RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H0YGG7 62 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C5orf42Q9H799 3197 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRP2P98164 4655 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACANP16112 2415 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRBAP50851 2863 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LYNX1G3V0Z9 82 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITPR2Q14571 2701 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP295Q9C0D2 2601 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFCAB5A4FU69 1503 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LPAP08519 4548 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IAPPP10997 89 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NHSQ6T4R5 1651 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPTA1P02549 2419 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRCA2P51587 3418 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MROH1Q8NDA8 1641 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAMA5O15230 3695 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPG2P98160 4391 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKD1P98161 4303 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEFB130BP0DP73 79 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEFB130AP0DP74 79 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HTTP42858 3142 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STARD9Q9P2P6 4700 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KNL1Q8NG31 2342 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAMA1P25391 3075 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC01549A6NIU2 74 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRR2BP35325 72 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP34Q70CQ2 3546 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UTRNP46939 3433 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NF1P21359 2839 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CFAP54Q96N23 3096 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRYLO94915 3013 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP250Q9BV73 2442 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.15□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.38
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTORP42345 2549 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CUBNO60494 3623 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A087WWC5 75 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEFB114Q30KQ6 69 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPEQ02224 2701 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYO15AQ9UKN7 3530 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MGAQ8IWI9 3026 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAH14Q0VDD8 3507 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS13AQ96RL7 3174 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM186AA6NE01 2351 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TACC2O95359 2948 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XIRP2A4UGR9 3374 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATMQ13315 3056 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRYQ5TBA9 3013 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKHD1P08F94 4074 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCC6O95255 1503 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS13CQ709C8 3753 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MUC17Q685J3 4493 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LYSTQ99698 3801 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAT1Q14517 4588 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH23Q9H251 3354 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIOO75962 3097 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 S100ZQ8WXG8 99 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms