RNA–Protein interactions for RNA: YOL087C

DUF1, Transcript of Ubiquitin-binding protein of unknown function, yeast

Gene DUF1, Length 3,351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUF1	YOL087C	DMA2	P53924	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DUF1	YOL087C	AIM44	Q99299	758 aa		4.35	□□□□□ -1.71
DUF1	YOL087C	GUT1	P32190	709 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DUF1	YOL087C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
DUF1	YOL087C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
DUF1	YOL087C	ATH1	P48016	1211 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DUF1	YOL087C	GYP5	Q12344	894 aa		4.34	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	DIT2	P21595	489 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	IES2	P40154	320 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	YGR273C	P53329	174 aa		4.33	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	GTT3	P39996	337 aa		4.32	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.32	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	DCW1	P36091	449 aa		4.32	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	COX6	P00427	148 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	WSC3	Q12215	556 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	MAM3	Q12296	706 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.3	□□□□□ -1.72	not detected
DUF1	YOL087C	KEX1	P09620	729 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	GLC3	P32775	704 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	RLF2	Q12495	606 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	VNX1	P42839	908 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DUF1	YOL087C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	HTA2	P04912	132 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	YEL023C	P39992	682 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	MSB4	Q12317	492 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	KIN1	P13185	1064 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	MPH3	P0CE00	602 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	AI4	P03878	556 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	RAD54	P32863	898 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	ORC6	P38826	435 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	SLI15	P38283	698 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	IOC2	Q12072	812 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	DAN4	P47179	1161 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	AIM7	Q12156	149 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DUF1	YOL087C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	ULI1	P43604	169 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	PTC4	P38089	393 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	SPP1	Q03012	353 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	MID1	P41821	548 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	CDC73	Q06697	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	KIC1	P38692	1080 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	TOP1	P04786	769 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	RGR1	P19263	1082 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	LDB19	Q12502	818 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	ATF2	P53296	535 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	PML39	Q03760	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	JIP4	Q03361	876 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DUF1	YOL087C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	UBP9	P39967	754 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	MPC54	Q08550	464 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	RTG1	P32607	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	NIS1	P53939	407 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	YML020W	Q03722	664 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	PKC1	P24583	1151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	TEA1	P47988	759 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	TFB3	Q03290	321 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	PEX29	Q03370	554 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	SCJ1	P25303	377 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	SEC61	P32915	480 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	FKH1	P40466	484 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	DPL1	Q05567	589 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	CSC1	Q06538	782 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DUF1	YOL087C	CSN12	P47130	423 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	FPK1	P53739	893 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	NMA111	P53920	997 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	HPC2	Q01448	625 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	PDR1	P12383	1068 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	YRR1	Q12172	810 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	NCR1	Q12200	1170 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	TFB4	Q12004	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	ATG36	P46983	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	SIT4	P20604	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	ERF2	Q06551	359 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	ESS1	P22696	170 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	YJU3	P28321	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	SAP30	P38429	201 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	SWE1	P32944	819 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DUF1	YOL087C	HST2	P53686	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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