 YDJ1YNL064C 1230 nt14.61□□□□□ -0.07
RTA1P53047 URN1YPR152C 1398 nt14.57□□□□□ -0.08
RTA1P53047 DEP1YAL013W 1218 nt14.5□□□□□ -0.09
RTA1P53047 OPI9YLR338W 858 nt14.4□□□□□ -0.1
RTA1P53047 RPN10YHR200W 807 nt14.36□□□□□ -0.11
RTA1P53047 SAH1YER043C 1350 nt14.34□□□□□ -0.11
RTA1P53047 GAR1YHR089C 618 nt14.32□□□□□ -0.12
RTA1P53047 ARE1YCR048W 1833 nt14.31□□□□□ -0.12
RTA1P53047 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.31□□□□□ -0.12
RTA1P53047 Q0182Q0182 405 nt14.28□□□□□ -0.12
RTA1P53047 YNL208WYNL208W 600 nt14.27□□□□□ -0.13
RTA1P53047 RSB1YOR049C 1065 nt14.27□□□□□ -0.13
RTA1P53047 POA1YBR022W 534 nt14.2□□□□□ -0.14
RTA1P53047 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.17□□□□□ -0.14
RTA1P53047 SSA3YBL075C 1950 nt14.11□□□□□ -0.15
RTA1P53047 PUN1YLR414C 792 nt14.01□□□□□ -0.17
RTA1P53047 MOT3YMR070W 1473 nt13.96□□□□□ -0.17
RTA1P53047 BSC6YOL137W 1494 nt13.93□□□□□ -0.18
RTA1P53047 YJR018WYJR018W 363 nt13.89□□□□□ -0.19
RTA1P53047 BUD23YCR047C 828 nt13.86□□□□□ -0.19
RTA1P53047 PTC2YER089C 1395 nt13.84□□□□□ -0.19
RTA1P53047 TIR1YER011W 765 nt13.84□□□□□ -0.19
RTA1P53047 PST2YDR032C 597 nt13.72□□□□□ -0.21
RTA1P53047 NAB2YGL122C 1578 nt13.7□□□□□ -0.22
RTA1P53047 SSA1YAL005C 1929 nt13.68□□□□□ -0.22
RTA1P53047 RPP2BYDR382W 333 nt13.6□□□□□ -0.23
RTA1P53047 YJR120WYJR120W 351 nt13.56□□□□□ -0.24
RTA1P53047 DAL1YIR027C 1383 nt13.48□□□□□ -0.25
RTA1P53047 FPR4YLR449W 1179 nt13.47□□□□□ -0.25
RTA1P53047 INM2YDR287W 879 nt13.45□□□□□ -0.26
RTA1P53047 FIS1YIL065C 468 nt13.45□□□□□ -0.26
RTA1P53047 SRB2YHR041C 633 nt13.37□□□□□ -0.27
RTA1P53047 PHO4YFR034C 939 nt13.34□□□□□ -0.27
RTA1P53047 SPT5YML010W 3192 nt13.32□□□□□ -0.28
RTA1P53047 YBL100CYBL100C 315 nt13.27□□□□□ -0.29
RTA1P53047 BDH2YAL061W 1254 nt13.25□□□□□ -0.29
RTA1P53047 SHU1YHL006C 453 nt13.21□□□□□ -0.29
RTA1P53047 WWM1YFL010C 636 nt13.18□□□□□ -0.3
RTA1P53047 YPS1YLR120C 1710 nt13.14□□□□□ -0.31
RTA1P53047 YKL097CYKL097C 411 nt13.11□□□□□ -0.31
RTA1P53047 FUN26YAL022C 1554 nt13.1□□□□□ -0.31
RTA1P53047 MEP2YNL142W 1500 nt13.09□□□□□ -0.31
RTA1P53047 YGR021WYGR021W 873 nt13.09□□□□□ -0.31
RTA1P53047 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.07□□□□□ -0.32
RTA1P53047 TRM9YML014W 840 nt13.06□□□□□ -0.32
RTA1P53047 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.05□□□□□ -0.32
RTA1P53047 LSM3YLR438C-A 270 nt13.05□□□□□ -0.32
RTA1P53047 YDR095CYDR095C 411 nt13.03□□□□□ -0.32
RTA1P53047 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13□□□□□ -0.33
RTA1P53047 ALF1YNL148C 765 nt13□□□□□ -0.33
RTA1P53047 SSA4YER103W 1929 nt13□□□□□ -0.33
RTA1P53047 HOM6YJR139C 1080 nt12.98□□□□□ -0.33
RTA1P53047 CCT6YDR188W 1641 nt12.91□□□□□ -0.34
RTA1P53047 MNP1YGL068W 585 nt12.88□□□□□ -0.35
RTA1P53047 DCW1YKL046C 1350 nt12.86□□□□□ -0.35
RTA1P53047 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RTA1P53047 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RTA1P53047 RPP2AYOL039W 321 nt12.81□□□□□ -0.36
RTA1P53047 RKM5YLR137W 1104 nt12.8□□□□□ -0.36
RTA1P53047 SIS1YNL007C 1059 nt12.74□□□□□ -0.37
RTA1P53047 EMI2YDR516C 1503 nt12.72□□□□□ -0.37
RTA1P53047 PTP1YDL230W 1008 nt12.72□□□□□ -0.37
RTA1P53047 YMR090WYMR090W 684 nt12.72□□□□□ -0.37
RTA1P53047 CAC2YML102W 1407 nt12.65□□□□□ -0.38
RTA1P53047 YOL037CYOL037C 354 nt12.63□□□□□ -0.39
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