RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.82□□□□□ -1.16
MEGF6-201ENST00000294599 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.8□□□□□ -1.16
MEGF6-201ENST00000294599 MT1HL1P0DM35 61 aa7.8□□□□□ -1.16
MEGF6-201ENST00000294599 DNHD1Q96M86 4753 aa7.74□□□□□ -1.17
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.73□□□□□ -1.17
MEGF6-201ENST00000294599 ANK2Q01484 3957 aa7.7□□□□□ -1.18
MEGF6-201ENST00000294599 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.67□□□□□ -1.18
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH2Q9P225 4427 aa7.66□□□□□ -1.18
MEGF6-201ENST00000294599 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
MEGF6-201ENST00000294599 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.62□□□□□ -1.19
MEGF6-201ENST00000294599 FAT1Q14517 4588 aa7.62□□□□□ -1.19
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.6□□□□□ -1.19
MEGF6-201ENST00000294599 KMT2AQ03164 3969 aa7.57□□□□□ -1.2
MEGF6-201ENST00000294599 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MEGF6-201ENST00000294599 LYSTQ99698 3801 aa7.5□□□□□ -1.21
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.47□□□□□ -1.21
MEGF6-201ENST00000294599 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.46□□□□□ -1.21
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.46□□□□□ -1.22
MEGF6-201ENST00000294599 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
MEGF6-201ENST00000294599 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.39□□□□□ -1.23
MEGF6-201ENST00000294599 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.38□□□□□ -1.23
MEGF6-201ENST00000294599 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.37□□□□□ -1.23
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.34□□□□□ -1.23
MEGF6-201ENST00000294599 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MEGF6-201ENST00000294599 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.32□□□□□ -1.24
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.3□□□□□ -1.24
MEGF6-201ENST00000294599 MYCBP2O75592 4640 aa7.29□□□□□ -1.24
MEGF6-201ENST00000294599 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.26□□□□□ -1.25
MEGF6-201ENST00000294599 RYR1P21817 5038 aa7.22□□□□□ -1.25
MEGF6-201ENST00000294599 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MEGF6-201ENST00000294599 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.14□□□□□ -1.27
MEGF6-201ENST00000294599 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.11□□□□□ -1.27
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-12P60413 245 aa7.08□□□□□ -1.28
MEGF6-201ENST00000294599 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.06□□□□□ -1.28
MEGF6-201ENST00000294599 RYR3Q15413 4870 aa6.99□□□□□ -1.29
MEGF6-201ENST00000294599 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.98□□□□□ -1.29
MEGF6-201ENST00000294599 INE1O15225 51 aa6.97□□□□□ -1.29
MEGF6-201ENST00000294599 PKHD1P08F94 4074 aa6.97□□□□□ -1.29
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP12-3P60328 96 aa6.97□□□□□ -1.29
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.96□□□□□ -1.3
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.92□□□□□ -1.3
MEGF6-201ENST00000294599 LCE3AQ5TA76 89 aa6.91□□□□□ -1.3
MEGF6-201ENST00000294599 RYR2Q92736 4967 aa6.84□□□□□ -1.31
MEGF6-201ENST00000294599 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.82□□□□□ -1.32
MEGF6-201ENST00000294599 LRP2P98164 4655 aa6.81□□□□□ -1.32
MEGF6-201ENST00000294599 PKD1P98161 4303 aa6.79□□□□□ -1.32
MEGF6-201ENST00000294599 HSPG2P98160 4391 aa6.65□□□□□ -1.34
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.65□□□□□ -1.34
MEGF6-201ENST00000294599 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
MEGF6-201ENST00000294599 MT1HP80294 61 aa6.62□□□□□ -1.35
MEGF6-201ENST00000294599 MT2AP02795 61 aa6.6□□□□□ -1.35
MEGF6-201ENST00000294599 HERC2O95714 4834 aa6.56□□□□□ -1.36
MEGF6-201ENST00000294599 MT1FP04733 61 aa6.53□□□□□ -1.36
MEGF6-201ENST00000294599 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.5□□□□□ -1.37
MEGF6-201ENST00000294599 LPAP08519 4548 aa6.48□□□□□ -1.37
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.44□□□□□ -1.38
MEGF6-201ENST00000294599 TNXBP22105 4242 aa6.43□□□□□ -1.38
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-5P60370 271 aa6.4□□□□□ -1.39
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.4□□□□□ -1.39
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.26□□□□□ -1.41
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.24□□□□□ -1.41
MEGF6-201ENST00000294599 LCE2CQ5TA81 110 aa6.23□□□□□ -1.41
MEGF6-201ENST00000294599 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
MEGF6-201ENST00000294599 MUC17Q685J3 4493 aa6.19□□□□□ -1.42
MEGF6-201ENST00000294599 HERC1Q15751 4861 aa6.18□□□□□ -1.42
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.18□□□□□ -1.42
MEGF6-201ENST00000294599 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.18□□□□□ -1.42
MEGF6-201ENST00000294599 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.17□□□□□ -1.42
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.15□□□□□ -1.43
MEGF6-201ENST00000294599 MT1XP80297 61 aa6.14□□□□□ -1.43
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.14□□□□□ -1.43
MEGF6-201ENST00000294599 MT1BP07438 61 aa6.13□□□□□ -1.43
MEGF6-201ENST00000294599 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.12□□□□□ -1.43
MEGF6-201ENST00000294599 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.09□□□□□ -1.43
MEGF6-201ENST00000294599 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.95□□□□□ -1.46
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.93□□□□□ -1.46
MEGF6-201ENST00000294599 MUC2Q02817 5179 aa5.87□□□□□ -1.47
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.86□□□□□ -1.47
MEGF6-201ENST00000294599 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.83□□□□□ -1.48
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.83□□□□□ -1.48
MEGF6-201ENST00000294599 RNF213Q63HN8 5207 aa5.78□□□□□ -1.48
MEGF6-201ENST00000294599 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.77□□□□□ -1.49
MEGF6-201ENST00000294599 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.77□□□□□ -1.49
MEGF6-201ENST00000294599 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.75□□□□□ -1.49
MEGF6-201ENST00000294599 LCE2BO14633 110 aa5.7□□□□□ -1.5
MEGF6-201ENST00000294599 LCE3BQ5TA77 95 aa5.6□□□□□ -1.51
MEGF6-201ENST00000294599 MT1GP13640 62 aa5.6□□□□□ -1.51
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP12-4P60329 112 aa5.6□□□□□ -1.51
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.58□□□□□ -1.52
MEGF6-201ENST00000294599 MT1LQ93083 61 aa5.46□□□□□ -1.53
MEGF6-201ENST00000294599 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.45□□□□□ -1.54
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR2EP22531 72 aa5.43□□□□□ -1.54
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR2BP35325 72 aa5.43□□□□□ -1.54
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR2AP35326 72 aa5.43□□□□□ -1.54
MEGF6-201ENST00000294599 MT1EP04732 61 aa5.43□□□□□ -1.54
MEGF6-201ENST00000294599 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.1 ms