RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.13■□□□□ 0.33
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBLN2P98095 1184 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.54□□□□□ -0.72
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 MIER1Q8N108 512 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF39Q9H2S5 420 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.01□□□□□ -0.81
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM41Q8WV44 630 aa9.95□□□□□ -0.82
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.95□□□□□ -0.82
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DSG3P32926 999 aa9.88□□□□□ -0.83
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