Protein–RNA interactions for Protein: Q6YFQ2

COX6B2, Cytochrome c oxidase subunit 6B2, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B2Q6YFQ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COX6B2Q6YFQ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX6B2Q6YFQ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX6B2Q6YFQ2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX6B2Q6YFQ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX6B2Q6YFQ2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6B2Q6YFQ2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6B2Q6YFQ2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX6B2Q6YFQ2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX6B2Q6YFQ2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX6B2Q6YFQ2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COX6B2Q6YFQ2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COX6B2Q6YFQ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COX6B2Q6YFQ2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COX6B2Q6YFQ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX6B2Q6YFQ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COX6B2Q6YFQ2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COX6B2Q6YFQ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX6B2Q6YFQ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX6B2Q6YFQ2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COX6B2Q6YFQ2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6B2Q6YFQ2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6B2Q6YFQ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6B2Q6YFQ2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6B2Q6YFQ2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX6B2Q6YFQ2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COX6B2Q6YFQ2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX6B2Q6YFQ2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COX6B2Q6YFQ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX6B2Q6YFQ2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX6B2Q6YFQ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX6B2Q6YFQ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX6B2Q6YFQ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6B2Q6YFQ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6B2Q6YFQ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6B2Q6YFQ2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6B2Q6YFQ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6B2Q6YFQ2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6B2Q6YFQ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6B2Q6YFQ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6B2Q6YFQ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6B2Q6YFQ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6B2Q6YFQ2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6B2Q6YFQ2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6B2Q6YFQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6B2Q6YFQ2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6B2Q6YFQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6B2Q6YFQ2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6B2Q6YFQ2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6B2Q6YFQ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6B2Q6YFQ2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6B2Q6YFQ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6B2Q6YFQ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6B2Q6YFQ2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6B2Q6YFQ2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6B2Q6YFQ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6B2Q6YFQ2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COX6B2Q6YFQ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX6B2Q6YFQ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX6B2Q6YFQ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6B2Q6YFQ2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6B2Q6YFQ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6B2Q6YFQ2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6B2Q6YFQ2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6B2Q6YFQ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6B2Q6YFQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6B2Q6YFQ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6B2Q6YFQ2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6B2Q6YFQ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6B2Q6YFQ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6B2Q6YFQ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6B2Q6YFQ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6B2Q6YFQ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6B2Q6YFQ2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B2Q6YFQ2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6B2Q6YFQ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6B2Q6YFQ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6B2Q6YFQ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6B2Q6YFQ2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B2Q6YFQ2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B2Q6YFQ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B2Q6YFQ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B2Q6YFQ2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6B2Q6YFQ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6B2Q6YFQ2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms