Protein–RNA interactions for Protein: P47002

SSY5, SPS-sensor serine protease component SSY5, yeastyeast

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSY5P47002 NSR1YGR159C 1245 nt18.35■□□□□ 0.53
SSY5P47002 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.19■□□□□ 0.5
SSY5P47002 NOP1YDL014W 984 nt17.64■□□□□ 0.41
SSY5P47002 MDJ1YFL016C 1536 nt16.78■□□□□ 0.28
SSY5P47002 YKL036CYKL036C 393 nt16.02■□□□□ 0.16
SSY5P47002 YJL027CYJL027C 417 nt15.44■□□□□ 0.06
SSY5P47002 SRX1YKL086W 384 nt15.39■□□□□ 0.05
SSY5P47002 Q0297Q0297 156 nt15.34■□□□□ 0.05
SSY5P47002 DBP2YNL112W 1641 nt14.65□□□□□ -0.06
SSY5P47002 YCR051WYCR051W 669 nt14.56□□□□□ -0.08
SSY5P47002 SCS3YGL126W 1143 nt14.44□□□□□ -0.1
SSY5P47002 YBR190WYBR190W 312 nt14.44□□□□□ -0.1
SSY5P47002 RTC3YHR087W 336 nt14.09□□□□□ -0.15
SSY5P47002 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.05□□□□□ -0.16
SSY5P47002 CCC1YLR220W 969 nt13.88□□□□□ -0.19
SSY5P47002 YOL085CYOL085C 342 nt13.87□□□□□ -0.19
SSY5P47002 SSA3YBL075C 1950 nt13.87□□□□□ -0.19
SSY5P47002 RPP1BYDL130W 321 nt13.76□□□□□ -0.21
SSY5P47002 PKP1YIL042C 1185 nt13.65□□□□□ -0.22
SSY5P47002 RVS167YDR388W 1449 nt13.64□□□□□ -0.23
SSY5P47002 PUT4YOR348C 1884 nt13.51□□□□□ -0.25
SSY5P47002 SCJ1YMR214W 1134 nt13.47□□□□□ -0.25
SSY5P47002 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.21□□□□□ -0.29
SSY5P47002 PET122YER153C 765 nt13.14□□□□□ -0.31
SSY5P47002 ARE1YCR048W 1833 nt13.11□□□□□ -0.31
SSY5P47002 SHR5YOL110W 714 nt13.06□□□□□ -0.32
SSY5P47002 POA1YBR022W 534 nt13.05□□□□□ -0.32
SSY5P47002 URN1YPR152C 1398 nt13.01□□□□□ -0.33
SSY5P47002 SCR1SCR1 522 nt12.98□□□□□ -0.33
SSY5P47002 SAH1YER043C 1350 nt12.97□□□□□ -0.33
SSY5P47002 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.94□□□□□ -0.34
SSY5P47002 OPI9YLR338W 858 nt12.92□□□□□ -0.34
SSY5P47002 BSC6YOL137W 1494 nt12.86□□□□□ -0.35
SSY5P47002 DEP1YAL013W 1218 nt12.86□□□□□ -0.35
SSY5P47002 ATS1YAL020C 1002 nt12.86□□□□□ -0.35
SSY5P47002 YDJ1YNL064C 1230 nt12.8□□□□□ -0.36
SSY5P47002 RRN5YLR141W 1092 nt12.75□□□□□ -0.37
SSY5P47002 RPN10YHR200W 807 nt12.68□□□□□ -0.38
SSY5P47002 SPT5YML010W 3192 nt12.64□□□□□ -0.39
SSY5P47002 Q0182Q0182 405 nt12.62□□□□□ -0.39
SSY5P47002 BUD23YCR047C 828 nt12.6□□□□□ -0.39
SSY5P47002 YNL208WYNL208W 600 nt12.6□□□□□ -0.39
SSY5P47002 PUN1YLR414C 792 nt12.54□□□□□ -0.4
SSY5P47002 GAR1YHR089C 618 nt12.53□□□□□ -0.4
SSY5P47002 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.49□□□□□ -0.41
