RNA–Protein interactions for RNA: YAL016W

TPD3, Transcript of Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex, yeast

Gene TPD3, Length 1,908 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPD3	YAL016W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	NBP2	Q12163	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	YCK1	P23291	538 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	CDC20	P26309	610 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	SPO22	P40511	975 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
TPD3	YAL016W	ERG5	P54781	538 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	RCO1	Q04779	684 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	ARP9	Q05123	467 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	TMA16	Q08687	178 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	ROX1	P25042	368 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	DSS4	P32601	143 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	ICP55	P40051	511 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	BAP3	P41815	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	IDS2	P46958	469 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	SOD2	P00447	233 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	ALY1	P36117	915 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	RCF1	Q03713	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	CTI6	Q08923	506 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	RTN2	Q12443	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	LAS17	Q12446	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	VCX1	Q99385	411 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	PDX1	P16451	410 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
TPD3	YAL016W	PIG2	P40187	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	YIR042C	P40586	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	VPS4	P52917	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	MRPL22	P53881	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	CRF1	Q04930	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TPD3	YAL016W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	PEP3	P27801	918 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	DBF4	P32325	704 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	YBL029W	P38201	376 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	YBR053C	P38235	358 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	LTP1	P40347	161 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	MUP1	P50276	574 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	YML6	P51998	286 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	YNR061C	P53747	219 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	PSR1	Q07800	427 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	MED7	Q08278	222 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	KAR3	P17119	729 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	URK1	P27515	501 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	SRO77	P38163	1010 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	JHD1	P40034	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	SKP2	P42843	763 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	MPS3	P47069	682 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	SPT20	P50875	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	MEH1	Q02205	184 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	IRC3	Q06683	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	NMD4	Q12129	218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	YCR061W	P25639	631 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	SWC3	P31376	625 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	GEX2	P36173	615 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	MRPL7	P36519	292 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	TDP1	P38319	544 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	FLC2	P39719	783 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	ASE1	P50275	885 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	INN1	P53901	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	IZH3	Q07959	543 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	RCN2	Q12044	265 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	CBS1	P14066	229 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
TPD3	YAL016W	PRP28	P23394	588 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	PRE8	P23639	250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	POL4	P25615	582 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	DPH2	P32461	534 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	ORC2	P32833	620 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	MUM2	P38236	366 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	UBP7	P40453	1071 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	AAD10	P47182	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TPD3	YAL016W	AMA1	P50082	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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