Protein–RNA interactions for Protein: Q12154

GET3, ATPase GET3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GET3Q12154 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.17■■□□□ 1.3
GET3Q12154 NSR1YGR159C 1245 nt23.04■■□□□ 1.28
GET3Q12154 NOP1YDL014W 984 nt22.43■■□□□ 1.18
GET3Q12154 YKL036CYKL036C 393 nt20.64■□□□□ 0.89
GET3Q12154 MDJ1YFL016C 1536 nt20.63■□□□□ 0.89
GET3Q12154 Q0297Q0297 156 nt19.62■□□□□ 0.73
GET3Q12154 SRX1YKL086W 384 nt19.61■□□□□ 0.73
GET3Q12154 YJL027CYJL027C 417 nt19.27■□□□□ 0.68
GET3Q12154 SCS3YGL126W 1143 nt18.78■□□□□ 0.6
GET3Q12154 YCR051WYCR051W 669 nt18.63■□□□□ 0.57
GET3Q12154 DBP2YNL112W 1641 nt18.2■□□□□ 0.5
GET3Q12154 YOL085CYOL085C 342 nt17.9■□□□□ 0.46
GET3Q12154 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.81■□□□□ 0.44
GET3Q12154 PKP1YIL042C 1185 nt17.68■□□□□ 0.42
GET3Q12154 CCC1YLR220W 969 nt17.65■□□□□ 0.42
GET3Q12154 RPP1BYDL130W 321 nt17.62■□□□□ 0.41
GET3Q12154 YBR190WYBR190W 312 nt17.54■□□□□ 0.4
GET3Q12154 RTC3YHR087W 336 nt17.18■□□□□ 0.34
GET3Q12154 RVS167YDR388W 1449 nt17.04■□□□□ 0.32
GET3Q12154 SCJ1YMR214W 1134 nt17.02■□□□□ 0.32
GET3Q12154 PET122YER153C 765 nt16.89■□□□□ 0.29
GET3Q12154 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.82■□□□□ 0.28
GET3Q12154 ATS1YAL020C 1002 nt16.74■□□□□ 0.27
GET3Q12154 SCR1SCR1 522 nt16.62■□□□□ 0.25
GET3Q12154 SHR5YOL110W 714 nt16.44■□□□□ 0.22
GET3Q12154 RRN5YLR141W 1092 nt16.36■□□□□ 0.21
GET3Q12154 YDJ1YNL064C 1230 nt16.25■□□□□ 0.19
GET3Q12154 URN1YPR152C 1398 nt16.06■□□□□ 0.16
GET3Q12154 DEP1YAL013W 1218 nt16.06■□□□□ 0.16
GET3Q12154 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.05■□□□□ 0.16
GET3Q12154 PUT4YOR348C 1884 nt16.03■□□□□ 0.16
GET3Q12154 RSB1YOR049C 1065 nt16.01■□□□□ 0.15
GET3Q12154 GAR1YHR089C 618 nt15.94■□□□□ 0.14
GET3Q12154 OPI9YLR338W 858 nt15.82■□□□□ 0.12
GET3Q12154 SAH1YER043C 1350 nt15.77■□□□□ 0.12
GET3Q12154 RPN10YHR200W 807 nt15.76■□□□□ 0.11
GET3Q12154 YNL208WYNL208W 600 nt15.74■□□□□ 0.11
GET3Q12154 ARE1YCR048W 1833 nt15.72■□□□□ 0.11
GET3Q12154 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.53■□□□□ 0.08
GET3Q12154 POA1YBR022W 534 nt15.53■□□□□ 0.08
GET3Q12154 PST2YDR032C 597 nt15.52■□□□□ 0.08
GET3Q12154 TIR1YER011W 765 nt15.39■□□□□ 0.05
GET3Q12154 PUN1YLR414C 792 nt15.34■□□□□ 0.05
GET3Q12154 YJR018WYJR018W 363 nt15.29■□□□□ 0.04
GET3Q12154 SSA1YAL005C 1929 nt15.25■□□□□ 0.03
GET3Q12154 BSC6YOL137W 1494 nt15.21■□□□□ 0.03
