RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	PRR15L	Q9BU68	103 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	FLNC	Q14315	2725 aa		1.02	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	KIF21B	O75037	1637 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	MADD	Q8WXG6	1647 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	MRC1	P22897	1456 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	COL6A5	A8TX70	2615 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334		M0R143	59 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CCL18	P55774	89 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	KRTDAP	P60985	99 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPAG11B	Q08648	103 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TSLP	Q969D9	159 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ABCA4	P78363	2273 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPTB	P11277	2137 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CIT	O14578	2027 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PARP14	Q460N5	1801 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		1.01	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CUX1	P39880	1505 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ESPL1	Q14674	2120 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334		A0A096LNT2	108 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	GCHFR	P30047	84 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334		Q96NJ1	140 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	RELN	P78509	3460 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CHD1	O14646	1710 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	VWF	P04275	2813 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	DNHD1	Q96M86	4753 aa		1	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CPS1	P31327	1500 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ZFHX3	Q15911	3703 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	POLQ	O75417	2590 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SHROOM2	Q13796	1616 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	LAMA4	Q16363	1823 aa		0.99	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SPG11	Q96JI7	2443 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ATR	Q13535	2644 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	APOC3	P02656	99 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	LINC00032	P0C843	101 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	ACACB	O00763	2458 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PATJ	Q8NI35	1801 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		0.98	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CDH23	Q9H251	3354 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	LAMA3	Q16787	3333 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	FRY	Q5TBA9	3013 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334		M0R135	149 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	HMGN4	O00479	90 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	COX6C	P09669	75 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PKIA	P61925	76 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334		Q0VG73	95 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	COX17	Q14061	63 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CEP290	O15078	2479 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CEP250	Q9BV73	2442 aa		0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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