Protein–RNA interactions for Protein: P40347

LTP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, yeastyeast

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTP1P40347 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.9■□□□□ 0.78
LTP1P40347 NOP1YDL014W 984 nt19.55■□□□□ 0.72
LTP1P40347 NSR1YGR159C 1245 nt19.48■□□□□ 0.71
LTP1P40347 YKL036CYKL036C 393 nt18.42■□□□□ 0.54
LTP1P40347 Q0297Q0297 156 nt17.28■□□□□ 0.36
LTP1P40347 YJL027CYJL027C 417 nt17.24■□□□□ 0.35
LTP1P40347 SRX1YKL086W 384 nt17.1■□□□□ 0.33
LTP1P40347 SCS3YGL126W 1143 nt16.97■□□□□ 0.31
LTP1P40347 MDJ1YFL016C 1536 nt16.85■□□□□ 0.29
LTP1P40347 YCR051WYCR051W 669 nt16.19■□□□□ 0.18
LTP1P40347 YOL085CYOL085C 342 nt15.94■□□□□ 0.14
LTP1P40347 SCJ1YMR214W 1134 nt15.6■□□□□ 0.09
LTP1P40347 PKP1YIL042C 1185 nt15.59■□□□□ 0.09
LTP1P40347 RPP1BYDL130W 321 nt15.49■□□□□ 0.07
LTP1P40347 ATS1YAL020C 1002 nt15.31■□□□□ 0.04
LTP1P40347 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.22■□□□□ 0.03
LTP1P40347 DBP2YNL112W 1641 nt15.13■□□□□ 0.01
LTP1P40347 CCC1YLR220W 969 nt14.99□□□□□ -0.01
LTP1P40347 PET122YER153C 765 nt14.72□□□□□ -0.05
LTP1P40347 SCR1SCR1 522 nt14.68□□□□□ -0.06
LTP1P40347 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.52□□□□□ -0.09
LTP1P40347 RRN5YLR141W 1092 nt14.33□□□□□ -0.12
LTP1P40347 YBR190WYBR190W 312 nt14.31□□□□□ -0.12
LTP1P40347 RVS167YDR388W 1449 nt14.29□□□□□ -0.12
LTP1P40347 RSB1YOR049C 1065 nt14.14□□□□□ -0.15
LTP1P40347 PST2YDR032C 597 nt14.12□□□□□ -0.15
LTP1P40347 RTC3YHR087W 336 nt14.12□□□□□ -0.15
LTP1P40347 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.07□□□□□ -0.16
LTP1P40347 YDJ1YNL064C 1230 nt14.07□□□□□ -0.16
LTP1P40347 SHR5YOL110W 714 nt13.91□□□□□ -0.18
LTP1P40347 YKL097CYKL097C 411 nt13.74□□□□□ -0.21
LTP1P40347 GAR1YHR089C 618 nt13.62□□□□□ -0.23
LTP1P40347 SHU1YHL006C 453 nt13.42□□□□□ -0.26
LTP1P40347 DEP1YAL013W 1218 nt13.31□□□□□ -0.28
LTP1P40347 URN1YPR152C 1398 nt13.23□□□□□ -0.29
LTP1P40347 YNL208WYNL208W 600 nt13.21□□□□□ -0.29
LTP1P40347 TIR1YER011W 765 nt13.18□□□□□ -0.3
LTP1P40347 RPN10YHR200W 807 nt13.15□□□□□ -0.3
LTP1P40347 YOR139CYOR139C 393 nt13.14□□□□□ -0.31
LTP1P40347 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.04□□□□□ -0.32
LTP1P40347 OPI9YLR338W 858 nt12.99□□□□□ -0.33
LTP1P40347 SSA1YAL005C 1929 nt12.94□□□□□ -0.34
LTP1P40347 NPL3YDR432W 1245 nt12.91□□□□□ -0.34
LTP1P40347 SRB2YHR041C 633 nt12.79□□□□□ -0.36
LTP1P40347 SAH1YER043C 1350 nt12.76□□□□□ -0.37
LTP1P40347 YGR021WYGR021W 873 nt12.75□□□□□ -0.37