GET3Q12154 PTC2YER089C 1395 nt15.2■□□□□ 0.02
GET3Q12154 BUD23YCR047C 828 nt15.16■□□□□ 0.02
GET3Q12154 YJR120WYJR120W 351 nt15.1■□□□□ 0.01
GET3Q12154 SSA3YBL075C 1950 nt15.09■□□□□ 0.01
GET3Q12154 SRB2YHR041C 633 nt15.04■□□□□ -0
GET3Q12154 NAB2YGL122C 1578 nt14.98□□□□□ -0.01
GET3Q12154 RPP2BYDR382W 333 nt14.94□□□□□ -0.02
GET3Q12154 SHU1YHL006C 453 nt14.94□□□□□ -0.02
GET3Q12154 YKL097CYKL097C 411 nt14.87□□□□□ -0.03
GET3Q12154 FIS1YIL065C 468 nt14.83□□□□□ -0.04
GET3Q12154 DAL1YIR027C 1383 nt14.79□□□□□ -0.04
GET3Q12154 FPR4YLR449W 1179 nt14.78□□□□□ -0.04
GET3Q12154 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.76□□□□□ -0.05
GET3Q12154 WWM1YFL010C 636 nt14.73□□□□□ -0.05
GET3Q12154 INM2YDR287W 879 nt14.72□□□□□ -0.05
GET3Q12154 PHO4YFR034C 939 nt14.67□□□□□ -0.06
GET3Q12154 BDH2YAL061W 1254 nt14.64□□□□□ -0.07
GET3Q12154 YBL100CYBL100C 315 nt14.62□□□□□ -0.07
GET3Q12154 YGR021WYGR021W 873 nt14.57□□□□□ -0.08
GET3Q12154 HOM6YJR139C 1080 nt14.54□□□□□ -0.08
GET3Q12154 SPT5YML010W 3192 nt14.52□□□□□ -0.09
GET3Q12154 MNP1YGL068W 585 nt14.51□□□□□ -0.09
GET3Q12154 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.45□□□□□ -0.1
GET3Q12154 FUN26YAL022C 1554 nt14.44□□□□□ -0.1
GET3Q12154 LSM3YLR438C-A 270 nt14.41□□□□□ -0.1
GET3Q12154 YPS1YLR120C 1710 nt14.4□□□□□ -0.1
GET3Q12154 TRM9YML014W 840 nt14.37□□□□□ -0.11
GET3Q12154 RKM5YLR137W 1104 nt14.34□□□□□ -0.11
GET3Q12154 YOR139CYOR139C 393 nt14.32□□□□□ -0.12
GET3Q12154 YDR095CYDR095C 411 nt14.3□□□□□ -0.12
GET3Q12154 MEP2YNL142W 1500 nt14.26□□□□□ -0.13
GET3Q12154 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.25□□□□□ -0.13
GET3Q12154 CCT6YDR188W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
GET3Q12154 ALF1YNL148C 765 nt14.24□□□□□ -0.13
GET3Q12154 NPL3YDR432W 1245 nt14.18□□□□□ -0.14
GET3Q12154 YOL037CYOL037C 354 nt14.17□□□□□ -0.14
GET3Q12154 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.1□□□□□ -0.15
GET3Q12154 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.1□□□□□ -0.15
GET3Q12154 DCW1YKL046C 1350 nt14.09□□□□□ -0.15
GET3Q12154 SSA4YER103W 1929 nt14.02□□□□□ -0.16
GET3Q12154 SIS1YNL007C 1059 nt14.02□□□□□ -0.17
GET3Q12154 RPP2AYOL039W 321 nt14.02□□□□□ -0.17
GET3Q12154 PTP1YDL230W 1008 nt14.01□□□□□ -0.17
GET3Q12154 CAC2YML102W 1407 nt13.9□□□□□ -0.18
GET3Q12154 EMI2YDR516C 1503 nt13.87□□□□□ -0.19
GET3Q12154 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms