RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.93□□□□□ -0.98
TOP3B-206ENST00000436282 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WTM6 91 aa8.92□□□□□ -0.98
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TOP3B-206ENST00000436282 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.91□□□□□ -0.98
TOP3B-206ENST00000436282 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.9□□□□□ -0.98
TOP3B-206ENST00000436282 SPINK7P58062 85 aa8.89□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.89□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087X002 238 aa8.88□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.88□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 RTL8CO15255 209 aa8.87□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 TGP01266 2768 aa8.86□□□□□ -0.99
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TOP3B-206ENST00000436282 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.85□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.85□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 KMT2AQ03164 3969 aa8.85□□□□□ -0.99
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.83□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.82□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.82□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 Q5W150 140 aa8.82□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.82□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.81□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 LY6G6CO95867 125 aa8.79□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF861PO60384 105 aa8.79□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.78□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 ACYP2P14621 99 aa8.78□□□□□ -1
TOP3B-206ENST00000436282 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.77□□□□□ -1.01
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TOP3B-206ENST00000436282 DNHD1Q96M86 4753 aa8.76□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH2Q9P225 4427 aa8.75□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.73□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.72□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.72□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 DMAC1Q96GE9 116 aa8.72□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf87E5RJ46 101 aa8.71□□□□□ -1.01
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3B-206ENST00000436282 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3B-206ENST00000436282 FBN3Q75N90 2809 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3B-206ENST00000436282 FAM229AH3BQW9 127 aa8.65□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-2P60368 255 aa8.65□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV7-43P04211 117 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GU69 56 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00313P59037 77 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2-30P06310 120 aa8.61□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.6□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.59□□□□□ -1.03
TOP3B-206ENST00000436282 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.58□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 PRAC1Q96KF2 57 aa8.56□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.55□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 UQCR11O14957 56 aa8.52□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-1P60331 282 aa8.52□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.52□□□□□ -1.04
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3B-206ENST00000436282 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZSA8 131 aa8.43□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01554Q52M75 96 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3B-206ENST00000436282 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3B-206ENST00000436282 PKD1P98161 4303 aa8.37□□□□□ -1.07
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3B-206ENST00000436282 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.33□□□□□ -1.08
TOP3B-206ENST00000436282 SPINK1P00995 79 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3B-206ENST00000436282 CSAG1Q6PB30 78 aa8.29□□□□□ -1.08
TOP3B-206ENST00000436282 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.28□□□□□ -1.08
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N1X5 172 aa8.27□□□□□ -1.09
TOP3B-206ENST00000436282 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TOP3B-206ENST00000436282 PKHD1P08F94 4074 aa8.25□□□□□ -1.09
TOP3B-206ENST00000436282 H3BS24 57 aa8.2□□□□□ -1.1
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.19□□□□□ -1.1
TOP3B-206ENST00000436282 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.18□□□□□ -1.1
TOP3B-206ENST00000436282 H0YAA0 97 aa8.17□□□□□ -1.1
TOP3B-206ENST00000436282 A8MUU9 505 aa8.15□□□□□ -1.1
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.15□□□□□ -1.1
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TOP3B-206ENST00000436282 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TOP3B-206ENST00000436282 FAT1Q14517 4588 aa8.1□□□□□ -1.11
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GU33 70 aa8.09□□□□□ -1.11
TOP3B-206ENST00000436282 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.06□□□□□ -1.12
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.05□□□□□ -1.12
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GVY2 172 aa8.04□□□□□ -1.12
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.04□□□□□ -1.12
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf92A6NGG3 77 aa8.04□□□□□ -1.12
TOP3B-206ENST00000436282 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.04□□□□□ -1.12
TOP3B-206ENST00000436282 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TOP3B-206ENST00000436282 K7ERS5 55 aa7.92□□□□□ -1.14
TOP3B-206ENST00000436282 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TOP3B-206ENST00000436282 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.89□□□□□ -1.15
TOP3B-206ENST00000436282 ROMO1P60602 79 aa7.89□□□□□ -1.15
TOP3B-206ENST00000436282 RYR2Q92736 4967 aa7.88□□□□□ -1.15
TOP3B-206ENST00000436282 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TOP3B-206ENST00000436282 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.85□□□□□ -1.15
TOP3B-206ENST00000436282 CRIPTQ9P021 101 aa7.81□□□□□ -1.16
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