LTP1P40347 Q0182Q0182 405 nt12.75□□□□□ -0.37
LTP1P40347 HOM6YJR139C 1080 nt12.73□□□□□ -0.37
LTP1P40347 MNP1YGL068W 585 nt12.68□□□□□ -0.38
LTP1P40347 YOL037CYOL037C 354 nt12.68□□□□□ -0.38
LTP1P40347 PUT4YOR348C 1884 nt12.68□□□□□ -0.38
LTP1P40347 YJR018WYJR018W 363 nt12.66□□□□□ -0.38
LTP1P40347 WWM1YFL010C 636 nt12.65□□□□□ -0.38
LTP1P40347 PUN1YLR414C 792 nt12.62□□□□□ -0.39
LTP1P40347 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.6□□□□□ -0.39
LTP1P40347 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.6□□□□□ -0.39
LTP1P40347 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.6□□□□□ -0.39
LTP1P40347 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.6□□□□□ -0.39
LTP1P40347 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.6□□□□□ -0.39
LTP1P40347 YJR120WYJR120W 351 nt12.58□□□□□ -0.4
LTP1P40347 ARE1YCR048W 1833 nt12.57□□□□□ -0.4
LTP1P40347 RKM5YLR137W 1104 nt12.52□□□□□ -0.41
LTP1P40347 RPP2BYDR382W 333 nt12.51□□□□□ -0.41
LTP1P40347 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.48□□□□□ -0.41
LTP1P40347 SSA3YBL075C 1950 nt12.46□□□□□ -0.41
LTP1P40347 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.38□□□□□ -0.43
LTP1P40347 PTC2YER089C 1395 nt12.36□□□□□ -0.43
LTP1P40347 BDH2YAL061W 1254 nt12.36□□□□□ -0.43
LTP1P40347 YLR281CYLR281C 468 nt12.35□□□□□ -0.43
LTP1P40347 PUS2YGL063W 1113 nt12.32□□□□□ -0.44
LTP1P40347 LSM3YLR438C-A 270 nt12.3□□□□□ -0.44
LTP1P40347 MOT3YMR070W 1473 nt12.27□□□□□ -0.45
LTP1P40347 POA1YBR022W 534 nt12.26□□□□□ -0.45
LTP1P40347 WHI5YOR083W 888 nt12.23□□□□□ -0.45
LTP1P40347 INM2YDR287W 879 nt12.17□□□□□ -0.46
LTP1P40347 NAB2YGL122C 1578 nt12.17□□□□□ -0.46
LTP1P40347 YBL100CYBL100C 315 nt12.11□□□□□ -0.47
LTP1P40347 DAL1YIR027C 1383 nt12.09□□□□□ -0.47
LTP1P40347 BUD23YCR047C 828 nt12.09□□□□□ -0.47
LTP1P40347 FIS1YIL065C 468 nt12.05□□□□□ -0.48
LTP1P40347 BSC6YOL137W 1494 nt12.05□□□□□ -0.48
LTP1P40347 TRM9YML014W 840 nt12.03□□□□□ -0.48
LTP1P40347 DSK2YMR276W 1122 nt12.02□□□□□ -0.49
LTP1P40347 YPR011CYPR011C 981 nt12.02□□□□□ -0.49
LTP1P40347 FMP45YDL222C 930 nt12.01□□□□□ -0.49
LTP1P40347 IMP2'YIL154C 1041 nt12□□□□□ -0.49
LTP1P40347 MRPL8YJL063C 717 nt11.99□□□□□ -0.49
LTP1P40347 FPR4YLR449W 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
LTP1P40347 FUN26YAL022C 1554 nt11.98□□□□□ -0.49
LTP1P40347 PHO4YFR034C 939 nt11.97□□□□□ -0.49
LTP1P40347 YLR236CYLR236C 324 nt11.97□□□□□ -0.49
LTP1P40347 YCH1YGR203W 447 nt11.94□□□□□ -0.5
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