SSY5P47002 PTC2YER089C 1395 nt12.48□□□□□ -0.41
SSY5P47002 SSA4YER103W 1929 nt12.45□□□□□ -0.42
SSY5P47002 RSB1YOR049C 1065 nt12.42□□□□□ -0.42
SSY5P47002 NAB2YGL122C 1578 nt12.39□□□□□ -0.43
SSY5P47002 YJR018WYJR018W 363 nt12.38□□□□□ -0.43
SSY5P47002 MOT3YMR070W 1473 nt12.29□□□□□ -0.44
SSY5P47002 FIS1YIL065C 468 nt12.15□□□□□ -0.46
SSY5P47002 MEP2YNL142W 1500 nt12.13□□□□□ -0.47
SSY5P47002 TIR1YER011W 765 nt12.13□□□□□ -0.47
SSY5P47002 DAL1YIR027C 1383 nt12.12□□□□□ -0.47
SSY5P47002 YJR120WYJR120W 351 nt12.09□□□□□ -0.47
SSY5P47002 FPR4YLR449W 1179 nt12.08□□□□□ -0.48
SSY5P47002 SSA1YAL005C 1929 nt12.01□□□□□ -0.49
SSY5P47002 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
SSY5P47002 PHO4YFR034C 939 nt12.01□□□□□ -0.49
SSY5P47002 INM2YDR287W 879 nt12□□□□□ -0.49
SSY5P47002 RPP2BYDR382W 333 nt11.98□□□□□ -0.49
SSY5P47002 YPS1YLR120C 1710 nt11.96□□□□□ -0.49
SSY5P47002 PST2YDR032C 597 nt11.93□□□□□ -0.5
SSY5P47002 DCW1YKL046C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
SSY5P47002 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.86□□□□□ -0.51
SSY5P47002 TAT1YBR069C 1860 nt11.84□□□□□ -0.51
SSY5P47002 YDR095CYDR095C 411 nt11.81□□□□□ -0.52
SSY5P47002 YBL100CYBL100C 315 nt11.8□□□□□ -0.52
SSY5P47002 EMI2YDR516C 1503 nt11.76□□□□□ -0.53
SSY5P47002 SRB2YHR041C 633 nt11.72□□□□□ -0.53
SSY5P47002 YMR090WYMR090W 684 nt11.72□□□□□ -0.53
SSY5P47002 YBR220CYBR220C 1683 nt11.71□□□□□ -0.54
SSY5P47002 BDH2YAL061W 1254 nt11.66□□□□□ -0.54
SSY5P47002 FUN26YAL022C 1554 nt11.65□□□□□ -0.54
SSY5P47002 YDL221WYDL221W 552 nt11.62□□□□□ -0.55
SSY5P47002 CAC2YML102W 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
SSY5P47002 PTP1YDL230W 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
SSY5P47002 RPP2AYOL039W 321 nt11.59□□□□□ -0.55
SSY5P47002 SDH1YKL148C 1923 nt11.58□□□□□ -0.55
SSY5P47002 ALF1YNL148C 765 nt11.58□□□□□ -0.56
SSY5P47002 WWM1YFL010C 636 nt11.53□□□□□ -0.56
SSY5P47002 TRM9YML014W 840 nt11.53□□□□□ -0.56
SSY5P47002 SHU1YHL006C 453 nt11.5□□□□□ -0.57
SSY5P47002 LSM3YLR438C-A 270 nt11.47□□□□□ -0.57
SSY5P47002 YGR021WYGR021W 873 nt11.44□□□□□ -0.58
SSY5P47002 CCT6YDR188W 1641 nt11.44□□□□□ -0.58
SSY5P47002 SCC4YER147C 1875 nt11.44□□□□□ -0.58
SSY5P47002 SIS1YNL007C 1059 nt11.43□□□□□ -0.58
SSY5P47002 IRC15YPL017C 1500 nt11.43□□□□□ -0.58
SSY5P47002 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.39□□□□□ -0.59
SSY5P47002 YKL097CYKL097C 411 nt11.39□□□□□ -0.59
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